MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus

Total Repeats: 8531

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_012470	TC	3	6	225385	225390	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1002	NC_012470	AAT	2	6	225479	225484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_012470	T	8	8	225484	225491	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_012470	CGC	2	6	225507	225512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1005	NC_012470	CAC	2	6	225514	225519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1006	NC_012470	GAT	2	6	225547	225552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_012470	CTT	2	6	225637	225642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_012470	AGG	2	6	225706	225711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_012470	AAG	2	6	225740	225745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_012470	TCT	3	9	225824	225832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_012470	A	6	6	225868	225873	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_012470	A	7	7	225941	225947	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_012470	GAAA	2	8	225966	225973	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_012470	ACT	2	6	226010	226015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_012470	ATA	2	6	226024	226029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_012470	ATC	2	6	226042	226047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_012470	TGA	2	6	226070	226075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_012470	A	6	6	226231	226236	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_012470	A	6	6	226244	226249	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_012470	AAT	2	6	226251	226256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_012470	TTA	2	6	226269	226274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_012470	AAG	2	6	226300	226305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_012470	TAAAA	2	10	226316	226325	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_012470	TAA	2	6	226340	226345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_012470	A	6	6	226357	226362	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_012470	AG	3	6	226380	226385	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_012470	ATA	2	6	228174	228179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_012470	CTGT	2	8	228216	228223	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1029	NC_012470	CTT	2	6	228298	228303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_012470	AAC	2	6	228337	228342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_012470	GTC	2	6	231122	231127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_012470	AGCT	2	8	231144	231151	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1033	NC_012470	AGA	2	6	232517	232522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_012470	AAG	2	6	232575	232580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_012470	ATA	2	6	232617	232622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_012470	T	6	6	232631	232636	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_012470	T	6	6	232920	232925	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_012470	ATC	2	6	232985	232990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_012470	A	7	7	233014	233020	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_012470	A	6	6	233154	233159	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_012470	ATG	2	6	234103	234108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_012470	TAA	2	6	234127	234132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_012470	GCT	2	6	234157	234162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_012470	TAG	2	6	234178	234183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_012470	CCT	2	6	235349	235354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1046	NC_012470	CTTG	2	8	235371	235378	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1047	NC_012470	T	6	6	235383	235388	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_012470	AAAAAG	2	12	235420	235431	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_012470	ACA	2	6	235447	235452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_012470	ATG	2	6	235480	235485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_012470	TAA	2	6	235512	235517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_012470	GCT	2	6	237151	237156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_012470	AAT	2	6	237173	237178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_012470	TAG	2	6	237220	237225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_012470	AGG	2	6	237244	237249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_012470	TAG	2	6	237693	237698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_012470	T	6	6	238124	238129	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_012470	TGA	2	6	238133	238138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_012470	CAGA	2	8	238150	238157	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1060	NC_012470	A	6	6	238257	238262	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_012470	GA	3	6	239015	239020	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_012470	TC	4	8	241124	241131	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1063	NC_012470	ATT	2	6	241189	241194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_012470	GCA	2	6	241217	241222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_012470	T	6	6	241254	241259	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_012470	GAAAG	2	10	241277	241286	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_012470	AG	3	6	241285	241290	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_012470	GCT	2	6	241367	241372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_012470	CT	3	6	241371	241376	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1070	NC_012470	GCCTT	2	10	243977	243986	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1071	NC_012470	GCAGG	2	10	248637	248646	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1072	NC_012470	AAAG	2	8	248678	248685	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_012470	A	6	6	248689	248694	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_012470	ACTA	2	8	249197	249204	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1075	NC_012470	ATA	2	6	249208	249213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_012470	TCA	2	6	249216	249221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_012470	CAG	2	6	249225	249230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_012470	ATC	2	6	249833	249838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_012470	AGC	2	6	249859	249864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_012470	T	7	7	250564	250570	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_012470	AGGC	2	8	250622	250629	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1082	NC_012470	TGA	2	6	250633	250638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_012470	AT	3	6	250661	250666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_012470	ATT	2	6	250670	250675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_012470	A	6	6	250677	250682	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_012470	AT	12	24	250702	250725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_012470	TAA	2	6	250745	250750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_012470	A	6	6	250760	250765	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_012470	TCGT	2	8	250772	250779	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1090	NC_012470	AAAT	2	8	250780	250787	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_012470	ATCTA	2	10	250793	250802	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1092	NC_012470	A	7	7	250802	250808	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_012470	A	6	6	250922	250927	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_012470	CAG	2	6	252396	252401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_012470	TAG	2	6	252468	252473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1097	NC_012470	AGC	2	6	252494	252499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_012470	AAT	2	6	252529	252534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_012470	AG	3	6	252566	252571	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_012470	AGAC	2	8	252578	252585	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1101	NC_012470	A	6	6	252635	252640	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_012470	ATT	2	6	252646	252651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_012470	A	6	6	252965	252970	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_012470	T	7	7	254426	254432	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_012470	AG	3	6	254484	254489	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_012470	TGC	2	6	254490	254495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_012470	CGT	2	6	254584	254589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_012470	GT	3	6	254605	254610	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_012470	AAC	2	6	254640	254645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_012470	A	6	6	254656	254661	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_012470	CT	3	6	258171	258176	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1112	NC_012470	A	6	6	258195	258200	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_012470	ATC	2	6	260037	260042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_012470	CT	3	6	260050	260055	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1115	NC_012470	AT	3	6	260134	260139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_012470	A	6	6	260147	260152	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_012470	AAATA	2	10	260174	260183	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_012470	AGC	2	6	261040	261045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_012470	TAA	2	6	261073	261078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_012470	GCT	2	6	262398	262403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_012470	AGC	2	6	262406	262411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_012470	CA	3	6	262413	262418	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1123	NC_012470	ATT	2	6	262430	262435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_012470	GGC	2	6	262441	262446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_012470	GAT	2	6	262467	262472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_012470	T	7	7	262474	262480	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_012470	ATT	2	6	262505	262510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_012470	AAAGG	2	10	263402	263411	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_012470	T	6	6	263434	263439	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_012470	T	6	6	263494	263499	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_012470	GAAT	2	8	263518	263525	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_012470	AACAG	2	10	263568	263577	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1133	NC_012470	CCA	2	6	263643	263648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1134	NC_012470	T	6	6	263698	263703	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_012470	TTC	2	6	263746	263751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1136	NC_012470	AAT	2	6	263767	263772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1138	NC_012470	TAG	2	6	263824	263829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1406	NC_012470	A	6	6	308184	308189	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1407	NC_012470	A	6	6	309721	309726	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1410	NC_012470	TTC	2	6	310085	310090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1411	NC_012470	GTA	2	6	310153	310158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1412	NC_012470	AG	3	6	312204	312209	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1413	NC_012470	AGC	2	6	312314	312319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1416	NC_012470	AAGC	2	8	313354	313361	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1417	NC_012470	GCTT	2	8	313374	313381	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1421	NC_012470	AG	3	6	313573	313578	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1422	NC_012470	TGTGC	2	10	313614	313623	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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1425	NC_012470	TTG	2	6	313746	313751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1426	NC_012470	CTTT	2	8	313772	313779	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1429	NC_012470	GA	3	6	313850	313855	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1432	NC_012470	TAA	2	6	314018	314023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1433	NC_012470	TTA	2	6	314042	314047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1434	NC_012470	AGG	2	6	314181	314186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1435	NC_012470	TTA	2	6	314188	314193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1438	NC_012470	T	6	6	316620	316625	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1439	NC_012470	ATT	2	6	316693	316698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1449	NC_012470	CTG	2	6	319831	319836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1451	NC_012470	TGA	2	6	320761	320766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1457	NC_012470	CTT	2	6	325314	325319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1487	NC_012470	ACTT	2	8	337831	337838	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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