MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae JJA

Total Repeats: 7577

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_012466	ATA	2	6	2086348	2086353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7502	NC_012466	ACCT	2	8	2086433	2086440	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7503	NC_012466	CTT	2	6	2087013	2087018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7504	NC_012466	TAT	2	6	2087045	2087050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7505	NC_012466	T	6	6	2087076	2087081	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7506	NC_012466	ATT	2	6	2089073	2089078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7507	NC_012466	T	6	6	2089077	2089082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7508	NC_012466	AAT	2	6	2089739	2089744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7509	NC_012466	ACT	2	6	2089770	2089775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7510	NC_012466	AT	3	6	2089920	2089925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7511	NC_012466	AGA	2	6	2091106	2091111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7512	NC_012466	GATA	2	8	2091115	2091122	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7513	NC_012466	GAT	2	6	2091544	2091549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7514	NC_012466	TCC	2	6	2091633	2091638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7515	NC_012466	AC	3	6	2091641	2091646	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7516	NC_012466	AAAG	2	8	2091817	2091824	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7517	NC_012466	TCC	2	6	2092302	2092307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7518	NC_012466	ATT	2	6	2092312	2092317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7519	NC_012466	T	6	6	2092316	2092321	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7520	NC_012466	GATA	2	8	2092351	2092358	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7521	NC_012466	TTA	2	6	2092418	2092423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7522	NC_012466	ATT	2	6	2092441	2092446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7523	NC_012466	A	6	6	2092467	2092472	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7524	NC_012466	A	6	6	2092502	2092507	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7525	NC_012466	TAT	2	6	2092529	2092534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7526	NC_012466	T	6	6	2093590	2093595	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7527	NC_012466	CCT	2	6	2093625	2093630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7528	NC_012466	T	7	7	2094451	2094457	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7529	NC_012466	CTT	2	6	2094461	2094466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7530	NC_012466	TCA	2	6	2094510	2094515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7531	NC_012466	TAT	2	6	2094524	2094529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7532	NC_012466	CTT	2	6	2095850	2095855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7533	NC_012466	A	7	7	2095878	2095884	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7534	NC_012466	TAA	2	6	2095889	2095894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7535	NC_012466	CTT	2	6	2101123	2101128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7536	NC_012466	TAT	2	6	2101138	2101143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7537	NC_012466	CCT	2	6	2103690	2103695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7538	NC_012466	TA	3	6	2103696	2103701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7539	NC_012466	TAT	2	6	2103710	2103715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7540	NC_012466	TC	4	8	2103787	2103794	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7541	NC_012466	T	6	6	2105357	2105362	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7542	NC_012466	TCTT	2	8	2106856	2106863	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7543	NC_012466	TATC	2	8	2106889	2106896	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7544	NC_012466	TAAA	2	8	2106934	2106941	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7545	NC_012466	A	6	6	2106939	2106944	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7546	NC_012466	TTC	2	6	2106952	2106957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7547	NC_012466	T	7	7	2108054	2108060	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7548	NC_012466	AAAT	2	8	2108084	2108091	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7549	NC_012466	AAAAAT	2	12	2108152	2108163	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7550	NC_012466	TAG	2	6	2108184	2108189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7551	NC_012466	AATA	2	8	2108190	2108197	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7552	NC_012466	T	7	7	2112483	2112489	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7553	NC_012466	TCT	2	6	2112492	2112497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7554	NC_012466	ATTT	2	8	2112889	2112896	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7555	NC_012466	ACTG	2	8	2113281	2113288	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7556	NC_012466	AAT	2	6	2114095	2114100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7557	NC_012466	GGTT	2	8	2114104	2114111	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7558	NC_012466	T	8	8	2114110	2114117	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7559	NC_012466	T	6	6	2114152	2114157	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7560	NC_012466	TAATA	2	10	2114178	2114187	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7561	NC_012466	A	6	6	2114199	2114204	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7562	NC_012466	A	6	6	2114220	2114225	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7563	NC_012466	AGG	2	6	2114260	2114265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7564	NC_012466	CAT	2	6	2114880	2114885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7565	NC_012466	CTA	2	6	2114902	2114907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7566	NC_012466	CCG	2	6	2114961	2114966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7567	NC_012466	T	6	6	2117295	2117300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7568	NC_012466	TC	3	6	2117359	2117364	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7569	NC_012466	T	7	7	2117373	2117379	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7570	NC_012466	T	6	6	2117394	2117399	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7571	NC_012466	A	6	6	2117403	2117408	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7572	NC_012466	TAT	2	6	2117432	2117437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7573	NC_012466	CAG	2	6	2117446	2117451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7574	NC_012466	ATT	2	6	2117521	2117526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7575	NC_012466	T	6	6	2118061	2118066	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7576	NC_012466	A	6	6	2118086	2118091	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7577	NC_012466	AAAG	2	8	2119414	2119421	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.