MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi C strain RKS4594 chromosome

Total Repeats: 15617

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_012125	TCT	2	6	4520739	4520744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14502	NC_012125	GCA	2	6	4520746	4520751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14503	NC_012125	CTC	2	6	4520822	4520827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14504	NC_012125	CAG	2	6	4520867	4520872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14505	NC_012125	GCG	2	6	4520887	4520892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14506	NC_012125	TCC	2	6	4520944	4520949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14507	NC_012125	CAA	2	6	4521140	4521145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14508	NC_012125	GAA	2	6	4521178	4521183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14509	NC_012125	TGA	2	6	4521304	4521309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14510	NC_012125	ATC	2	6	4521321	4521326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14511	NC_012125	TGG	2	6	4521360	4521365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14512	NC_012125	GGC	2	6	4521388	4521393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14513	NC_012125	TGTC	2	8	4521505	4521512	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14514	NC_012125	CAG	2	6	4523248	4523253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14515	NC_012125	CTT	2	6	4523280	4523285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14516	NC_012125	ACC	2	6	4523353	4523358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14517	NC_012125	TCTG	2	8	4523921	4523928	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14518	NC_012125	T	9	9	4523929	4523937	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14519	NC_012125	TTC	2	6	4524471	4524476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14520	NC_012125	TCT	2	6	4524490	4524495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14521	NC_012125	CCG	2	6	4524538	4524543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14522	NC_012125	AGG	2	6	4525037	4525042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14523	NC_012125	A	7	7	4527144	4527150	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14524	NC_012125	CCA	2	6	4527167	4527172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14525	NC_012125	CCA	2	6	4527182	4527187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14526	NC_012125	CTG	2	6	4527239	4527244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14527	NC_012125	T	8	8	4527287	4527294	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14528	NC_012125	TCT	2	6	4527921	4527926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14529	NC_012125	G	6	6	4527929	4527934	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14530	NC_012125	C	6	6	4527945	4527950	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14531	NC_012125	GGA	2	6	4527952	4527957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14532	NC_012125	A	6	6	4527968	4527973	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14533	NC_012125	CTG	2	6	4527988	4527993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14534	NC_012125	TCC	2	6	4527998	4528003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14535	NC_012125	TGT	2	6	4528019	4528024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14536	NC_012125	GGT	2	6	4528049	4528054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14537	NC_012125	TC	3	6	4528114	4528119	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14538	NC_012125	ATG	2	6	4528648	4528653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14539	NC_012125	ACA	2	6	4529086	4529091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14540	NC_012125	GCA	2	6	4529107	4529112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14541	NC_012125	G	6	6	4529385	4529390	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14542	NC_012125	T	6	6	4532461	4532466	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14543	NC_012125	TGG	2	6	4532493	4532498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14544	NC_012125	ATT	2	6	4532520	4532525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14545	NC_012125	ATG	2	6	4532545	4532550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14546	NC_012125	TGA	2	6	4532655	4532660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14547	NC_012125	TGAGC	2	10	4532685	4532694	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
14548	NC_012125	ACGG	2	8	4532832	4532839	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14549	NC_012125	TCA	2	6	4535765	4535770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14550	NC_012125	ATG	2	6	4535817	4535822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14551	NC_012125	G	6	6	4535833	4535838	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14552	NC_012125	ATT	2	6	4536296	4536301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14553	NC_012125	TTA	2	6	4536319	4536324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14554	NC_012125	GTCT	2	8	4537779	4537786	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14555	NC_012125	TG	3	6	4541465	4541470	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14556	NC_012125	GAA	2	6	4541501	4541506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14557	NC_012125	TTG	2	6	4541559	4541564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14558	NC_012125	GAA	2	6	4541568	4541573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14559	NC_012125	CAC	2	6	4541633	4541638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14560	NC_012125	TCT	2	6	4541809	4541814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14561	NC_012125	TA	3	6	4542057	4542062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14562	NC_012125	TTA	2	6	4542067	4542072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14563	NC_012125	ATA	2	6	4542091	4542096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14564	NC_012125	ATC	2	6	4542129	4542134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14565	NC_012125	AT	3	6	4542142	4542147	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14566	NC_012125	AAC	2	6	4542252	4542257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14567	NC_012125	ATT	2	6	4542280	4542285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14568	NC_012125	ATT	3	9	4544241	4544249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14569	NC_012125	TTA	2	6	4544333	4544338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14570	NC_012125	TCC	2	6	4544379	4544384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14571	NC_012125	T	6	6	4544953	4544958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14572	NC_012125	TG	4	8	4545002	4545009	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14573	NC_012125	AGA	2	6	4545020	4545025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14574	NC_012125	A	7	7	4545042	4545048	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14575	NC_012125	TCT	2	6	4545109	4545114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14576	NC_012125	AT	3	6	4545119	4545124	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14577	NC_012125	CGT	2	6	4545143	4545148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14578	NC_012125	TGA	2	6	4545167	4545172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14579	NC_012125	G	6	6	4545203	4545208	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14580	NC_012125	CTA	2	6	4545239	4545244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14581	NC_012125	CACC	2	8	4545273	4545280	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
14582	NC_012125	GGT	2	6	4545407	4545412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14583	NC_012125	CGA	2	6	4545454	4545459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14584	NC_012125	TAC	2	6	4545469	4545474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14585	NC_012125	CTT	3	9	4545536	4545544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14586	NC_012125	CTT	2	6	4545578	4545583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14587	NC_012125	GCCA	2	8	4545623	4545630	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14588	NC_012125	CGA	2	6	4545638	4545643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14589	NC_012125	CGC	2	6	4545739	4545744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14590	NC_012125	TTCG	2	8	4545804	4545811	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14591	NC_012125	A	6	6	4545837	4545842	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14592	NC_012125	ACGG	2	8	4545876	4545883	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14593	NC_012125	GTT	2	6	4545908	4545913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14594	NC_012125	TGA	2	6	4546119	4546124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14595	NC_012125	TTCAT	2	10	4546158	4546167	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
14596	NC_012125	CTGA	2	8	4546192	4546199	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14597	NC_012125	GT	3	6	4546220	4546225	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14598	NC_012125	T	6	6	4546227	4546232	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14599	NC_012125	T	6	6	4547207	4547212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14600	NC_012125	ATT	2	6	4547275	4547280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14601	NC_012125	T	6	6	4547316	4547321	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14602	NC_012125	A	6	6	4547384	4547389	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14603	NC_012125	ACC	2	6	4547462	4547467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14604	NC_012125	GGT	2	6	4547594	4547599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14605	NC_012125	T	6	6	4547633	4547638	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14606	NC_012125	TCT	2	6	4547769	4547774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14607	NC_012125	TCGT	2	8	4547787	4547794	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14608	NC_012125	TCGC	2	8	4547796	4547803	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14609	NC_012125	ACC	2	6	4548231	4548236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14610	NC_012125	AGG	2	6	4548289	4548294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14611	NC_012125	TAC	2	6	4548711	4548716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14612	NC_012125	GGCT	2	8	4548732	4548739	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14613	NC_012125	GTT	2	6	4548750	4548755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14614	NC_012125	T	6	6	4548870	4548875	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14615	NC_012125	AGG	2	6	4548917	4548922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14616	NC_012125	TAT	2	6	4548944	4548949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14617	NC_012125	CGT	2	6	4548960	4548965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14618	NC_012125	TTGTT	2	10	4548982	4548991	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
14619	NC_012125	GAA	2	6	4549260	4549265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14620	NC_012125	ACA	2	6	4549686	4549691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14621	NC_012125	ATG	2	6	4549702	4549707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14622	NC_012125	ACC	2	6	4550020	4550025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14623	NC_012125	T	7	7	4550618	4550624	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14624	NC_012125	TAA	2	6	4553615	4553620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14625	NC_012125	AG	3	6	4553624	4553629	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14626	NC_012125	T	8	8	4554592	4554599	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14627	NC_012125	TGA	2	6	4555018	4555023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14629	NC_012125	TTC	2	6	4555369	4555374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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