MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus equi subsp. equi 4047

Total Repeats: 9877

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012471	CTA	5	15	1464	1478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_012471	TA	3	6	1490	1495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012471	T	7	7	2672	2678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012471	ATAA	2	8	2685	2692	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012471	TGAG	2	8	2706	2713	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012471	ATT	2	6	2963	2968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012471	A	6	6	2996	3001	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012471	AAAGG	2	10	3023	3032	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012471	TCT	2	6	3431	3436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_012471	T	8	8	3436	3443	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012471	A	6	6	3463	3468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012471	A	7	7	3483	3489	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012471	A	6	6	4682	4687	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012471	GCT	2	6	4730	4735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_012471	ATT	2	6	14238	14243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012471	ATT	2	6	16230	16235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012471	AT	3	6	16237	16242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012471	T	6	6	16271	16276	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012471	A	7	7	17853	17859	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012471	A	7	7	17863	17869	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012471	GAC	2	6	17947	17952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_012471	GGC	2	6	18071	18076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_012471	GAT	2	6	18106	18111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012471	CGA	2	6	18321	18326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_012471	GCA	2	6	18395	18400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_012471	G	6	6	18420	18425	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012471	CGC	2	6	18442	18447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_012471	GTGA	2	8	18448	18455	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012471	TGT	2	6	18481	18486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012471	AGA	2	6	18490	18495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012471	CAT	2	6	18518	18523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_012471	TAAC	2	8	18531	18538	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_012471	CAG	2	6	18564	18569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_012471	AGCG	2	8	18619	18626	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_012471	AT	3	6	18748	18753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012471	GGA	2	6	18754	18759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012471	CT	3	6	18779	18784	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_012471	GAA	2	6	19018	19023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012471	AAG	2	6	19064	19069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012471	GGT	2	6	19092	19097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012471	GTC	2	6	19106	19111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_012471	TCGTG	2	10	19115	19124	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
43	NC_012471	CAT	2	6	19174	19179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_012471	TAA	2	6	19209	19214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012471	GGA	2	6	19218	19223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012471	ATC	2	6	19242	19247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_012471	AC	3	6	19269	19274	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_012471	TGGT	2	8	19284	19291	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012471	CGC	2	6	19408	19413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_012471	AC	3	6	19438	19443	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_012471	CAC	2	6	19453	19458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_012471	AGCC	2	8	19501	19508	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_012471	GAT	2	6	19524	19529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012471	CCT	2	6	19580	19585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_012471	TATACA	2	12	19779	19790	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_012471	AGG	2	6	19849	19854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012471	AT	3	6	19934	19939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012471	T	6	6	19973	19978	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012471	A	6	6	19982	19987	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012471	GT	3	6	20001	20006	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012471	CA	3	6	20011	20016	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_012471	TCG	2	6	20017	20022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_012471	CAA	2	6	20049	20054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_012471	A	6	6	20123	20128	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012471	A	6	6	20180	20185	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012471	GTTAA	2	10	20190	20199	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012471	GAA	2	6	20236	20241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012471	ACG	2	6	20253	20258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_012471	GTAA	2	8	20276	20283	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012471	GAAG	2	8	20358	20365	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012471	GCG	2	6	20429	20434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_012471	AGG	2	6	20446	20451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012471	GAC	2	6	20498	20503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_012471	AGA	2	6	20512	20517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012471	AG	3	6	20540	20545	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012471	TCG	2	6	20615	20620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_012471	GGA	2	6	20628	20633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012471	GGGAG	2	10	20709	20718	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012471	AAG	2	6	20748	20753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012471	GGA	2	6	20944	20949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012471	TC	3	6	21030	21035	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_012471	ACC	2	6	21209	21214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_012471	AGC	2	6	21289	21294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_012471	ATTC	2	8	21296	21303	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_012471	TG	3	6	21419	21424	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012471	GA	3	6	21570	21575	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012471	ACA	2	6	21596	21601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_012471	TA	3	6	21624	21629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012471	CTAA	2	8	21651	21658	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_012471	GAC	2	6	21663	21668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_012471	GA	3	6	21865	21870	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012471	CTGA	2	8	21924	21931	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_012471	CT	3	6	21981	21986	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_012471	GAT	2	6	21999	22004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012471	CGG	2	6	22090	22095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_012471	GA	3	6	22188	22193	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012471	TAGG	2	8	22306	22313	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012471	TAC	2	6	22360	22365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_012471	CCT	2	6	22448	22453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_012471	TTGG	2	8	22489	22496	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012471	AATC	2	8	22498	22505	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_012471	GGT	2	6	22584	22589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012471	TCG	2	6	22699	22704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_012471	CGT	2	6	22779	22784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_012471	AGGGA	2	10	22917	22926	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012471	CTC	2	6	22957	22962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_012471	GA	3	6	23003	23008	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012471	GTG	2	6	23039	23044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012471	ACTAAT	2	12	23058	23069	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_012471	TAAGT	2	10	23169	23178	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012471	AGT	2	6	23220	23225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012471	AGT	2	6	23245	23250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012471	GCTTA	2	10	23282	23291	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_012471	ATAG	2	8	23624	23631	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012471	ACC	2	6	23740	23745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_012471	CGT	2	6	23777	23782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_012471	GCATA	2	10	23878	23887	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_012471	CTC	2	6	23954	23959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_012471	CGC	2	6	24125	24130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_012471	TGG	2	6	24230	24235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012471	GCGT	2	8	24293	24300	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_012471	TCC	2	6	24317	24322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_012471	TCG	2	6	24359	24364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_012471	TA	3	6	24410	24415	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012471	AT	3	6	24420	24425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012471	CGG	2	6	24480	24485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_012471	TGT	2	6	24550	24555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012471	GGT	2	6	24625	24630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012471	GGT	2	6	24660	24665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012471	CAT	2	6	24683	24688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_012471	T	7	7	24814	24820	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012471	T	6	6	26206	26211	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012471	T	7	7	26247	26253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012471	ATTG	2	8	27489	27496	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012471	GTA	2	6	28518	28523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012471	T	6	6	28534	28539	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012471	ATAG	2	8	28589	28596	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012471	TAT	2	6	28626	28631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012471	CTT	2	6	28709	28714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_012471	GTT	2	6	28724	28729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012471	ATT	2	6	28826	28831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_012471	T	7	7	31021	31027	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_012471	A	6	6	31035	31040	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_012471	TTTAT	2	10	31054	31063	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_012471	TAAA	2	8	31072	31079	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_012471	AAAG	2	8	31126	31133	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_012471	TGT	2	6	31870	31875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_012471	T	6	6	31895	31900	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_012471	AAAT	2	8	31916	31923	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_012471	GCT	2	6	31941	31946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_012471	GCT	2	6	35807	35812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_012471	ATT	2	6	35813	35818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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163	NC_012471	GCT	2	6	40997	41002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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186	NC_012471	ATT	2	6	46295	46300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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199	NC_012471	A	7	7	48112	48118	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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281	NC_012471	TGA	2	6	61462	61467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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286	NC_012471	ATA	2	6	61578	61583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
287	NC_012471	AGA	2	6	61588	61593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
288	NC_012471	AAT	2	6	61594	61599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_012471	TGG	2	6	61723	61728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
290	NC_012471	TGG	4	12	61780	61791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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292	NC_012471	TGG	2	6	61842	61847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
293	NC_012471	TTG	2	6	61857	61862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
294	NC_012471	A	8	8	62011	62018	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
295	NC_012471	CCT	2	6	62061	62066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
296	NC_012471	TA	3	6	62067	62072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
297	NC_012471	TTAT	2	8	62099	62106	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
298	NC_012471	TA	3	6	62120	62125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
299	NC_012471	TTTTG	2	10	62155	62164	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
300	NC_012471	ATTG	2	8	62193	62200	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
301	NC_012471	TAT	2	6	62302	62307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
302	NC_012471	GTGG	2	8	62315	62322	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
303	NC_012471	TGT	2	6	62374	62379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
304	NC_012471	GATTT	2	10	62383	62392	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
305	NC_012471	AT	3	6	62399	62404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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308	NC_012471	ATT	2	6	64613	64618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
309	NC_012471	AAT	2	6	64632	64637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
310	NC_012471	AGTCA	2	10	64716	64725	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
311	NC_012471	ATT	2	6	64750	64755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
312	NC_012471	T	6	6	64762	64767	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
313	NC_012471	GGA	2	6	64773	64778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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328	NC_012471	TTA	2	6	68210	68215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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331	NC_012471	TAT	2	6	68333	68338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
332	NC_012471	GAG	2	6	68352	68357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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339	NC_012471	A	6	6	68912	68917	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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341	NC_012471	ATT	2	6	68958	68963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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421	NC_012471	AT	3	6	87187	87192	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
422	NC_012471	TAAA	2	8	87314	87321	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
423	NC_012471	A	7	7	87345	87351	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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427	NC_012471	GAC	2	6	87533	87538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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432	NC_012471	G	6	6	88006	88011	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
433	NC_012471	CGC	2	6	88028	88033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
434	NC_012471	GTGA	2	8	88034	88041	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
435	NC_012471	TGT	2	6	88067	88072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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437	NC_012471	CAT	2	6	88104	88109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
438	NC_012471	TAAC	2	8	88117	88124	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
439	NC_012471	CAG	2	6	88150	88155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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442	NC_012471	GGA	2	6	88340	88345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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444	NC_012471	GAA	2	6	88604	88609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
445	NC_012471	AAG	2	6	88650	88655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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449	NC_012471	CAT	2	6	88760	88765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
450	NC_012471	TAA	2	6	88795	88800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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452	NC_012471	ATC	2	6	88828	88833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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455	NC_012471	CGC	2	6	88994	88999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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461	NC_012471	TATACA	2	12	89365	89376	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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473	NC_012471	GAA	2	6	89822	89827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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476	NC_012471	GAAG	2	8	89944	89951	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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481	NC_012471	AG	3	6	90126	90131	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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499	NC_012471	CT	3	6	91567	91572	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
500	NC_012471	GAT	2	6	91585	91590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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