MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus

Total Repeats: 8531

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_012470	ATA	2	6	1999321	1999326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8002	NC_012470	CTA	2	6	1999331	1999336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8003	NC_012470	AAG	2	6	1999351	1999356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8004	NC_012470	CT	3	6	1999362	1999367	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8005	NC_012470	ATTGT	2	10	1999368	1999377	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
8006	NC_012470	CTT	2	6	1999395	1999400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8007	NC_012470	CCT	2	6	1999407	1999412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8008	NC_012470	ACT	2	6	2001208	2001213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8009	NC_012470	A	7	7	2003108	2003114	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8010	NC_012470	T	7	7	2003129	2003135	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8011	NC_012470	T	7	7	2003232	2003238	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8012	NC_012470	CCT	2	6	2003383	2003388	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8013	NC_012470	TTA	2	6	2003480	2003485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8014	NC_012470	T	6	6	2003492	2003497	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8015	NC_012470	AT	3	6	2003526	2003531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8016	NC_012470	ATC	2	6	2004135	2004140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8017	NC_012470	TCTG	2	8	2004181	2004188	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8018	NC_012470	ATT	2	6	2004239	2004244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8019	NC_012470	CTTA	2	8	2004251	2004258	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8020	NC_012470	T	7	7	2004273	2004279	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8021	NC_012470	A	6	6	2004298	2004303	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8022	NC_012470	CTT	2	6	2004339	2004344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8023	NC_012470	TAA	2	6	2004375	2004380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8024	NC_012470	AGGT	2	8	2004420	2004427	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8025	NC_012470	TCA	2	6	2004444	2004449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8026	NC_012470	AGG	2	6	2004463	2004468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8027	NC_012470	T	6	6	2004614	2004619	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8028	NC_012470	CTT	2	6	2004734	2004739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8029	NC_012470	TAA	2	6	2004764	2004769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8030	NC_012470	TAA	2	6	2004780	2004785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8031	NC_012470	AGGT	2	8	2004825	2004832	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8032	NC_012470	TCA	2	6	2004849	2004854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8033	NC_012470	AGG	2	6	2004868	2004873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8034	NC_012470	T	7	7	2005019	2005025	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8035	NC_012470	AAT	2	6	2005027	2005032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8036	NC_012470	CATCT	2	10	2005161	2005170	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
8037	NC_012470	TA	4	8	2005179	2005186	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8038	NC_012470	TCA	2	6	2005343	2005348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8039	NC_012470	GTT	2	6	2005373	2005378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8040	NC_012470	ACA	2	6	2005383	2005388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8041	NC_012470	ACA	2	6	2005452	2005457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8042	NC_012470	CTT	2	6	2005494	2005499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8043	NC_012470	TTC	2	6	2005515	2005520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8044	NC_012470	T	8	8	2005567	2005574	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8045	NC_012470	TTAA	3	12	2005598	2005609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8046	NC_012470	AAT	2	6	2005614	2005619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8047	NC_012470	TTA	2	6	2005632	2005637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8048	NC_012470	AGT	2	6	2007081	2007086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8049	NC_012470	ACT	2	6	2007096	2007101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8050	NC_012470	TA	3	6	2007131	2007136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8051	NC_012470	AG	3	6	2007139	2007144	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8052	NC_012470	CT	4	8	2007157	2007164	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8053	NC_012470	TC	3	6	2008225	2008230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8054	NC_012470	TGA	2	6	2008234	2008239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8055	NC_012470	TAA	2	6	2008242	2008247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8056	NC_012470	AGA	2	6	2008271	2008276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8057	NC_012470	GCT	2	6	2008307	2008312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8058	NC_012470	T	15	15	2008337	2008351	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8059	NC_012470	TCA	2	6	2008385	2008390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8060	NC_012470	CCT	2	6	2010087	2010092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8061	NC_012470	TGT	2	6	2010101	2010106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8062	NC_012470	AAT	2	6	2010120	2010125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8063	NC_012470	ATAC	2	8	2010146	2010153	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8064	NC_012470	A	7	7	2010170	2010176	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8065	NC_012470	T	6	6	2010311	2010316	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8066	NC_012470	T	6	6	2010331	2010336	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8067	NC_012470	TTG	2	6	2010338	2010343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8068	NC_012470	TA	3	6	2010352	2010357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8069	NC_012470	TAA	2	6	2010363	2010368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8070	NC_012470	AAT	2	6	2012180	2012185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8071	NC_012470	ATAC	2	8	2012206	2012213	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8072	NC_012470	A	7	7	2012230	2012236	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8073	NC_012470	AGCTA	2	10	2012327	2012336	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
8074	NC_012470	GCT	2	6	2012369	2012374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8075	NC_012470	AAT	2	6	2012405	2012410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8076	NC_012470	ATT	2	6	2012438	2012443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8077	NC_012470	CT	3	6	2012519	2012524	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8078	NC_012470	CCT	2	6	2016969	2016974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8079	NC_012470	AAATT	2	10	2016987	2016996	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8080	NC_012470	CTTT	2	8	2016998	2017005	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8081	NC_012470	ATT	2	6	2017010	2017015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8082	NC_012470	A	7	7	2017118	2017124	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8083	NC_012470	GAA	2	6	2017148	2017153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8084	NC_012470	TCC	2	6	2017155	2017160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8085	NC_012470	TGAT	2	8	2017223	2017230	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8086	NC_012470	TCC	2	6	2018871	2018876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8087	NC_012470	T	6	6	2019255	2019260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8088	NC_012470	A	7	7	2019264	2019270	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8089	NC_012470	CTTC	2	8	2019327	2019334	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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8091	NC_012470	TG	3	6	2019345	2019350	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8092	NC_012470	TATT	2	8	2019354	2019361	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8093	NC_012470	T	6	6	2019360	2019365	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8094	NC_012470	A	6	6	2019411	2019416	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8095	NC_012470	CCT	2	6	2021198	2021203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8096	NC_012470	TCGT	2	8	2021250	2021257	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8097	NC_012470	ATTT	2	8	2021263	2021270	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8098	NC_012470	AGC	2	6	2022117	2022122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8099	NC_012470	CCTT	2	8	2022135	2022142	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8100	NC_012470	ACAG	2	8	2022193	2022200	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8101	NC_012470	CAA	2	6	2023516	2023521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8102	NC_012470	AG	3	6	2023526	2023531	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8103	NC_012470	A	6	6	2023599	2023604	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8104	NC_012470	ATT	2	6	2023632	2023637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8105	NC_012470	A	6	6	2023641	2023646	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8106	NC_012470	T	6	6	2023664	2023669	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8107	NC_012470	AGCA	2	8	2023705	2023712	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8108	NC_012470	AAT	2	6	2023732	2023737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8109	NC_012470	AACT	2	8	2023790	2023797	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8110	NC_012470	CT	3	6	2025978	2025983	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8111	NC_012470	ACC	2	6	2026063	2026068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8112	NC_012470	CTA	2	6	2026119	2026124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8113	NC_012470	TTTC	2	8	2029459	2029466	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8114	NC_012470	CT	3	6	2029529	2029534	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8115	NC_012470	TC	3	6	2032564	2032569	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8116	NC_012470	A	6	6	2032578	2032583	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8117	NC_012470	T	6	6	2032609	2032614	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8118	NC_012470	GCA	2	6	2032662	2032667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8119	NC_012470	TTGT	2	8	2036916	2036923	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8120	NC_012470	CT	4	8	2036928	2036935	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8121	NC_012470	TA	3	6	2036939	2036944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8122	NC_012470	AAC	2	6	2036995	2037000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8123	NC_012470	TAT	2	6	2037020	2037025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8124	NC_012470	AGA	2	6	2037026	2037031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8125	NC_012470	AAT	2	6	2037032	2037037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8126	NC_012470	ATA	2	6	2037040	2037045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8127	NC_012470	T	6	6	2037070	2037075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8128	NC_012470	ATT	2	6	2037078	2037083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8129	NC_012470	TTG	2	6	2037084	2037089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8130	NC_012470	ATA	2	6	2037156	2037161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8131	NC_012470	TAA	2	6	2037166	2037171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8132	NC_012470	TTG	2	6	2037175	2037180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8133	NC_012470	TTC	2	6	2038505	2038510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8134	NC_012470	T	6	6	2038534	2038539	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8135	NC_012470	TAC	2	6	2038599	2038604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8140	NC_012470	TTG	2	6	2041313	2041318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8141	NC_012470	AGCT	2	8	2041399	2041406	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8142	NC_012470	CT	3	6	2041405	2041410	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8143	NC_012470	ATTA	2	8	2041431	2041438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8146	NC_012470	TTA	2	6	2042586	2042591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8261	NC_012470	ATT	2	6	2068486	2068491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8262	NC_012470	ATTTT	2	10	2068496	2068505	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8263	NC_012470	T	7	7	2068502	2068508	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8264	NC_012470	A	7	7	2069443	2069449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8265	NC_012470	TAT	2	6	2069487	2069492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8403	NC_012470	GTA	2	6	2110010	2110015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8406	NC_012470	ATT	2	6	2110084	2110089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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