MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sulfolobus islandicus Y.G.57.14 chromosome

Total Repeats: 8927

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_012622	TTAT	2	8	956413	956420	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_012622	AT	3	6	956419	956424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_012622	A	6	6	956440	956445	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_012622	TGA	2	6	956455	956460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_012622	GTAT	2	8	957888	957895	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_012622	TAAAA	2	10	958002	958011	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_012622	A	6	6	960204	960209	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_012622	ATT	2	6	960231	960236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_012622	TTC	2	6	960758	960763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4010	NC_012622	TTTG	2	8	960768	960775	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_012622	TTC	2	6	960786	960791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4012	NC_012622	ATAA	2	8	960830	960837	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_012622	TAAA	2	8	960916	960923	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_012622	TAA	2	6	960938	960943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_012622	TCTAA	2	10	960954	960963	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4016	NC_012622	GTATG	2	10	960977	960986	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_012622	AGAT	2	8	961014	961021	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_012622	GAA	2	6	961050	961055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_012622	A	6	6	961082	961087	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_012622	TTA	2	6	961105	961110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_012622	ACT	2	6	961115	961120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4022	NC_012622	GT	3	6	961128	961133	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_012622	ATA	2	6	961138	961143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_012622	TTC	2	6	961160	961165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4025	NC_012622	AATG	2	8	961324	961331	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_012622	ATT	2	6	961419	961424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_012622	GA	3	6	961436	961441	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_012622	TTA	2	6	961531	961536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_012622	CAA	2	6	961573	961578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4030	NC_012622	CAA	3	9	961604	961612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4031	NC_012622	ATC	2	6	961623	961628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4032	NC_012622	AAAT	2	8	961655	961662	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_012622	TTC	2	6	961689	961694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4034	NC_012622	AT	3	6	961698	961703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_012622	ATA	2	6	961745	961750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_012622	TGAA	2	8	961768	961775	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_012622	ATT	2	6	961776	961781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_012622	TTG	2	6	961792	961797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_012622	TGT	2	6	961855	961860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_012622	AAG	2	6	961864	961869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_012622	TAAG	2	8	961884	961891	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_012622	TAA	3	9	962073	962081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_012622	AAT	2	6	962096	962101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_012622	TTA	2	6	962194	962199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_012622	ATA	2	6	962223	962228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_012622	TAA	2	6	962235	962240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_012622	TTA	2	6	963005	963010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_012622	TCA	2	6	963066	963071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4049	NC_012622	AAGT	2	8	963107	963114	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_012622	CAC	2	6	963155	963160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4051	NC_012622	TTAG	2	8	963262	963269	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_012622	TCA	2	6	963300	963305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4053	NC_012622	TAGG	2	8	963322	963329	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_012622	TAA	2	6	963625	963630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_012622	AATT	2	8	963642	963649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_012622	AT	3	6	963674	963679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_012622	A	6	6	963687	963692	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_012622	TA	3	6	963693	963698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_012622	T	6	6	965301	965306	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_012622	AGA	2	6	965329	965334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_012622	TAT	2	6	965402	965407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_012622	ACT	2	6	968293	968298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4063	NC_012622	CCT	2	6	968302	968307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4064	NC_012622	A	6	6	968339	968344	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_012622	GT	4	8	968360	968367	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_012622	CAGC	2	8	968421	968428	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4067	NC_012622	TA	3	6	968553	968558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_012622	TTA	2	6	968562	968567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_012622	CTC	2	6	968586	968591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4070	NC_012622	AGG	2	6	968742	968747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_012622	AT	3	6	968779	968784	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_012622	TAA	2	6	968797	968802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_012622	ACA	2	6	969087	969092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4074	NC_012622	ATT	2	6	969148	969153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_012622	TTA	2	6	969812	969817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_012622	AAATG	2	10	970669	970678	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_012622	TAA	2	6	970705	970710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_012622	GGGT	2	8	970961	970968	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_012622	TAA	4	12	971030	971041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_012622	CTTAT	2	10	971046	971055	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4081	NC_012622	TGT	2	6	971134	971139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_012622	TTA	2	6	971144	971149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_012622	AT	3	6	971273	971278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_012622	ATA	2	6	972434	972439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_012622	A	6	6	972449	972454	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_012622	TA	3	6	972472	972477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_012622	TA	3	6	972543	972548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_012622	TCA	2	6	972564	972569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4089	NC_012622	T	6	6	974006	974011	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_012622	T	6	6	974022	974027	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_012622	TTACG	2	10	974033	974042	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4092	NC_012622	TAA	2	6	974071	974076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_012622	CTT	2	6	974666	974671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4094	NC_012622	AG	3	6	974697	974702	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_012622	TC	3	6	974703	974708	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4096	NC_012622	TAT	2	6	974712	974717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_012622	AAT	2	6	974738	974743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_012622	TGT	2	6	975841	975846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_012622	TAT	2	6	978110	978115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_012622	GAG	2	6	978121	978126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_012622	A	6	6	978132	978137	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_012622	TAA	2	6	983262	983267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_012622	ATTA	2	8	983310	983317	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_012622	ATT	2	6	983327	983332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_012622	AAAT	2	8	983375	983382	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_012622	TAAG	2	8	983386	983393	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_012622	TCT	2	6	989731	989736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4108	NC_012622	TAG	2	6	989778	989783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_012622	AT	3	6	989816	989821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_012622	TAA	2	6	989838	989843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_012622	ATG	2	6	991329	991334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_012622	AG	3	6	991405	991410	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_012622	TA	3	6	991449	991454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_012622	T	6	6	991464	991469	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_012622	TAATAC	2	12	991643	991654	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4116	NC_012622	CCTT	2	8	991711	991718	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4117	NC_012622	A	6	6	991782	991787	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_012622	ATC	2	6	991812	991817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4119	NC_012622	CTA	2	6	991819	991824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4120	NC_012622	TCA	2	6	992794	992799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4121	NC_012622	ATA	2	6	992824	992829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_012622	AAG	2	6	992929	992934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_012622	TCC	2	6	992935	992940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4124	NC_012622	TTA	2	6	992962	992967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_012622	TAA	2	6	993015	993020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_012622	TA	3	6	993044	993049	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_012622	A	6	6	993062	993067	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_012622	TAG	2	6	994475	994480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_012622	TAAC	2	8	994533	994540	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4130	NC_012622	TAT	2	6	994549	994554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_012622	TAGTA	2	10	994646	994655	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_012622	TAA	2	6	996807	996812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_012622	TAC	2	6	996823	996828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4134	NC_012622	AAAC	2	8	996868	996875	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4135	NC_012622	TTA	2	6	996934	996939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4136	NC_012622	TCAT	2	8	997000	997007	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4137	NC_012622	A	6	6	998570	998575	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4138	NC_012622	TAAAA	2	10	998586	998595	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4407	NC_012622	TGA	2	6	1104925	1104930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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