MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi C strain RKS4594 chromosome

Total Repeats: 15617

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_012125	CGC	2	6	4391153	4391158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14002	NC_012125	GGA	2	6	4391160	4391165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14003	NC_012125	TGGC	2	8	4391214	4391221	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14004	NC_012125	CGT	2	6	4391271	4391276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14005	NC_012125	ATG	2	6	4391427	4391432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14006	NC_012125	CT	3	6	4391722	4391727	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14007	NC_012125	GCC	2	6	4391732	4391737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14008	NC_012125	GCT	2	6	4392316	4392321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14009	NC_012125	AT	3	6	4392348	4392353	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14010	NC_012125	AAC	2	6	4392414	4392419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14011	NC_012125	ATA	2	6	4392496	4392501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14012	NC_012125	T	6	6	4393884	4393889	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14013	NC_012125	TTAT	2	8	4393900	4393907	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14014	NC_012125	CAC	2	6	4394937	4394942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14015	NC_012125	TA	3	6	4394973	4394978	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14016	NC_012125	GCC	2	6	4395044	4395049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14017	NC_012125	ATT	2	6	4395379	4395384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14018	NC_012125	TACA	2	8	4395431	4395438	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14019	NC_012125	A	7	7	4395446	4395452	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14020	NC_012125	TCC	2	6	4396483	4396488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14021	NC_012125	CGG	2	6	4399076	4399081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14022	NC_012125	GCGCTT	2	12	4399090	4399101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14023	NC_012125	CGC	2	6	4399148	4399153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14024	NC_012125	TCT	2	6	4399193	4399198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14025	NC_012125	TGT	2	6	4400497	4400502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14026	NC_012125	ATC	2	6	4400504	4400509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14027	NC_012125	T	6	6	4400513	4400518	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14028	NC_012125	TCCT	2	8	4400539	4400546	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14029	NC_012125	T	6	6	4400578	4400583	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14030	NC_012125	TAA	2	6	4400600	4400605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14031	NC_012125	T	6	6	4401375	4401380	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14032	NC_012125	TGC	2	6	4401431	4401436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14033	NC_012125	GTTT	2	8	4401453	4401460	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
14034	NC_012125	AGGA	2	8	4401463	4401470	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14035	NC_012125	GGC	2	6	4403069	4403074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14036	NC_012125	ATG	2	6	4403126	4403131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14037	NC_012125	GCG	2	6	4403154	4403159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14038	NC_012125	A	6	6	4406778	4406783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14039	NC_012125	CTG	2	6	4406821	4406826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14040	NC_012125	TAT	2	6	4406863	4406868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14041	NC_012125	A	6	6	4406887	4406892	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14042	NC_012125	CAT	2	6	4406953	4406958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14043	NC_012125	TTAA	2	8	4407114	4407121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14044	NC_012125	TGA	2	6	4407139	4407144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14045	NC_012125	ATATG	2	10	4407151	4407160	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14046	NC_012125	TA	3	6	4407217	4407222	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14047	NC_012125	A	6	6	4407222	4407227	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14048	NC_012125	CGG	2	6	4407462	4407467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14049	NC_012125	TGA	2	6	4407483	4407488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14050	NC_012125	T	6	6	4407492	4407497	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14051	NC_012125	TAT	2	6	4407527	4407532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14052	NC_012125	TAGT	2	8	4407544	4407551	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14053	NC_012125	AAT	2	6	4407554	4407559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14054	NC_012125	A	6	6	4407576	4407581	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14055	NC_012125	TTAA	2	8	4407594	4407601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14056	NC_012125	AGA	2	6	4411138	4411143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14057	NC_012125	ATC	2	6	4411151	4411156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14058	NC_012125	AATAT	2	10	4412415	4412424	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14059	NC_012125	AGC	2	6	4431216	4431221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14060	NC_012125	GGT	2	6	4431239	4431244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14061	NC_012125	TAA	2	6	4431251	4431256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14062	NC_012125	A	6	6	4431255	4431260	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14063	NC_012125	T	6	6	4431282	4431287	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14064	NC_012125	GGC	2	6	4431376	4431381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14065	NC_012125	TCA	2	6	4431384	4431389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14066	NC_012125	GC	3	6	4431432	4431437	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14067	NC_012125	ACATC	2	10	4431854	4431863	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
14068	NC_012125	TGTTTC	2	12	4431881	4431892	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14069	NC_012125	T	6	6	4431949	4431954	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14070	NC_012125	T	6	6	4431973	4431978	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14071	NC_012125	TAT	2	6	4432026	4432031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14072	NC_012125	TAC	2	6	4432032	4432037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14073	NC_012125	T	8	8	4432045	4432052	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14074	NC_012125	TTAT	2	8	4432084	4432091	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14075	NC_012125	AAAG	2	8	4432094	4432101	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14076	NC_012125	CCTG	2	8	4432168	4432175	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14077	NC_012125	GA	4	8	4432182	4432189	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14078	NC_012125	TTA	2	6	4432200	4432205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14079	NC_012125	CAA	2	6	4432294	4432299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14080	NC_012125	AAT	2	6	4432308	4432313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14081	NC_012125	TTG	2	6	4434247	4434252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14082	NC_012125	ATTCG	2	10	4434266	4434275	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
14083	NC_012125	GTTT	2	8	4434851	4434858	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
14084	NC_012125	GTCTTT	2	12	4434862	4434873	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14085	NC_012125	AGG	2	6	4434894	4434899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14086	NC_012125	C	6	6	4434917	4434922	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14087	NC_012125	GTG	2	6	4434936	4434941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14088	NC_012125	TGTAAG	2	12	4434965	4434976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14089	NC_012125	CGA	2	6	4434977	4434982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14090	NC_012125	T	6	6	4435009	4435014	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14091	NC_012125	TAGT	2	8	4435051	4435058	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14092	NC_012125	TTG	2	6	4435806	4435811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14093	NC_012125	T	8	8	4435940	4435947	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14094	NC_012125	T	6	6	4435984	4435989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14095	NC_012125	GCG	2	6	4435990	4435995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14096	NC_012125	CGA	2	6	4436065	4436070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14097	NC_012125	ATA	2	6	4436071	4436076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14098	NC_012125	GCG	2	6	4437472	4437477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14099	NC_012125	TTTTCA	2	12	4437489	4437500	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14100	NC_012125	GAA	2	6	4437532	4437537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14101	NC_012125	GCC	2	6	4439306	4439311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14102	NC_012125	TCC	2	6	4441425	4441430	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14103	NC_012125	GGA	2	6	4441444	4441449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14104	NC_012125	TTA	2	6	4443137	4443142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14105	NC_012125	CGCC	2	8	4443163	4443170	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14106	NC_012125	AATCAC	2	12	4443199	4443210	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14107	NC_012125	CCAG	2	8	4443267	4443274	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14108	NC_012125	TCT	2	6	4443385	4443390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14109	NC_012125	TCAT	2	8	4443409	4443416	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14110	NC_012125	CG	3	6	4443476	4443481	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14111	NC_012125	TGC	2	6	4443503	4443508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14112	NC_012125	GCC	2	6	4443526	4443531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14113	NC_012125	T	6	6	4443563	4443568	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14114	NC_012125	GA	3	6	4443589	4443594	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14115	NC_012125	CGCGTT	2	12	4443626	4443637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14116	NC_012125	TGT	2	6	4445617	4445622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14117	NC_012125	TAA	2	6	4445639	4445644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14118	NC_012125	TAA	2	6	4445675	4445680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14119	NC_012125	AGC	2	6	4445734	4445739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14120	NC_012125	T	6	6	4445746	4445751	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14121	NC_012125	T	6	6	4445807	4445812	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14122	NC_012125	A	6	6	4445813	4445818	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14123	NC_012125	AG	3	6	4445844	4445849	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14124	NC_012125	TACA	2	8	4445888	4445895	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14125	NC_012125	ACA	2	6	4445913	4445918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14126	NC_012125	TAA	2	6	4445960	4445965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14127	NC_012125	A	6	6	4446000	4446005	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14128	NC_012125	CATTT	2	10	4448774	4448783	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
14129	NC_012125	T	6	6	4452547	4452552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14130	NC_012125	T	6	6	4452554	4452559	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14131	NC_012125	TG	3	6	4452573	4452578	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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