MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae 70585

Total Repeats: 7684

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012468	TAA	2	6	45	50	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012468	AAT	2	6	54	59	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012468	TTC	2	6	60	65	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_012468	ATT	2	6	107	112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012468	CTAT	2	8	138	145	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_012468	AGG	2	6	183	188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012468	T	6	6	1577	1582	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012468	T	6	6	1586	1591	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012468	T	6	6	1599	1604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012468	A	6	6	1614	1619	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012468	TAT	2	6	1668	1673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012468	TAT	2	6	1677	1682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012468	ATAA	2	8	1699	1706	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012468	AGT	2	6	2912	2917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012468	TTAG	2	8	3119	3126	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012468	TGAAA	2	10	3170	3179	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012468	TAA	2	6	4316	4321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012468	A	7	7	4341	4347	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012468	TCT	2	6	8468	8473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_012468	AAT	2	6	8496	8501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012468	TAA	2	6	8511	8516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012468	GA	3	6	14333	14338	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012468	CT	3	6	14348	14353	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_012468	T	6	6	14353	14358	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012468	TTCT	2	8	15653	15660	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_012468	GTT	2	6	15666	15671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012468	T	7	7	15703	15709	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012468	ATA	2	6	15729	15734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012468	T	6	6	15775	15780	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012468	A	8	8	16362	16369	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012468	A	7	7	16372	16378	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012468	AGT	2	6	16387	16392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012468	AAC	2	6	16436	16441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_012468	CGG	2	6	16482	16487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_012468	TGA	2	6	16540	16545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012468	A	7	7	16545	16551	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012468	A	6	6	16556	16561	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012468	A	6	6	16576	16581	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012468	GA	3	6	16630	16635	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012468	ACA	2	6	16692	16697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_012468	GTA	2	6	16704	16709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012468	A	7	7	16720	16726	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012468	GGC	2	6	16806	16811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_012468	AGG	2	6	16841	16846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012468	GCTT	2	8	16848	16855	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_012468	CCTG	2	8	16896	16903	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_012468	TGG	2	6	17025	17030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012468	CGA	2	6	17049	17054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_012468	GCA	2	6	17123	17128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_012468	CGC	2	6	17170	17175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_012468	GTGA	2	8	17176	17183	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012468	TGT	2	6	17209	17214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012468	AGA	2	6	17218	17223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012468	CAG	2	6	17292	17297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_012468	AGCG	2	8	17347	17354	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_012468	TAG	2	6	17399	17404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012468	AT	3	6	17476	17481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012468	GGA	2	6	17482	17487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012468	CT	3	6	17507	17512	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_012468	GAA	2	6	17746	17751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012468	GGT	2	6	17820	17825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012468	GTC	2	6	17834	17839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_012468	TCGTG	2	10	17843	17852	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
64	NC_012468	CAT	2	6	17902	17907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_012468	TAA	2	6	17937	17942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012468	GGA	2	6	17946	17951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012468	ATC	2	6	17970	17975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_012468	AC	3	6	17997	18002	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_012468	CGC	2	6	18136	18141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_012468	AC	3	6	18166	18171	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_012468	CAC	2	6	18181	18186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_012468	AGCC	2	8	18228	18235	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_012468	GAT	2	6	18251	18256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012468	CCT	2	6	18307	18312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_012468	TAAGGA	2	12	18316	18327	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012468	AGG	2	6	18406	18411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012468	GA	3	6	18444	18449	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012468	GTA	2	6	18521	18526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012468	TAA	2	6	18528	18533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012468	GTTAA	2	10	18564	18573	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012468	CGA	2	6	18609	18614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_012468	ACG	2	6	18627	18632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_012468	GTAA	2	8	18650	18657	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012468	GAT	2	6	18660	18665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012468	GTA	2	6	18697	18702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012468	GAG	2	6	18730	18735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012468	TAG	2	6	18798	18803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012468	GCGA	2	8	18806	18813	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_012468	AGG	2	6	18820	18825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012468	AGA	2	6	18885	18890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012468	AG	3	6	18913	18918	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012468	CGG	2	6	18969	18974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_012468	GGA	2	6	19001	19006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012468	GGGAG	2	10	19082	19091	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012468	ACA	2	6	19119	19124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_012468	ATG	2	6	19186	19191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012468	GGA	2	6	19319	19324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012468	TC	3	6	19405	19410	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_012468	ACC	2	6	19585	19590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_012468	AAT	2	6	19605	19610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012468	AGC	2	6	19665	19670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_012468	ATTC	2	8	19672	19679	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_012468	TG	3	6	19794	19799	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012468	GAG	2	6	19815	19820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012468	GA	3	6	19945	19950	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012468	ACA	2	6	19971	19976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_012468	CTAA	2	8	20026	20033	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_012468	GTCT	2	8	20051	20058	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_012468	TAG	2	6	20128	20133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012468	GA	3	6	20241	20246	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012468	CT	3	6	20357	20362	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_012468	GAT	2	6	20375	20380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012468	CGG	2	6	20466	20471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_012468	GA	3	6	20564	20569	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012468	TAGG	2	8	20682	20689	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012468	TAC	2	6	20736	20741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_012468	CCT	2	6	20824	20829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_012468	GGT	2	6	20960	20965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012468	TCG	2	6	21075	21080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_012468	CGT	2	6	21155	21160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_012468	AGGGA	2	10	21293	21302	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012468	TA	3	6	21359	21364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012468	GA	3	6	21379	21384	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012468	GAAGTG	2	12	21404	21415	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012468	ACTAAT	2	12	21434	21445	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_012468	AGT	2	6	21613	21618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012468	GTA	2	6	21680	21685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012468	ATG	2	6	21703	21708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012468	T	6	6	21762	21767	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012468	TAA	3	9	21774	21782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012468	CTA	2	6	21894	21899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_012468	TAT	2	6	21900	21905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012468	T	7	7	22641	22647	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012468	ATA	2	6	22667	22672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012468	TA	3	6	22675	22680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012468	TTG	2	6	22803	22808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012468	T	6	6	22855	22860	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012468	A	6	6	22877	22882	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012468	ATA	2	6	23184	23189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012468	T	6	6	23218	23223	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012468	TCT	2	6	23256	23261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_012468	T	6	6	23276	23281	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_012468	TAA	2	6	23286	23291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_012468	AAG	2	6	24706	24711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_012468	CCT	2	6	24713	24718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_012468	TTG	2	6	24722	24727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_012468	CTTTT	2	10	24744	24753	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
148	NC_012468	ATA	2	6	24756	24761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_012468	T	6	6	24793	24798	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_012468	AAT	2	6	24833	24838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_012468	T	6	6	26158	26163	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_012468	A	6	6	27932	27937	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_012468	AATTA	2	10	27939	27948	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_012468	GTT	2	6	27959	27964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_012468	A	6	6	28030	28035	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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160	NC_012468	T	6	6	28168	28173	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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163	NC_012468	TAT	2	6	29708	29713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_012468	TTA	2	6	32505	32510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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170	NC_012468	GGA	2	6	32950	32955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
171	NC_012468	AGA	2	6	35421	35426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
172	NC_012468	ATGGT	2	10	35725	35734	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
173	NC_012468	TAT	2	6	35745	35750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_012468	GAG	3	9	35756	35764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
175	NC_012468	TAT	2	6	36271	36276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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192	NC_012468	T	6	6	61433	61438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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195	NC_012468	TTTTG	2	10	61592	61601	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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421	NC_012468	A	7	7	131092	131098	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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426	NC_012468	A	6	6	132815	132820	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
427	NC_012468	GTTT	2	8	133899	133906	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
428	NC_012468	TGTA	2	8	133935	133942	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
429	NC_012468	T	6	6	134852	134857	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
430	NC_012468	A	6	6	134865	134870	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
431	NC_012468	CCT	2	6	136076	136081	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
432	NC_012468	TTAG	2	8	136084	136091	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
433	NC_012468	TAG	2	6	136107	136112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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435	NC_012468	TA	4	8	137974	137981	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
436	NC_012468	AT	3	6	137994	137999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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438	NC_012468	TA	4	8	138046	138053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
439	NC_012468	A	6	6	138053	138058	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
440	NC_012468	ATA	2	6	139247	139252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
441	NC_012468	TAA	2	6	139270	139275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
442	NC_012468	ATA	2	6	139544	139549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
443	NC_012468	TAA	2	6	139567	139572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
444	NC_012468	ATA	2	6	139841	139846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
445	NC_012468	TAA	2	6	139864	139869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
446	NC_012468	ATA	2	6	140138	140143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
447	NC_012468	TAA	2	6	140161	140166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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449	NC_012468	TAA	2	6	141161	141166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
450	NC_012468	AGG	2	6	141191	141196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
451	NC_012468	TCT	2	6	143330	143335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
452	NC_012468	TAT	2	6	145598	145603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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455	NC_012468	A	6	6	145713	145718	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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457	NC_012468	ATA	2	6	146412	146417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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461	NC_012468	TTA	2	6	146910	146915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
462	NC_012468	TA	3	6	146914	146919	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
463	NC_012468	TGT	2	6	146966	146971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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468	NC_012468	GTT	2	6	147078	147083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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470	NC_012468	GAAG	2	8	147102	147109	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
471	NC_012468	TTG	2	6	147133	147138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
472	NC_012468	ATA	2	6	147176	147181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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474	NC_012468	TTC	2	6	147485	147490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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481	NC_012468	ATG	2	6	151389	151394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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