MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi C strain RKS4594 chromosome

Total Repeats: 15617

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_012125	AGGTG	2	10	1294817	1294826	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_012125	A	6	6	1294846	1294851	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_012125	T	6	6	1294868	1294873	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_012125	CCAG	2	8	1295916	1295923	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3505	NC_012125	AAT	2	6	1295967	1295972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_012125	TAC	2	6	1296070	1296075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_012125	GC	3	6	1296094	1296099	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3508	NC_012125	TGG	2	6	1296134	1296139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_012125	TTAT	2	8	1296160	1296167	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_012125	TGC	2	6	1297067	1297072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3511	NC_012125	GTG	2	6	1297138	1297143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_012125	AAC	2	6	1297156	1297161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3513	NC_012125	T	6	6	1298207	1298212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_012125	TA	3	6	1301532	1301537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_012125	ATCT	2	8	1302479	1302486	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3516	NC_012125	GT	3	6	1302491	1302496	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_012125	ATT	2	6	1303322	1303327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_012125	TTAA	2	8	1303334	1303341	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_012125	GCAA	2	8	1303390	1303397	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3520	NC_012125	TGA	2	6	1303466	1303471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_012125	GTC	2	6	1306893	1306898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3522	NC_012125	AGCGC	2	10	1306912	1306921	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3523	NC_012125	TGG	2	6	1307007	1307012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_012125	GTG	2	6	1307086	1307091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_012125	TGA	2	6	1307094	1307099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_012125	CCG	2	6	1307110	1307115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3527	NC_012125	CCT	2	6	1307120	1307125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3528	NC_012125	GTG	2	6	1307203	1307208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_012125	TGA	2	6	1307211	1307216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_012125	CCG	2	6	1307227	1307232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3531	NC_012125	CCT	2	6	1307237	1307242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3532	NC_012125	CGG	2	6	1307302	1307307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3533	NC_012125	AGT	2	6	1307319	1307324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_012125	TGG	2	6	1307325	1307330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_012125	TGA	2	6	1307332	1307337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_012125	CCG	2	6	1307348	1307353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3537	NC_012125	CCT	2	6	1307358	1307363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3538	NC_012125	TG	3	6	1307405	1307410	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_012125	TGTT	2	8	1307464	1307471	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_012125	CGT	2	6	1307472	1307477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3541	NC_012125	GGCAG	2	10	1309097	1309106	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3542	NC_012125	TAT	2	6	1309119	1309124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_012125	ACT	2	6	1309964	1309969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3544	NC_012125	ATG	2	6	1310069	1310074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_012125	GCATG	2	10	1310135	1310144	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3546	NC_012125	CCA	2	6	1310176	1310181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3547	NC_012125	GCATG	2	10	1310253	1310262	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3548	NC_012125	CCA	2	6	1310294	1310299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3549	NC_012125	GTTT	2	8	1310380	1310387	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_012125	GCT	2	6	1310391	1310396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3551	NC_012125	TTA	2	6	1310447	1310452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_012125	TA	3	6	1310464	1310469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_012125	ATG	2	6	1310470	1310475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_012125	A	6	6	1310513	1310518	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_012125	CTGGC	2	10	1310635	1310644	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3556	NC_012125	A	7	7	1312703	1312709	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_012125	AC	4	8	1314025	1314032	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3558	NC_012125	TAA	2	6	1314035	1314040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_012125	TACTG	2	10	1314085	1314094	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3560	NC_012125	ATGAAA	2	12	1314098	1314109	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_012125	GTC	2	6	1314163	1314168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3562	NC_012125	ATT	2	6	1314235	1314240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_012125	CAG	2	6	1315584	1315589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3564	NC_012125	TC	3	6	1315926	1315931	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3565	NC_012125	T	6	6	1316028	1316033	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_012125	AATA	2	8	1317055	1317062	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_012125	CGT	2	6	1317144	1317149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3568	NC_012125	TGC	2	6	1320177	1320182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3569	NC_012125	TGA	2	6	1320213	1320218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_012125	GTT	3	9	1320253	1320261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_012125	AGA	2	6	1320318	1320323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_012125	TGG	2	6	1321296	1321301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_012125	GT	3	6	1321329	1321334	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_012125	TGA	2	6	1321347	1321352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_012125	TCA	2	6	1321361	1321366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3576	NC_012125	T	7	7	1321415	1321421	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_012125	ATT	2	6	1321460	1321465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_012125	TCA	2	6	1321512	1321517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3579	NC_012125	ATTT	2	8	1321549	1321556	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_012125	ATT	2	6	1321733	1321738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_012125	TCG	2	6	1321767	1321772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3582	NC_012125	TACGT	2	10	1321780	1321789	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3583	NC_012125	TAA	2	6	1321812	1321817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_012125	TTTG	2	8	1321823	1321830	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_012125	T	6	6	1321879	1321884	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_012125	A	6	6	1321892	1321897	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_012125	GAA	2	6	1321921	1321926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_012125	CCA	2	6	1321953	1321958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3589	NC_012125	ATC	2	6	1323304	1323309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3590	NC_012125	AAATG	2	10	1323342	1323351	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3591	NC_012125	TC	3	6	1323378	1323383	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3592	NC_012125	ACTTAC	2	12	1323410	1323421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3593	NC_012125	AG	3	6	1323430	1323435	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_012125	ATT	2	6	1323463	1323468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_012125	TGA	2	6	1323627	1323632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_012125	CGC	2	6	1323648	1323653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3597	NC_012125	A	6	6	1323663	1323668	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_012125	CAG	2	6	1324269	1324274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3599	NC_012125	TACAA	2	10	1324291	1324300	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3600	NC_012125	TAA	2	6	1324305	1324310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_012125	CAT	2	6	1324321	1324326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3602	NC_012125	TTG	2	6	1324343	1324348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_012125	GCC	2	6	1324361	1324366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3604	NC_012125	CTG	2	6	1324399	1324404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3605	NC_012125	ACTT	2	8	1326120	1326127	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3606	NC_012125	TCA	2	6	1326136	1326141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3607	NC_012125	CAT	2	6	1326174	1326179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3608	NC_012125	CAGG	2	8	1326246	1326253	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3609	NC_012125	A	7	7	1326408	1326414	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_012125	AGG	2	6	1326517	1326522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_012125	TAT	2	6	1326523	1326528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_012125	ACTC	2	8	1326936	1326943	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3613	NC_012125	GCC	2	6	1326948	1326953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3614	NC_012125	ATT	2	6	1326968	1326973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_012125	TA	3	6	1326979	1326984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_012125	ATAG	2	8	1326997	1327004	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_012125	AGG	2	6	1328475	1328480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_012125	GAA	2	6	1328523	1328528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_012125	GTG	2	6	1328591	1328596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_012125	ATT	2	6	1328605	1328610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_012125	TGC	2	6	1328655	1328660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3622	NC_012125	TTA	2	6	1328706	1328711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_012125	GTT	2	6	1328722	1328727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_012125	GTT	2	6	1328832	1328837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3625	NC_012125	ACA	3	9	1333336	1333344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3626	NC_012125	CAT	2	6	1333398	1333403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3627	NC_012125	TTA	2	6	1333417	1333422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3628	NC_012125	TAA	2	6	1333491	1333496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3629	NC_012125	CGA	2	6	1333510	1333515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3630	NC_012125	TCA	2	6	1333534	1333539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3631	NC_012125	GAC	2	6	1334552	1334557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3632	NC_012125	GCA	2	6	1334642	1334647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3633	NC_012125	AGA	2	6	1334648	1334653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3634	NC_012125	AATG	2	8	1334693	1334700	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3635	NC_012125	ATG	2	6	1334720	1334725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3641	NC_012125	TG	3	6	1335062	1335067	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3642	NC_012125	A	6	6	1335462	1335467	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3741	NC_012125	TGT	3	9	1344644	1344652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3752	NC_012125	TGT	2	6	1345275	1345280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3755	NC_012125	TCC	2	6	1345368	1345373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3874	NC_012125	CAT	2	6	1373715	1373720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3880	NC_012125	TTCTG	2	10	1373902	1373911	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3881	NC_012125	AGCA	2	8	1373925	1373932	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3882	NC_012125	TCCTT	2	10	1374013	1374022	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
3883	NC_012125	GAACAG	2	12	1374069	1374080	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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3889	NC_012125	GCC	2	6	1374438	1374443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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