MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sulfolobus islandicus L.S.2.15 chromosome

Total Repeats: 10641

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012589	CAT	2	6	24	29	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_012589	TAT	2	6	30	35	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012589	CCT	2	6	47	52	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_012589	TC	3	6	61	66	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_012589	TTTC	2	8	134	141	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_012589	GT	3	6	179	184	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012589	ATT	2	6	290	295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012589	GTCAC	2	10	357	366	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
9	NC_012589	ATT	2	6	383	388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012589	TAA	2	6	433	438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012589	T	8	8	444	451	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012589	TAAA	2	8	2366	2373	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012589	TA	5	10	2382	2391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012589	T	6	6	3248	3253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012589	T	6	6	3272	3277	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012589	TAT	2	6	4871	4876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012589	TACAAA	2	12	5740	5751	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_012589	TAT	2	6	5837	5842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012589	AAG	2	6	5875	5880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012589	TTAAA	2	10	5881	5890	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012589	ACA	2	6	5894	5899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_012589	ATT	2	6	6050	6055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012589	GAA	2	6	6092	6097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012589	ATGTT	2	10	6110	6119	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012589	TGTGA	2	10	6144	6153	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012589	GA	3	6	6162	6167	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012589	ATC	2	6	6186	6191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_012589	GTTC	2	8	6200	6207	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_012589	TCA	2	6	6209	6214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_012589	T	6	6	7692	7697	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012589	TA	3	6	7712	7717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012589	TA	3	6	9054	9059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012589	GTA	2	6	9067	9072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012589	CATC	2	8	9901	9908	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_012589	ATT	2	6	16337	16342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012589	TGGTAT	2	12	17805	17816	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012589	TAA	2	6	17842	17847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012589	TAT	2	6	17904	17909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012589	CAT	2	6	17930	17935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_012589	GGTT	2	8	17950	17957	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012589	CATA	2	8	17962	17969	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_012589	ATT	2	6	17976	17981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012589	TAT	2	6	17991	17996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012589	GAT	2	6	24560	24565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012589	TGA	2	6	24589	24594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012589	GAT	2	6	24613	24618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012589	TAGA	2	8	24633	24640	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012589	ATA	2	6	24661	24666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012589	CA	3	6	26324	26329	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_012589	AT	3	6	26330	26335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012589	TAA	2	6	27067	27072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012589	TAATAC	2	12	27112	27123	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_012589	AAAAT	2	10	27149	27158	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012589	ATAA	2	8	28219	28226	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012589	TA	3	6	28234	28239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012589	TAT	2	6	28262	28267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012589	TTA	2	6	31430	31435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012589	AGA	2	6	31462	31467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012589	AT	3	6	32697	32702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012589	CTTTTC	2	12	32722	32733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_012589	ATC	2	6	32776	32781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_012589	ACA	2	6	32786	32791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_012589	TAA	2	6	34212	34217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012589	TAC	2	6	34248	34253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_012589	GGT	2	6	34263	34268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012589	T	6	6	35280	35285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012589	ACT	2	6	36975	36980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_012589	TATTTA	2	12	38250	38261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012589	A	6	6	38288	38293	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012589	AT	4	8	38491	38498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012589	ATTT	2	8	38505	38512	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012589	AAAT	2	8	38516	38523	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012589	AT	3	6	38525	38530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012589	AAAT	2	8	38581	38588	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012589	AT	3	6	38587	38592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012589	GAT	2	6	38613	38618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012589	CTG	2	6	38654	38659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_012589	ATT	2	6	38685	38690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012589	TTC	2	6	38711	38716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_012589	GGT	2	6	38726	38731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012589	TAA	2	6	38777	38782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012589	TAA	2	6	38871	38876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012589	ATT	2	6	38984	38989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012589	AATA	2	8	38991	38998	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012589	TGGTG	2	10	39031	39040	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012589	AT	3	6	40788	40793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012589	TA	4	8	42462	42469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012589	GTT	2	6	44732	44737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012589	TTA	2	6	44751	44756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012589	ATC	2	6	44771	44776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_012589	TAGC	2	8	45773	45780	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_012589	TAA	2	6	45870	45875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012589	GTT	2	6	45883	45888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012589	TGA	2	6	45940	45945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012589	T	7	7	45953	45959	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012589	TCT	2	6	45973	45978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_012589	TC	3	6	48108	48113	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_012589	TCTAGT	2	12	48120	48131	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_012589	ATA	2	6	48141	48146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012589	TCAA	2	8	48192	48199	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_012589	TTA	2	6	48217	48222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012589	AGA	2	6	48229	48234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012589	TAT	2	6	48253	48258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012589	TAT	2	6	49681	49686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012589	ATA	2	6	49687	49692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012589	T	7	7	50848	50854	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012589	TTC	2	6	50869	50874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_012589	T	6	6	50894	50899	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012589	TTG	2	6	50911	50916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012589	AAGT	2	8	50986	50993	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012589	CAA	2	6	51026	51031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_012589	TTAT	2	8	51062	51069	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012589	ATCT	2	8	51077	51084	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_012589	AGA	2	6	58211	58216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012589	AACA	2	8	58809	58816	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_012589	CA	3	6	58889	58894	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_012589	TAA	2	6	58895	58900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012589	GAA	2	6	58931	58936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012589	TCC	2	6	58962	58967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_012589	TGA	2	6	58983	58988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012589	ATG	2	6	59008	59013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012589	T	7	7	59047	59053	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012589	TAATT	2	10	61015	61024	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012589	CTT	2	6	61067	61072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_012589	GTTT	2	8	65368	65375	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012589	TAT	2	6	65386	65391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012589	A	6	6	65441	65446	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012589	ATT	2	6	65470	65475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012589	TTG	2	6	68094	68099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012589	TAA	2	6	68140	68145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012589	TCAT	2	8	68160	68167	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_012589	AAT	2	6	68206	68211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012589	TAG	2	6	68232	68237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012589	ACT	2	6	68855	68860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_012589	TCTA	2	8	68888	68895	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_012589	A	6	6	68895	68900	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012589	TTC	2	6	68927	68932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_012589	TAA	2	6	68971	68976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012589	TAA	2	6	69019	69024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012589	TAT	2	6	69025	69030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012589	AT	4	8	69046	69053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_012589	TTC	2	6	69615	69620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_012589	CAT	3	9	69641	69649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_012589	TA	3	6	70172	70177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_012589	TA	3	6	70215	70220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_012589	CT	3	6	71534	71539	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_012589	TAT	2	6	71590	71595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_012589	AAC	2	6	72026	72031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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278	NC_012589	AT	3	6	115875	115880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
279	NC_012589	GTA	2	6	115881	115886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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281	NC_012589	ATT	2	6	115897	115902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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283	NC_012589	TAA	2	6	116008	116013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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287	NC_012589	TAGA	2	8	119036	119043	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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429	NC_012589	CTT	2	6	189362	189367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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452	NC_012589	TA	3	6	204092	204097	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
453	NC_012589	ATTT	2	8	205191	205198	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
454	NC_012589	GTT	2	6	205200	205205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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464	NC_012589	AAT	2	6	214381	214386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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470	NC_012589	AT	3	6	220556	220561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
471	NC_012589	TAT	3	9	220559	220567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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