MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sulfolobus islandicus Y.G.57.14 chromosome

Total Repeats: 8927

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_012622	CTA	2	6	2389934	2389939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8002	NC_012622	TACT	2	8	2389948	2389955	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8003	NC_012622	TAT	2	6	2389988	2389993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8004	NC_012622	TAA	3	9	2390006	2390014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8005	NC_012622	AT	3	6	2390071	2390076	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8006	NC_012622	AAGA	2	8	2390079	2390086	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8007	NC_012622	TA	3	6	2390115	2390120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8008	NC_012622	T	6	6	2390218	2390223	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8009	NC_012622	A	7	7	2390535	2390541	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8010	NC_012622	TATT	3	12	2390542	2390553	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8011	NC_012622	AT	3	6	2390582	2390587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8012	NC_012622	CTT	2	6	2391139	2391144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8013	NC_012622	TA	3	6	2391163	2391168	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8014	NC_012622	CCT	2	6	2391258	2391263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8015	NC_012622	TAA	2	6	2391375	2391380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8016	NC_012622	TCA	2	6	2391408	2391413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8017	NC_012622	AGT	2	6	2391422	2391427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8018	NC_012622	TAT	2	6	2391509	2391514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8019	NC_012622	CCAT	2	8	2392395	2392402	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8020	NC_012622	AT	3	6	2392401	2392406	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8021	NC_012622	AAT	2	6	2392408	2392413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8022	NC_012622	TGAAA	2	10	2392452	2392461	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8023	NC_012622	TA	3	6	2392496	2392501	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8024	NC_012622	TACC	2	8	2392522	2392529	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8025	NC_012622	ACTAG	2	10	2392626	2392635	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
8026	NC_012622	AAC	2	6	2392666	2392671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8027	NC_012622	AAACG	2	10	2392678	2392687	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
8028	NC_012622	CTT	2	6	2393775	2393780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8029	NC_012622	TAA	2	6	2395344	2395349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8030	NC_012622	T	6	6	2395351	2395356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8031	NC_012622	GT	3	6	2395376	2395381	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8032	NC_012622	TTA	2	6	2395393	2395398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8033	NC_012622	A	6	6	2395423	2395428	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8034	NC_012622	TAA	2	6	2395480	2395485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8035	NC_012622	TAA	2	6	2395496	2395501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8036	NC_012622	TA	3	6	2395515	2395520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8037	NC_012622	TC	3	6	2395544	2395549	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8038	NC_012622	CAC	2	6	2395907	2395912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8039	NC_012622	TTA	2	6	2395977	2395982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8040	NC_012622	TAAA	2	8	2396042	2396049	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8041	NC_012622	CAAT	2	8	2396058	2396065	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8042	NC_012622	TAT	2	6	2396264	2396269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8043	NC_012622	CTC	2	6	2396439	2396444	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8044	NC_012622	AAT	2	6	2396466	2396471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8045	NC_012622	AT	3	6	2396482	2396487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8046	NC_012622	ATA	2	6	2396498	2396503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8047	NC_012622	TTC	2	6	2396551	2396556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8048	NC_012622	GC	3	6	2396621	2396626	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8049	NC_012622	TTAT	2	8	2396649	2396656	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8050	NC_012622	A	6	6	2396772	2396777	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8051	NC_012622	AGTTTA	2	12	2397156	2397167	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8052	NC_012622	A	6	6	2397169	2397174	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8053	NC_012622	TTC	2	6	2397184	2397189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8054	NC_012622	TA	3	6	2397201	2397206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8055	NC_012622	AT	4	8	2397222	2397229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8056	NC_012622	T	6	6	2398277	2398282	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8057	NC_012622	AT	3	6	2398840	2398845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8058	NC_012622	TAA	3	9	2398849	2398857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8059	NC_012622	T	6	6	2398872	2398877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8060	NC_012622	AAC	2	6	2398933	2398938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8061	NC_012622	AAG	2	6	2398946	2398951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8062	NC_012622	T	6	6	2398974	2398979	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8063	NC_012622	AGT	2	6	2399012	2399017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8064	NC_012622	TTTTAA	2	12	2401621	2401632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8065	NC_012622	CAT	2	6	2402531	2402536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8066	NC_012622	TCC	2	6	2402542	2402547	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8067	NC_012622	CCCT	2	8	2402583	2402590	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
8068	NC_012622	TCA	2	6	2402705	2402710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8069	NC_012622	AAT	2	6	2402781	2402786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8070	NC_012622	ACT	2	6	2402795	2402800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8071	NC_012622	AGA	2	6	2402811	2402816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8072	NC_012622	GAG	2	6	2402827	2402832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8073	NC_012622	A	6	6	2402840	2402845	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8074	NC_012622	GAT	2	6	2402856	2402861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8075	NC_012622	TTAT	2	8	2403160	2403167	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8076	NC_012622	TAA	2	6	2403170	2403175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8077	NC_012622	TAAA	2	8	2403214	2403221	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8078	NC_012622	CTT	2	6	2403223	2403228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8079	NC_012622	AC	3	6	2403563	2403568	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8080	NC_012622	A	6	6	2406211	2406216	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8081	NC_012622	ATT	2	6	2406319	2406324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8082	NC_012622	AT	4	8	2406334	2406341	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8083	NC_012622	TAA	2	6	2406342	2406347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8084	NC_012622	AGT	2	6	2406375	2406380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8085	NC_012622	TAT	2	6	2406381	2406386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8086	NC_012622	A	6	6	2406388	2406393	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8087	NC_012622	TTA	2	6	2406422	2406427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8088	NC_012622	AG	3	6	2406473	2406478	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8089	NC_012622	A	6	6	2406576	2406581	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8090	NC_012622	AGG	2	6	2406599	2406604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8091	NC_012622	ATA	2	6	2406651	2406656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8092	NC_012622	TAAA	2	8	2406689	2406696	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8093	NC_012622	AAT	2	6	2406714	2406719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8094	NC_012622	AT	3	6	2406730	2406735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8095	NC_012622	AAG	2	6	2406737	2406742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8096	NC_012622	ATA	2	6	2406799	2406804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8097	NC_012622	TTAA	2	8	2406813	2406820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8098	NC_012622	TGCT	2	8	2406832	2406839	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8099	NC_012622	GA	3	6	2406866	2406871	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8100	NC_012622	TAA	2	6	2406910	2406915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8101	NC_012622	CCA	2	6	2407021	2407026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8102	NC_012622	TC	3	6	2407043	2407048	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8103	NC_012622	TTC	2	6	2407162	2407167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8104	NC_012622	AGA	2	6	2407198	2407203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8105	NC_012622	CT	3	6	2407309	2407314	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8106	NC_012622	TCTA	2	8	2407321	2407328	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8107	NC_012622	AAC	2	6	2407363	2407368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8108	NC_012622	CAA	2	6	2407395	2407400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8109	NC_012622	TCC	2	6	2407427	2407432	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8110	NC_012622	GGAA	2	8	2407445	2407452	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8111	NC_012622	TGA	2	6	2407534	2407539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8112	NC_012622	ATC	2	6	2407578	2407583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8113	NC_012622	ACA	2	6	2407591	2407596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8114	NC_012622	CCT	2	6	2407709	2407714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8115	NC_012622	TCC	2	6	2407718	2407723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8116	NC_012622	TAGC	2	8	2407819	2407826	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8117	NC_012622	TA	3	6	2407853	2407858	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8118	NC_012622	ATT	2	6	2407884	2407889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8119	NC_012622	CTC	2	6	2407959	2407964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8120	NC_012622	CTC	2	6	2407983	2407988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8121	NC_012622	TTA	2	6	2408077	2408082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8122	NC_012622	AGG	2	6	2408092	2408097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8123	NC_012622	AG	3	6	2408103	2408108	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8124	NC_012622	CCT	2	6	2408148	2408153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8125	NC_012622	A	6	6	2408171	2408176	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8126	NC_012622	G	6	6	2408195	2408200	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8127	NC_012622	ATCC	2	8	2408203	2408210	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8128	NC_012622	TAT	2	6	2408239	2408244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8129	NC_012622	AAT	2	6	2408249	2408254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8130	NC_012622	AAT	2	6	2408263	2408268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8131	NC_012622	GATA	2	8	2408279	2408286	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8132	NC_012622	GAA	2	6	2408319	2408324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8134	NC_012622	TA	3	6	2409467	2409472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8267	NC_012622	GA	3	6	2441447	2441452	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8268	NC_012622	T	6	6	2441541	2441546	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8269	NC_012622	GAA	2	6	2441658	2441663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8270	NC_012622	CTTAT	2	10	2441685	2441694	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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8274	NC_012622	CTATC	2	10	2441839	2441848	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
8275	NC_012622	TTTTAT	2	12	2441876	2441887	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8276	NC_012622	TGA	2	6	2441990	2441995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8280	NC_012622	TCA	2	6	2442092	2442097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8282	NC_012622	TA	3	6	2442153	2442158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8283	NC_012622	TCT	2	6	2442224	2442229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8284	NC_012622	ATT	2	6	2442241	2442246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8285	NC_012622	TAT	2	6	2442340	2442345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8287	NC_012622	CT	3	6	2442365	2442370	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8288	NC_012622	TTTCC	2	10	2442387	2442396	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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8301	NC_012622	TAA	2	6	2443548	2443553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8320	NC_012622	TAA	2	6	2452964	2452969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8325	NC_012622	TA	3	6	2460041	2460046	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8326	NC_012622	ATC	2	6	2460065	2460070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8328	NC_012622	A	6	6	2460093	2460098	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8332	NC_012622	TAGT	2	8	2468689	2468696	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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8354	NC_012622	TA	4	8	2479786	2479793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8400	NC_012622	TAA	2	6	2500758	2500763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8401	NC_012622	AGGTA	2	10	2500870	2500879	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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