MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus

Total Repeats: 8531

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_012470	AGA	2	6	338579	338584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_012470	CAT	2	6	338607	338612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_012470	TAAC	2	8	338620	338627	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1504	NC_012470	CAG	2	6	338653	338658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_012470	AGCG	2	8	338708	338715	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1506	NC_012470	AT	3	6	338837	338842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_012470	GGA	2	6	338843	338848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_012470	CT	3	6	338868	338873	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1509	NC_012470	GAA	2	6	339107	339112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_012470	AAG	2	6	339153	339158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_012470	GGT	2	6	339181	339186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_012470	GTC	2	6	339195	339200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_012470	TCGTG	2	10	339204	339213	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1514	NC_012470	CAT	2	6	339263	339268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_012470	TAA	2	6	339298	339303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_012470	GGA	2	6	339307	339312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_012470	ATC	2	6	339331	339336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_012470	AC	3	6	339358	339363	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1519	NC_012470	TGGT	2	8	339373	339380	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_012470	CGC	2	6	339497	339502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1521	NC_012470	AC	3	6	339527	339532	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1522	NC_012470	CAC	2	6	339542	339547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1523	NC_012470	AGCC	2	8	339590	339597	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1524	NC_012470	GAT	2	6	339613	339618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_012470	CCT	2	6	339669	339674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1526	NC_012470	AGG	2	6	339770	339775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_012470	CGGTT	2	10	339824	339833	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1528	NC_012470	TG	3	6	339871	339876	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_012470	CA	3	6	339882	339887	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1530	NC_012470	T	6	6	339900	339905	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_012470	AAG	2	6	339909	339914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_012470	ATC	3	9	339975	339983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_012470	AGA	2	6	340030	340035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_012470	A	6	6	340088	340093	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_012470	GTTAA	2	10	340098	340107	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_012470	GAA	2	6	340144	340149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_012470	ACG	2	6	340161	340166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1538	NC_012470	GTAA	2	8	340184	340191	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_012470	GAAG	2	8	340266	340273	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_012470	GCG	2	6	340337	340342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1541	NC_012470	AGG	2	6	340354	340359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_012470	GAC	2	6	340406	340411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_012470	AGA	2	6	340420	340425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_012470	AG	3	6	340448	340453	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_012470	TCG	2	6	340523	340528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_012470	GGA	2	6	340536	340541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_012470	GGGAG	2	10	340617	340626	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_012470	AAG	2	6	340656	340661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_012470	TTACGT	2	12	340714	340725	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1550	NC_012470	GGA	2	6	340852	340857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_012470	TC	3	6	340938	340943	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1552	NC_012470	ACC	2	6	341117	341122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1553	NC_012470	AGC	2	6	341197	341202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1554	NC_012470	ATTC	2	8	341204	341211	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1555	NC_012470	TG	3	6	341327	341332	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_012470	GA	3	6	341478	341483	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_012470	ACA	2	6	341504	341509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1558	NC_012470	TA	3	6	341532	341537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_012470	CTAA	2	8	341559	341566	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1560	NC_012470	GAC	2	6	341571	341576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_012470	GA	3	6	341773	341778	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_012470	CTGA	2	8	341832	341839	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1563	NC_012470	CT	3	6	341889	341894	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1564	NC_012470	GAT	2	6	341907	341912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_012470	CGG	2	6	341998	342003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_012470	GA	3	6	342096	342101	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_012470	TAGG	2	8	342214	342221	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_012470	TAC	2	6	342268	342273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1569	NC_012470	CCT	2	6	342356	342361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1570	NC_012470	TTGG	2	8	342397	342404	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_012470	AATC	2	8	342406	342413	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1572	NC_012470	GGT	2	6	342492	342497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_012470	TCG	2	6	342607	342612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1574	NC_012470	CGT	2	6	342687	342692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1575	NC_012470	AGGGA	2	10	342825	342834	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_012470	GA	3	6	342911	342916	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_012470	GTG	2	6	342947	342952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_012470	ACTAAT	2	12	342966	342977	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1579	NC_012470	TAAGT	2	10	343077	343086	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_012470	AGT	2	6	343128	343133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_012470	AGT	2	6	343153	343158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_012470	GCTTA	2	10	343190	343199	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1583	NC_012470	GTA	2	6	343220	343225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_012470	ATG	2	6	343243	343248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_012470	TC	3	6	343339	343344	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1586	NC_012470	T	6	6	343345	343350	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_012470	CTC	2	6	343518	343523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1588	NC_012470	TGT	2	6	343560	343565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_012470	T	7	7	343565	343571	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_012470	TAA	2	6	343585	343590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_012470	CTA	2	6	343593	343598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1592	NC_012470	CTT	2	6	344165	344170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1593	NC_012470	TAAAA	2	10	344210	344219	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_012470	ATT	2	6	344227	344232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_012470	AAAAG	2	10	345896	345905	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_012470	CTG	2	6	346257	346262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1597	NC_012470	ACA	2	6	346274	346279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1598	NC_012470	T	6	6	347908	347913	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_012470	GTA	2	6	347975	347980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_012470	GTT	2	6	348782	348787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_012470	AGA	2	6	350010	350015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_012470	AAG	2	6	350031	350036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_012470	GTT	2	6	350070	350075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_012470	AGT	2	6	350078	350083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_012470	TGCT	2	8	350127	350134	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1606	NC_012470	AAG	2	6	350156	350161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_012470	A	7	7	350209	350215	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_012470	CT	3	6	350233	350238	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1609	NC_012470	TTG	3	9	350259	350267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_012470	AGG	2	6	350312	350317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_012470	GCT	2	6	351041	351046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1612	NC_012470	GCT	2	6	351062	351067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_012470	GTA	2	6	352012	352017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_012470	TAG	2	6	352042	352047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_012470	A	6	6	352073	352078	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_012470	CAA	2	6	352980	352985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1617	NC_012470	GCTT	2	8	353028	353035	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1618	NC_012470	CTA	2	6	353063	353068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1619	NC_012470	AGC	2	6	353099	353104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1621	NC_012470	GTA	2	6	353155	353160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_012470	GTCTA	2	10	353188	353197	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1623	NC_012470	TAA	2	6	353228	353233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_012470	A	6	6	353300	353305	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_012470	AGG	2	6	354190	354195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_012470	TTA	2	6	357381	357386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_012470	T	6	6	357398	357403	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_012470	TAA	2	6	358799	358804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_012470	TCTT	2	8	358806	358813	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1630	NC_012470	AAT	2	6	358836	358841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_012470	ATA	2	6	358862	358867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_012470	TAT	2	6	358876	358881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_012470	GTC	2	6	358898	358903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1634	NC_012470	A	6	6	358938	358943	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1636	NC_012470	ATA	2	6	359070	359075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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