MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi C strain RKS4594 chromosome

Total Repeats: 15617

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_012125	TCC	2	6	3197623	3197628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10502	NC_012125	C	7	7	3197627	3197633	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10503	NC_012125	CGC	2	6	3197636	3197641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10504	NC_012125	GCC	2	6	3202030	3202035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10505	NC_012125	GAT	2	6	3203103	3203108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10506	NC_012125	ATA	2	6	3203119	3203124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10507	NC_012125	GTTG	2	8	3203127	3203134	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10508	NC_012125	AAAAG	2	10	3204410	3204419	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
10509	NC_012125	AGTT	2	8	3206284	3206291	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10510	NC_012125	TGC	2	6	3206351	3206356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10511	NC_012125	AAT	2	6	3206372	3206377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10512	NC_012125	ACA	2	6	3207835	3207840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10513	NC_012125	CTGG	2	8	3208961	3208968	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10514	NC_012125	GAGTA	2	10	3212635	3212644	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
10515	NC_012125	TGT	2	6	3212749	3212754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10516	NC_012125	A	7	7	3212799	3212805	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10517	NC_012125	GAAA	2	8	3212807	3212814	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10518	NC_012125	ATA	2	6	3212998	3213003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10519	NC_012125	AAC	2	6	3213758	3213763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10520	NC_012125	GTG	2	6	3213767	3213772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10521	NC_012125	GAA	2	6	3213799	3213804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10522	NC_012125	CAC	2	6	3213921	3213926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10523	NC_012125	T	6	6	3213933	3213938	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10524	NC_012125	ATT	2	6	3214004	3214009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10525	NC_012125	ATA	2	6	3214053	3214058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10526	NC_012125	TAA	2	6	3216422	3216427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10527	NC_012125	CCT	2	6	3217279	3217284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10528	NC_012125	TTC	2	6	3217315	3217320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10529	NC_012125	AT	3	6	3217323	3217328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10530	NC_012125	AAT	2	6	3218263	3218268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10531	NC_012125	TGT	2	6	3220057	3220062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10532	NC_012125	GGCA	2	8	3220071	3220078	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10533	NC_012125	A	6	6	3221579	3221584	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10534	NC_012125	TAA	2	6	3221591	3221596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10535	NC_012125	ATT	2	6	3221603	3221608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10536	NC_012125	T	6	6	3221607	3221612	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10537	NC_012125	ATTT	2	8	3221644	3221651	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10538	NC_012125	A	6	6	3221664	3221669	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10539	NC_012125	ATT	2	6	3221688	3221693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10540	NC_012125	AT	3	6	3222527	3222532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10541	NC_012125	ACC	2	6	3222545	3222550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10542	NC_012125	TAT	2	6	3224632	3224637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10543	NC_012125	ACA	2	6	3224639	3224644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10544	NC_012125	TTTA	2	8	3224669	3224676	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10545	NC_012125	GGCA	2	8	3224678	3224685	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10546	NC_012125	TAAA	2	8	3224724	3224731	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10547	NC_012125	TCA	2	6	3226528	3226533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10549	NC_012125	TGA	2	6	3226675	3226680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10550	NC_012125	T	6	6	3226712	3226717	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10551	NC_012125	ATC	2	6	3226806	3226811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10552	NC_012125	GCAG	2	8	3226838	3226845	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10553	NC_012125	CTG	2	6	3226919	3226924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10554	NC_012125	CG	3	6	3227007	3227012	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10555	NC_012125	TCAG	2	8	3227026	3227033	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10556	NC_012125	AG	3	6	3227116	3227121	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10557	NC_012125	GTC	2	6	3227159	3227164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10558	NC_012125	CTG	2	6	3227276	3227281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10559	NC_012125	GGGA	2	8	3227479	3227486	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
10560	NC_012125	GCG	2	6	3227492	3227497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10561	NC_012125	TGC	2	6	3227578	3227583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10562	NC_012125	CTC	2	6	3227633	3227638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10563	NC_012125	A	6	6	3227682	3227687	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10564	NC_012125	TGC	2	6	3227730	3227735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10565	NC_012125	GAA	2	6	3227756	3227761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10568	NC_012125	CTGT	2	8	3227880	3227887	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10569	NC_012125	TGC	2	6	3227953	3227958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10570	NC_012125	GT	3	6	3227961	3227966	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10571	NC_012125	TACGC	2	10	3227991	3228000	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10572	NC_012125	TGA	2	6	3228118	3228123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10576	NC_012125	T	7	7	3228240	3228246	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10577	NC_012125	GCCCG	2	10	3228268	3228277	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
10578	NC_012125	TTCC	2	8	3228281	3228288	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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10583	NC_012125	TTA	2	6	3229218	3229223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10585	NC_012125	TGA	2	6	3229298	3229303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10591	NC_012125	A	7	7	3229698	3229704	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10592	NC_012125	A	6	6	3229738	3229743	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10593	NC_012125	T	6	6	3231798	3231803	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10595	NC_012125	TTTA	2	8	3231851	3231858	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10598	NC_012125	ATT	2	6	3231942	3231947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10599	NC_012125	AAT	2	6	3231961	3231966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10600	NC_012125	A	6	6	3233425	3233430	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10601	NC_012125	CAAT	2	8	3233491	3233498	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10602	NC_012125	GGC	2	6	3233527	3233532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10603	NC_012125	AAAT	2	8	3233556	3233563	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10604	NC_012125	AAAT	2	8	3233626	3233633	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10605	NC_012125	ATG	2	6	3233652	3233657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10609	NC_012125	AG	3	6	3238063	3238068	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10610	NC_012125	GCC	2	6	3238110	3238115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10611	NC_012125	AAAC	2	8	3238178	3238185	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10612	NC_012125	T	7	7	3238208	3238214	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10613	NC_012125	TGA	2	6	3238264	3238269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10621	NC_012125	AAT	3	9	3239609	3239617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10622	NC_012125	AAT	2	6	3239729	3239734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10624	NC_012125	AT	3	6	3239752	3239757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10625	NC_012125	AAT	2	6	3239909	3239914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10626	NC_012125	ATT	2	6	3239922	3239927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10627	NC_012125	ACA	2	6	3239978	3239983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10628	NC_012125	CGA	2	6	3240014	3240019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10630	NC_012125	TCG	2	6	3242030	3242035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10631	NC_012125	GCT	2	6	3242070	3242075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10632	NC_012125	ACC	2	6	3242089	3242094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10633	NC_012125	GTA	2	6	3242999	3243004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10634	NC_012125	GTC	2	6	3243007	3243012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10635	NC_012125	CTG	2	6	3243030	3243035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10643	NC_012125	TA	3	6	3251944	3251949	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10644	NC_012125	T	6	6	3251985	3251990	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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