MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi C strain RKS4594 chromosome

Total Repeats: 15617

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_012125	TCA	2	6	3561938	3561943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11502	NC_012125	CT	3	6	3561956	3561961	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11503	NC_012125	ATTA	2	8	3561989	3561996	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11504	NC_012125	TA	3	6	3567747	3567752	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11505	NC_012125	TTA	3	9	3567770	3567778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11506	NC_012125	GAT	2	6	3567837	3567842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11507	NC_012125	TATT	2	8	3567882	3567889	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11508	NC_012125	CCA	2	6	3567890	3567895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11509	NC_012125	CAA	2	6	3567912	3567917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11510	NC_012125	A	7	7	3568120	3568126	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11511	NC_012125	T	7	7	3568142	3568148	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11512	NC_012125	GCCATC	2	12	3568215	3568226	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
11513	NC_012125	GCAA	2	8	3568229	3568236	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11514	NC_012125	ACTA	2	8	3571527	3571534	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11515	NC_012125	TTG	2	6	3573072	3573077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11516	NC_012125	TAC	2	6	3574753	3574758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11517	NC_012125	GCA	2	6	3574803	3574808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11518	NC_012125	TTG	2	6	3574908	3574913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11519	NC_012125	AAC	2	6	3574949	3574954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11520	NC_012125	GC	3	6	3574992	3574997	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11521	NC_012125	ATC	2	6	3575044	3575049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11522	NC_012125	GGCAA	2	10	3575068	3575077	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
11523	NC_012125	T	6	6	3575194	3575199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11524	NC_012125	TAC	2	6	3578593	3578598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11525	NC_012125	CG	3	6	3578599	3578604	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11526	NC_012125	A	6	6	3581204	3581209	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11527	NC_012125	T	6	6	3581224	3581229	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11528	NC_012125	CGC	2	6	3581287	3581292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11529	NC_012125	TTTA	2	8	3581934	3581941	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11530	NC_012125	TAA	2	6	3581955	3581960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11531	NC_012125	AATT	2	8	3581962	3581969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11532	NC_012125	TGG	2	6	3582033	3582038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11533	NC_012125	GCC	2	6	3584320	3584325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11534	NC_012125	AG	3	6	3585473	3585478	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11535	NC_012125	GCGCT	2	10	3586397	3586406	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
11536	NC_012125	GCC	2	6	3586454	3586459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11537	NC_012125	ATG	2	6	3588197	3588202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11538	NC_012125	ATT	2	6	3588213	3588218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11539	NC_012125	CAT	2	6	3588220	3588225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11540	NC_012125	CGT	2	6	3588241	3588246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11541	NC_012125	A	7	7	3588261	3588267	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11542	NC_012125	AG	3	6	3588271	3588276	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11543	NC_012125	CAA	2	6	3588390	3588395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11544	NC_012125	ATA	2	6	3588412	3588417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11545	NC_012125	CCG	2	6	3588419	3588424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11546	NC_012125	AACC	2	8	3588504	3588511	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11547	NC_012125	A	6	6	3588514	3588519	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11548	NC_012125	AT	4	8	3588537	3588544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11549	NC_012125	GGC	2	6	3590197	3590202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11550	NC_012125	GAA	2	6	3590228	3590233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11551	NC_012125	AGGG	2	8	3590234	3590241	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
11552	NC_012125	CAA	2	6	3592348	3592353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11553	NC_012125	GT	3	6	3592360	3592365	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11554	NC_012125	A	6	6	3592372	3592377	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11555	NC_012125	CAG	2	6	3592444	3592449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11557	NC_012125	AAG	2	6	3593028	3593033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11558	NC_012125	TGGC	2	8	3593053	3593060	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11559	NC_012125	GCCA	2	8	3593067	3593074	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11560	NC_012125	CTT	2	6	3595478	3595483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11561	NC_012125	CTTT	2	8	3595516	3595523	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11562	NC_012125	T	6	6	3595521	3595526	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11563	NC_012125	TTAA	2	8	3595560	3595567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11564	NC_012125	ATTA	2	8	3595589	3595596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11565	NC_012125	TTA	2	6	3595602	3595607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11566	NC_012125	TTAA	2	8	3595620	3595627	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11567	NC_012125	AAAT	2	8	3595677	3595684	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11568	NC_012125	TGT	2	6	3595780	3595785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11569	NC_012125	ATT	2	6	3595788	3595793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11570	NC_012125	GCC	2	6	3595830	3595835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11571	NC_012125	C	6	6	3595834	3595839	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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11574	NC_012125	CGC	2	6	3602106	3602111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11575	NC_012125	CTT	3	9	3602149	3602157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11576	NC_012125	TGCC	2	8	3602196	3602203	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11577	NC_012125	AAC	2	6	3602337	3602342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11578	NC_012125	GTC	2	6	3602351	3602356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11579	NC_012125	CAAAG	2	10	3602379	3602388	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
11580	NC_012125	GCA	2	6	3603744	3603749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11581	NC_012125	GCGCT	2	10	3603773	3603782	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
11582	NC_012125	ATA	2	6	3603806	3603811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11583	NC_012125	TAA	2	6	3608336	3608341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11584	NC_012125	AAC	2	6	3608342	3608347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11585	NC_012125	TCC	3	9	3608382	3608390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11586	NC_012125	AGGG	2	8	3608402	3608409	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
11587	NC_012125	AGG	2	6	3608410	3608415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11588	NC_012125	CGC	2	6	3608442	3608447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11589	NC_012125	GCG	2	6	3608599	3608604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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11591	NC_012125	TAAT	2	8	3608625	3608632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11592	NC_012125	GAT	2	6	3608666	3608671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11593	NC_012125	ATT	2	6	3608681	3608686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11594	NC_012125	T	6	6	3608748	3608753	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11595	NC_012125	ATTA	2	8	3608850	3608857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11596	NC_012125	A	8	8	3608866	3608873	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11597	NC_012125	C	6	6	3608882	3608887	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11598	NC_012125	ATATTG	2	12	3611669	3611680	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11599	NC_012125	GCC	2	6	3611716	3611721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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11601	NC_012125	GTT	2	6	3612283	3612288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11602	NC_012125	CAA	2	6	3614670	3614675	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11603	NC_012125	CCA	2	6	3614808	3614813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11604	NC_012125	GAT	2	6	3614855	3614860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11605	NC_012125	CGCGC	2	10	3614895	3614904	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
11606	NC_012125	CGGTA	2	10	3616687	3616696	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11607	NC_012125	CAG	2	6	3616760	3616765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11609	NC_012125	CTCG	2	8	3616812	3616819	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11610	NC_012125	AAG	2	6	3616835	3616840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11611	NC_012125	GTC	2	6	3616871	3616876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11612	NC_012125	GCCT	2	8	3616925	3616932	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11613	NC_012125	CAC	2	6	3616993	3616998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11614	NC_012125	CTG	2	6	3617020	3617025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11615	NC_012125	CTG	2	6	3617030	3617035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11616	NC_012125	GC	3	6	3617042	3617047	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11617	NC_012125	CGC	3	9	3617076	3617084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11618	NC_012125	A	6	6	3617087	3617092	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11619	NC_012125	ATT	2	6	3617123	3617128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11620	NC_012125	GACCTC	2	12	3617129	3617140	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
11621	NC_012125	GAG	2	6	3617183	3617188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11622	NC_012125	GAT	2	6	3617242	3617247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11625	NC_012125	GA	3	6	3617467	3617472	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11626	NC_012125	GCT	2	6	3617485	3617490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11628	NC_012125	TGT	2	6	3617511	3617516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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