MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi C strain RKS4594 chromosome

Total Repeats: 15617

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_012125	CGA	2	6	4074984	4074989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13002	NC_012125	GCA	2	6	4075058	4075063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13003	NC_012125	GAA	2	6	4075117	4075122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13004	NC_012125	GGA	2	6	4075153	4075158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13005	NC_012125	TAA	2	6	4075171	4075176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13006	NC_012125	GCA	2	6	4075179	4075184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13007	NC_012125	AGA	2	6	4075200	4075205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13008	NC_012125	CAG	2	6	4075226	4075231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13009	NC_012125	G	6	6	4075373	4075378	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13010	NC_012125	GGA	2	6	4075417	4075422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13011	NC_012125	GGC	2	6	4075437	4075442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13012	NC_012125	GAA	2	6	4075680	4075685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13013	NC_012125	TGC	2	6	4075756	4075761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13014	NC_012125	GTC	2	6	4075768	4075773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13015	NC_012125	TTG	2	6	4075829	4075834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13016	NC_012125	GGA	2	6	4075881	4075886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13017	NC_012125	TCA	2	6	4075906	4075911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13018	NC_012125	AC	3	6	4075932	4075937	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13019	NC_012125	CGT	2	6	4076000	4076005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13020	NC_012125	AC	3	6	4076101	4076106	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13021	NC_012125	GTAG	2	8	4076142	4076149	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13022	NC_012125	CCT	2	6	4076242	4076247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13023	NC_012125	AAG	2	6	4076255	4076260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13024	NC_012125	CA	3	6	4076277	4076282	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13025	NC_012125	TGA	2	6	4076290	4076295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13026	NC_012125	CGG	2	6	4076373	4076378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13027	NC_012125	TG	3	6	4076423	4076428	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13028	NC_012125	AAC	2	6	4076526	4076531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13029	NC_012125	GTT	2	6	4076536	4076541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13030	NC_012125	TC	3	6	4076548	4076553	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13031	NC_012125	GCG	2	6	4076846	4076851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13032	NC_012125	GAG	2	6	4076862	4076867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13033	NC_012125	TG	3	6	4076887	4076892	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13034	NC_012125	GC	3	6	4076914	4076919	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13035	NC_012125	G	6	6	4077007	4077012	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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13038	NC_012125	GTAC	2	8	4077121	4077128	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13039	NC_012125	TG	3	6	4077153	4077158	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13040	NC_012125	GGA	2	6	4077328	4077333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13041	NC_012125	AC	3	6	4077546	4077551	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13042	NC_012125	CGTC	2	8	4077564	4077571	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13043	NC_012125	AAC	2	6	4077583	4077588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13047	NC_012125	GTT	2	6	4077782	4077787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13048	NC_012125	G	6	6	4078024	4078029	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13049	NC_012125	GT	4	8	4078082	4078089	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13050	NC_012125	TGA	2	6	4078125	4078130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13051	NC_012125	CAA	2	6	4078152	4078157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13052	NC_012125	GGT	2	6	4078224	4078229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13053	NC_012125	GA	3	6	4078254	4078259	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13054	NC_012125	AGTC	2	8	4078350	4078357	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13055	NC_012125	GCTG	2	8	4078368	4078375	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13056	NC_012125	TTA	2	6	4078383	4078388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13059	NC_012125	ACC	2	6	4078778	4078783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13060	NC_012125	TGG	2	6	4078838	4078843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13061	NC_012125	TCC	2	6	4078864	4078869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13062	NC_012125	GGA	2	6	4078881	4078886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13063	NC_012125	AGG	2	6	4078919	4078924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13064	NC_012125	GGT	2	6	4079001	4079006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13065	NC_012125	CGG	2	6	4079088	4079093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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13068	NC_012125	G	6	6	4079246	4079251	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13069	NC_012125	GAC	3	9	4079428	4079436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13070	NC_012125	GT	3	6	4079450	4079455	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13071	NC_012125	GA	3	6	4079537	4079542	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13072	NC_012125	TCAGAT	2	12	4079554	4079565	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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13074	NC_012125	GGT	2	6	4079621	4079626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13075	NC_012125	CCTG	2	8	4079801	4079808	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13076	NC_012125	CCGT	2	8	4079836	4079843	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13077	NC_012125	TC	3	6	4079918	4079923	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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13079	NC_012125	T	9	9	4079962	4079970	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13083	NC_012125	TGTTT	2	10	4080911	4080920	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
13084	NC_012125	CCT	2	6	4082879	4082884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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13087	NC_012125	T	8	8	4083373	4083380	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13088	NC_012125	GAG	2	6	4083399	4083404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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13091	NC_012125	AAT	2	6	4086342	4086347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13092	NC_012125	GTA	2	6	4086394	4086399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13093	NC_012125	GTGA	2	8	4086410	4086417	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13094	NC_012125	TAAA	2	8	4086467	4086474	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13095	NC_012125	AAAGT	2	10	4089901	4089910	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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13099	NC_012125	G	6	6	4093354	4093359	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13100	NC_012125	GCC	2	6	4093418	4093423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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13102	NC_012125	TCT	2	6	4094190	4094195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13103	NC_012125	ATCC	2	8	4094218	4094225	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13104	NC_012125	AAGCG	2	10	4096285	4096294	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
13105	NC_012125	GCC	2	6	4097870	4097875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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13109	NC_012125	TTA	2	6	4099839	4099844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13110	NC_012125	T	6	6	4099877	4099882	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13111	NC_012125	GGA	2	6	4107266	4107271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13112	NC_012125	TGA	2	6	4114381	4114386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13113	NC_012125	AGC	2	6	4114391	4114396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13114	NC_012125	TGC	2	6	4114412	4114417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13116	NC_012125	GAT	2	6	4114435	4114440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13117	NC_012125	T	7	7	4114460	4114466	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13118	NC_012125	CAA	2	6	4114509	4114514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13119	NC_012125	TAC	2	6	4114540	4114545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13120	NC_012125	TTTA	2	8	4115998	4116005	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13121	NC_012125	TAT	2	6	4116038	4116043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13122	NC_012125	ATTT	2	8	4116141	4116148	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13123	NC_012125	GGT	2	6	4116164	4116169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13124	NC_012125	GTG	2	6	4116193	4116198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13125	NC_012125	C	8	8	4116363	4116370	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13126	NC_012125	CAC	2	6	4116374	4116379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13127	NC_012125	A	6	6	4116406	4116411	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13129	NC_012125	CGG	2	6	4116514	4116519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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13499	NC_012125	A	6	6	4222644	4222649	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13500	NC_012125	TATCAA	2	12	4222681	4222692	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

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