MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus USA300_TCH1516 plasmid pUSA01-HOU

Total Repeats: 20

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012417	T	6	6	1011	1016	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012417	T	6	6	1022	1027	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012417	A	6	6	1030	1035	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012417	TGTA	2	8	1063	1070	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012417	AT	3	6	1096	1101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012417	A	6	6	1270	1275	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012417	T	6	6	1555	1560	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012417	A	6	6	1561	1566	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012417	GAA	2	6	1961	1966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012417	AATA	2	8	2081	2088	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012417	TTGTT	2	10	2688	2697	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012417	AATAT	2	10	2712	2721	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012417	GTT	2	6	2923	2928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012417	T	6	6	2927	2932	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012417	TCT	2	6	2953	2958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_012417	TA	3	6	2970	2975	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012417	TA	5	10	2991	3000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012417	A	6	6	3065	3070	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012417	TAT	2	6	3080	3085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012417	ATA	2	6	3104	3109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.