MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi C strain RKS4594 chromosome

Total Repeats: 15617

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_012125	GC	3	6	4223863	4223868	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13502	NC_012125	T	6	6	4223931	4223936	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13503	NC_012125	TTC	2	6	4223947	4223952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13504	NC_012125	AG	3	6	4223997	4224002	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13505	NC_012125	TTA	2	6	4224003	4224008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13506	NC_012125	GGC	2	6	4224145	4224150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13507	NC_012125	TCA	2	6	4224158	4224163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13508	NC_012125	CGAA	2	8	4225198	4225205	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13509	NC_012125	TCGT	2	8	4225253	4225260	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13510	NC_012125	A	7	7	4227342	4227348	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13511	NC_012125	CATT	2	8	4228294	4228301	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13512	NC_012125	AGCGC	2	10	4228338	4228347	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
13513	NC_012125	CTT	2	6	4231160	4231165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13514	NC_012125	A	6	6	4231186	4231191	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13515	NC_012125	ACCT	2	8	4231202	4231209	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13516	NC_012125	CAA	2	6	4231241	4231246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13517	NC_012125	CTA	2	6	4231279	4231284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13518	NC_012125	GTC	2	6	4231300	4231305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13519	NC_012125	A	7	7	4231337	4231343	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13520	NC_012125	GC	3	6	4231354	4231359	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13521	NC_012125	AGG	2	6	4231424	4231429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13522	NC_012125	TCG	2	6	4232295	4232300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13523	NC_012125	A	6	6	4234456	4234461	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13524	NC_012125	ATT	2	6	4234646	4234651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13525	NC_012125	GTT	2	6	4234654	4234659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13526	NC_012125	AT	3	6	4234681	4234686	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13527	NC_012125	AAATAT	2	12	4234711	4234722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13528	NC_012125	GTT	2	6	4234743	4234748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13529	NC_012125	TTTTA	2	10	4234763	4234772	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13530	NC_012125	TTTTAA	2	12	4234907	4234918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13531	NC_012125	TAT	2	6	4235622	4235627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13532	NC_012125	T	8	8	4235663	4235670	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13533	NC_012125	TGA	2	6	4235677	4235682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13534	NC_012125	ATT	2	6	4235693	4235698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13535	NC_012125	TAA	2	6	4238600	4238605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13536	NC_012125	CTT	2	6	4238642	4238647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13537	NC_012125	AAAG	2	8	4238680	4238687	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13538	NC_012125	TCA	2	6	4238728	4238733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13539	NC_012125	A	6	6	4238758	4238763	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13540	NC_012125	T	7	7	4238767	4238773	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13541	NC_012125	TTAA	2	8	4238840	4238847	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13542	NC_012125	TTGCA	2	10	4239534	4239543	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
13543	NC_012125	TGA	2	6	4239562	4239567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13544	NC_012125	AAGG	2	8	4240292	4240299	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13545	NC_012125	A	6	6	4240715	4240720	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13546	NC_012125	TCA	2	6	4242848	4242853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13547	NC_012125	GTT	2	6	4242878	4242883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13548	NC_012125	TC	3	6	4242926	4242931	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13549	NC_012125	ATG	2	6	4243515	4243520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13550	NC_012125	T	8	8	4243526	4243533	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13551	NC_012125	TTA	2	6	4243554	4243559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13552	NC_012125	TAC	2	6	4243585	4243590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13553	NC_012125	AGA	2	6	4243595	4243600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13554	NC_012125	GCCAG	2	10	4244536	4244545	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
13555	NC_012125	CCTGA	2	10	4244575	4244584	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
13556	NC_012125	CAG	2	6	4244592	4244597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13557	NC_012125	GC	3	6	4245673	4245678	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13558	NC_012125	GCC	2	6	4245742	4245747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13559	NC_012125	T	7	7	4245792	4245798	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13560	NC_012125	TCA	2	6	4245837	4245842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13561	NC_012125	CAACA	2	10	4245843	4245852	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
13562	NC_012125	TAT	2	6	4246880	4246885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13563	NC_012125	T	6	6	4246895	4246900	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13564	NC_012125	GTTA	2	8	4247844	4247851	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13565	NC_012125	CT	3	6	4247854	4247859	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13566	NC_012125	TGG	2	6	4247881	4247886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13567	NC_012125	TA	3	6	4247893	4247898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13568	NC_012125	CAT	2	6	4247924	4247929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13569	NC_012125	A	6	6	4247995	4248000	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13570	NC_012125	GCT	2	6	4248053	4248058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13572	NC_012125	GCT	2	6	4248212	4248217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13573	NC_012125	TTA	2	6	4248259	4248264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13574	NC_012125	GAT	2	6	4248362	4248367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13575	NC_012125	TGA	2	6	4248424	4248429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13576	NC_012125	TCG	2	6	4248457	4248462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13577	NC_012125	CTGG	2	8	4248479	4248486	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13578	NC_012125	TAA	2	6	4248493	4248498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13579	NC_012125	TCT	2	6	4248558	4248563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13580	NC_012125	CGT	2	6	4248603	4248608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13581	NC_012125	ATT	2	6	4248656	4248661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13582	NC_012125	GTT	2	6	4248668	4248673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13583	NC_012125	CTG	3	9	4248677	4248685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13584	NC_012125	GTTAT	2	10	4248693	4248702	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
13585	NC_012125	TTA	2	6	4248721	4248726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13586	NC_012125	TAT	2	6	4248734	4248739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13587	NC_012125	CGG	2	6	4248745	4248750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13588	NC_012125	CGT	2	6	4248784	4248789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13589	NC_012125	GAT	2	6	4248805	4248810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13590	NC_012125	ACC	2	6	4248815	4248820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13591	NC_012125	ATT	2	6	4248869	4248874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13592	NC_012125	GC	3	6	4248888	4248893	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13593	NC_012125	TTA	2	6	4248951	4248956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13594	NC_012125	TCT	2	6	4248960	4248965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13595	NC_012125	GAAAA	2	10	4249022	4249031	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
13596	NC_012125	GGC	2	6	4249061	4249066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13597	NC_012125	CTT	2	6	4249072	4249077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13598	NC_012125	CGGG	2	8	4249101	4249108	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13599	NC_012125	CTG	2	6	4249121	4249126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13600	NC_012125	GC	3	6	4249161	4249166	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13601	NC_012125	TGA	3	9	4249188	4249196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13602	NC_012125	GCT	2	6	4249231	4249236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13603	NC_012125	AAC	2	6	4249256	4249261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13604	NC_012125	AGG	2	6	4249309	4249314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13605	NC_012125	CTG	2	6	4251364	4251369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13606	NC_012125	CCTG	2	8	4252160	4252167	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13607	NC_012125	CGT	2	6	4252174	4252179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13608	NC_012125	A	6	6	4252190	4252195	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13609	NC_012125	TTCC	2	8	4252239	4252246	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13610	NC_012125	ATTGA	2	10	4254626	4254635	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13611	NC_012125	TTATT	2	10	4254644	4254653	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13612	NC_012125	ATC	2	6	4255729	4255734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13613	NC_012125	T	6	6	4255775	4255780	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13614	NC_012125	ACT	2	6	4255790	4255795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13615	NC_012125	A	6	6	4255820	4255825	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13616	NC_012125	GTCA	2	8	4255841	4255848	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13617	NC_012125	GAG	2	6	4261428	4261433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13618	NC_012125	GGC	2	6	4262553	4262558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13619	NC_012125	AGCGC	2	10	4262605	4262614	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
13620	NC_012125	ATTG	2	8	4262623	4262630	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13621	NC_012125	CATTT	2	10	4263400	4263409	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
13622	NC_012125	AGC	2	6	4263454	4263459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13624	NC_012125	TGA	2	6	4264699	4264704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13626	NC_012125	TTCG	2	8	4265526	4265533	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13627	NC_012125	CTAA	2	8	4265573	4265580	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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13629	NC_012125	GAG	2	6	4269125	4269130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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