MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sinorhizobium fredii NGR234 plasmid pNGR234b

Total Repeats: 6137

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012586	TTG	2	6	21	26	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012586	GCC	2	6	27	32	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_012586	TAA	2	6	33	38	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012586	GCC	2	6	64	69	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_012586	GC	3	6	70	75	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_012586	GCC	2	6	121	126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_012586	GCT	2	6	205	210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_012586	TC	3	6	2499	2504	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_012586	CGT	2	6	2557	2562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_012586	GAA	2	6	2598	2603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012586	TCCC	2	8	3932	3939	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
12	NC_012586	ACT	2	6	4027	4032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_012586	AGCG	2	8	4040	4047	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_012586	ACC	2	6	4104	4109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_012586	A	6	6	5394	5399	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012586	TCC	2	6	6674	6679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_012586	TGA	2	6	6696	6701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012586	CCG	2	6	6755	6760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_012586	GC	3	6	6835	6840	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_012586	TCG	2	6	6845	6850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_012586	CTG	2	6	6875	6880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_012586	CTTC	2	8	6893	6900	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_012586	TC	3	6	7831	7836	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_012586	TGCC	2	8	7844	7851	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_012586	CCG	2	6	7881	7886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_012586	CGAT	2	8	7914	7921	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_012586	GCG	2	6	7969	7974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_012586	AGGGG	2	10	8018	8027	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012586	GCG	2	6	8036	8041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_012586	CGG	2	6	8044	8049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_012586	AAGC	2	8	8254	8261	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_012586	GGAA	2	8	8303	8310	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012586	CGC	2	6	10106	10111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_012586	ATC	2	6	10139	10144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_012586	GTG	2	6	10175	10180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012586	CCG	2	6	10207	10212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_012586	GAT	2	6	10243	10248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012586	GATC	2	8	10258	10265	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_012586	GCGG	2	8	10309	10316	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
40	NC_012586	CA	3	6	10324	10329	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_012586	GGA	2	6	11257	11262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012586	GC	3	6	12740	12745	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_012586	G	6	6	12746	12751	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012586	GC	3	6	12773	12778	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_012586	CCGC	2	8	13738	13745	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
46	NC_012586	CGA	2	6	14405	14410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_012586	CCG	2	6	14429	14434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_012586	TGC	2	6	17315	17320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_012586	AGCA	2	8	17356	17363	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_012586	CG	3	6	17372	17377	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_012586	AACC	2	8	17406	17413	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_012586	GCG	2	6	17434	17439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_012586	GCG	2	6	17449	17454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_012586	CGA	2	6	17467	17472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_012586	TCG	2	6	17486	17491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_012586	CAC	2	6	17499	17504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_012586	GCTT	2	8	17522	17529	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_012586	GGC	2	6	17533	17538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_012586	GC	3	6	17577	17582	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_012586	GCG	2	6	17599	17604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_012586	CCGC	2	8	18093	18100	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
62	NC_012586	CCGAC	2	10	18179	18188	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
63	NC_012586	GTCCT	2	10	20087	20096	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
64	NC_012586	C	6	6	20129	20134	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
65	NC_012586	CTGCC	2	10	20136	20145	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
66	NC_012586	G	6	6	20163	20168	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012586	TC	4	8	20195	20202	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_012586	CCT	2	6	20247	20252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_012586	CCT	2	6	20262	20267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_012586	G	6	6	20295	20300	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012586	CCGA	2	8	20310	20317	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_012586	GTCC	2	8	21205	21212	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_012586	CTT	2	6	21221	21226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_012586	TCC	2	6	22287	22292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_012586	GCCG	2	8	22313	22320	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_012586	CTC	2	6	24203	24208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_012586	GACG	2	8	24229	24236	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_012586	TGC	2	6	24321	24326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_012586	GCC	2	6	24377	24382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_012586	CTC	2	6	24394	24399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_012586	ACTA	2	8	24430	24437	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_012586	AAGC	2	8	24466	24473	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_012586	GC	3	6	24583	24588	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_012586	AAG	2	6	25298	25303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012586	GTTC	2	8	25868	25875	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_012586	TCACC	2	10	26884	26893	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
87	NC_012586	G	6	6	27010	27015	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012586	CGAAT	2	10	27031	27040	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_012586	GCA	2	6	28285	28290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_012586	GC	3	6	29578	29583	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_012586	GCG	2	6	29609	29614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_012586	AGGTCC	2	12	29621	29632	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_012586	AGT	2	6	29669	29674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012586	AGGC	2	8	31945	31952	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_012586	ATC	2	6	31986	31991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_012586	GATT	2	8	31992	31999	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012586	CTG	2	6	32047	32052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_012586	GACAA	2	10	32074	32083	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_012586	TCG	2	6	33719	33724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_012586	GGA	2	6	33839	33844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012586	GGA	2	6	33859	33864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012586	GAAC	2	8	33888	33895	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_012586	CCG	2	6	35037	35042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_012586	TGCT	2	8	35100	35107	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_012586	GCA	2	6	35132	35137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_012586	CGG	3	9	35181	35189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_012586	A	7	7	35222	35228	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012586	GGC	2	6	35243	35248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_012586	AGA	2	6	35256	35261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012586	TGG	2	6	35277	35282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012586	AG	3	6	35338	35343	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012586	GCC	2	6	37356	37361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_012586	CG	3	6	37515	37520	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_012586	GCCG	2	8	37563	37570	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_012586	CGG	3	9	37661	37669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_012586	TCC	2	6	38666	38671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_012586	CCA	2	6	38684	38689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_012586	TCC	2	6	38701	38706	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_012586	GCG	2	6	38793	38798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_012586	TGC	2	6	39674	39679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_012586	CCT	2	6	39696	39701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_012586	GCT	2	6	39725	39730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_012586	CCTCG	2	10	42371	42380	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
124	NC_012586	GC	4	8	44061	44068	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_012586	ATC	2	6	45727	45732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_012586	CGT	2	6	45760	45765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_012586	GCTC	2	8	45773	45780	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_012586	GC	3	6	45792	45797	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_012586	GCC	2	6	45807	45812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_012586	TG	3	6	45841	45846	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012586	GC	4	8	46582	46589	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_012586	ATGA	2	8	46804	46811	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012586	GGC	2	6	46856	46861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_012586	ATG	2	6	46881	46886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012586	GTAG	2	8	46889	46896	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012586	CGA	2	6	46932	46937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_012586	TGGA	2	8	46944	46951	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012586	CGC	2	6	48435	48440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_012586	GTCCC	2	10	48442	48451	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
140	NC_012586	AAG	2	6	48452	48457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012586	G	6	6	48541	48546	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
142	NC_012586	AGCC	2	8	48588	48595	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_012586	TGAT	2	8	48639	48646	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_012586	TCAG	2	8	48659	48666	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_012586	CCG	2	6	48757	48762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_012586	TCG	2	6	48838	48843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_012586	T	6	6	48853	48858	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_012586	CCGC	2	8	48871	48878	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
149	NC_012586	GGCC	2	8	50493	50500	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150	NC_012586	CGT	2	6	50513	50518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_012586	ACA	2	6	50608	50613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_012586	GTA	2	6	50682	50687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_012586	TCT	2	6	50690	50695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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155	NC_012586	GCG	2	6	50779	50784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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157	NC_012586	CGC	2	6	51629	51634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
158	NC_012586	TGC	2	6	51660	51665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_012586	GCC	2	6	51696	51701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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161	NC_012586	GCG	2	6	51770	51775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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163	NC_012586	GCC	2	6	51852	51857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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183	NC_012586	GA	3	6	54026	54031	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
184	NC_012586	TGCC	2	8	54035	54042	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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195	NC_012586	TCG	2	6	55999	56004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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197	NC_012586	GCC	2	6	56059	56064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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280	NC_012586	GTCGCG	2	12	72296	72307	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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288	NC_012586	GTC	2	6	74218	74223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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431	NC_012586	CAG	2	6	110966	110971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
432	NC_012586	GAC	2	6	111018	111023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
433	NC_012586	GTT	2	6	111036	111041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
434	NC_012586	GCG	2	6	111056	111061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
435	NC_012586	CTG	2	6	111070	111075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
436	NC_012586	AGG	2	6	111093	111098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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438	NC_012586	CTCA	2	8	111167	111174	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
439	NC_012586	GTGG	2	8	111256	111263	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
440	NC_012586	GGC	2	6	111272	111277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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443	NC_012586	ACG	2	6	111930	111935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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445	NC_012586	GTG	2	6	113013	113018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
446	NC_012586	CTG	2	6	113039	113044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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453	NC_012586	CGC	2	6	120967	120972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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455	NC_012586	ACA	2	6	120990	120995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
456	NC_012586	ACC	2	6	120998	121003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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458	NC_012586	A	6	6	121046	121051	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
459	NC_012586	GGTTC	2	10	123306	123315	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
460	NC_012586	GC	3	6	123352	123357	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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462	NC_012586	GCC	2	6	123422	123427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
463	NC_012586	CG	3	6	123466	123471	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
464	NC_012586	CG	3	6	123473	123478	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
465	NC_012586	CTG	2	6	123490	123495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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467	NC_012586	GTG	2	6	123521	123526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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469	NC_012586	GC	3	6	123543	123548	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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472	NC_012586	GC	3	6	123597	123602	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
473	NC_012586	TCG	2	6	123606	123611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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475	NC_012586	TTG	2	6	123712	123717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
476	NC_012586	CG	3	6	123726	123731	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
477	NC_012586	GCC	2	6	123765	123770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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