MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi C strain RKS4594 chromosome

Total Repeats: 15617

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_012125	CGG	2	6	3042036	3042041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10002	NC_012125	AC	3	6	3042079	3042084	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10003	NC_012125	ACT	2	6	3042119	3042124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10004	NC_012125	ATA	2	6	3042131	3042136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10005	NC_012125	GGC	2	6	3048554	3048559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10006	NC_012125	GTC	2	6	3049730	3049735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10007	NC_012125	CGT	2	6	3051125	3051130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10008	NC_012125	GAC	2	6	3051171	3051176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10009	NC_012125	CAT	2	6	3051237	3051242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10010	NC_012125	CG	3	6	3051245	3051250	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10011	NC_012125	GGC	2	6	3051378	3051383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10012	NC_012125	CCT	2	6	3051390	3051395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10013	NC_012125	GCC	2	6	3051437	3051442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10014	NC_012125	TGG	2	6	3051630	3051635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10015	NC_012125	CG	3	6	3051667	3051672	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10016	NC_012125	CGC	2	6	3051717	3051722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10017	NC_012125	CAT	2	6	3051747	3051752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10018	NC_012125	T	7	7	3051835	3051841	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10019	NC_012125	GC	3	6	3051843	3051848	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10020	NC_012125	GCA	2	6	3051876	3051881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10021	NC_012125	CGC	2	6	3051882	3051887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10022	NC_012125	AGA	2	6	3052053	3052058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10023	NC_012125	AGC	2	6	3052148	3052153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10024	NC_012125	CAG	2	6	3052227	3052232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10025	NC_012125	CTG	2	6	3052252	3052257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10026	NC_012125	CAC	2	6	3052258	3052263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10027	NC_012125	GGCG	2	8	3052272	3052279	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10028	NC_012125	GAC	2	6	3052384	3052389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10029	NC_012125	GC	3	6	3052416	3052421	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10030	NC_012125	TAA	2	6	3052479	3052484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10031	NC_012125	TGA	2	6	3052571	3052576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10032	NC_012125	CCA	2	6	3052580	3052585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10033	NC_012125	GGT	2	6	3052629	3052634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10034	NC_012125	GCC	2	6	3052701	3052706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10035	NC_012125	GCCCA	2	10	3052750	3052759	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
10036	NC_012125	GAA	2	6	3052779	3052784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10037	NC_012125	GAT	2	6	3052803	3052808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10038	NC_012125	GC	3	6	3052884	3052889	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10039	NC_012125	ACG	2	6	3052908	3052913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10040	NC_012125	ATG	2	6	3052930	3052935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10041	NC_012125	CGC	2	6	3052946	3052951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10042	NC_012125	CG	3	6	3053012	3053017	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10043	NC_012125	TAA	2	6	3053045	3053050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10044	NC_012125	ATC	2	6	3053098	3053103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10045	NC_012125	CAG	2	6	3053115	3053120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10046	NC_012125	GC	3	6	3053192	3053197	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10047	NC_012125	TGA	3	9	3053282	3053290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10048	NC_012125	AGA	3	9	3053309	3053317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10049	NC_012125	CAGC	2	8	3053343	3053350	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10050	NC_012125	CCG	2	6	3053408	3053413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10051	NC_012125	AAG	2	6	3053468	3053473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10052	NC_012125	ACCA	2	8	3053487	3053494	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10053	NC_012125	AAT	2	6	3053520	3053525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10054	NC_012125	CAG	2	6	3053625	3053630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10055	NC_012125	GCC	2	6	3053634	3053639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10056	NC_012125	A	6	6	3053678	3053683	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10057	NC_012125	CAC	2	6	3053793	3053798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10058	NC_012125	CGC	2	6	3053838	3053843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10059	NC_012125	TTG	2	6	3053861	3053866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10060	NC_012125	A	6	6	3054203	3054208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10061	NC_012125	GCAA	2	8	3054296	3054303	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10062	NC_012125	G	6	6	3054325	3054330	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10063	NC_012125	ATG	2	6	3055935	3055940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10064	NC_012125	GAA	2	6	3055953	3055958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10065	NC_012125	A	8	8	3055963	3055970	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10066	NC_012125	GCA	2	6	3056007	3056012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10067	NC_012125	CTT	2	6	3056122	3056127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10068	NC_012125	CCG	2	6	3056154	3056159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10069	NC_012125	CTG	2	6	3056272	3056277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10070	NC_012125	TCA	2	6	3056283	3056288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10071	NC_012125	CGA	2	6	3056322	3056327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10072	NC_012125	GTT	2	6	3056424	3056429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10073	NC_012125	TA	3	6	3056431	3056436	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10074	NC_012125	TC	3	6	3056507	3056512	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10075	NC_012125	TC	3	6	3057084	3057089	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10076	NC_012125	T	7	7	3057996	3058002	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10077	NC_012125	TCA	2	6	3058046	3058051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10078	NC_012125	GCC	2	6	3059488	3059493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10079	NC_012125	AGC	2	6	3059494	3059499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10080	NC_012125	T	6	6	3059554	3059559	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10081	NC_012125	ATG	2	6	3059560	3059565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10082	NC_012125	ATC	2	6	3059566	3059571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10083	NC_012125	TCA	2	6	3059613	3059618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10084	NC_012125	CTT	2	6	3059652	3059657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10085	NC_012125	TTC	2	6	3059685	3059690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10086	NC_012125	T	7	7	3059807	3059813	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10087	NC_012125	AAG	2	6	3059844	3059849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10088	NC_012125	ATT	2	6	3059853	3059858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10089	NC_012125	TCA	2	6	3059887	3059892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10090	NC_012125	ATT	2	6	3059918	3059923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10091	NC_012125	TA	3	6	3059936	3059941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10092	NC_012125	T	6	6	3059980	3059985	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10093	NC_012125	TCC	2	6	3060019	3060024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10094	NC_012125	ACGGC	2	10	3060124	3060133	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10095	NC_012125	CGG	2	6	3060176	3060181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10096	NC_012125	TCA	3	9	3060193	3060201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10097	NC_012125	CTT	2	6	3060350	3060355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10098	NC_012125	CTG	2	6	3060372	3060377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10099	NC_012125	CCA	2	6	3060422	3060427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10100	NC_012125	CCG	3	9	3060441	3060449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10101	NC_012125	TTG	2	6	3060475	3060480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10102	NC_012125	ATG	2	6	3060483	3060488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10103	NC_012125	TCG	2	6	3060550	3060555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10104	NC_012125	TGC	2	6	3060565	3060570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10105	NC_012125	CGGCG	2	10	3060599	3060608	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
10106	NC_012125	TGGC	2	8	3060669	3060676	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10107	NC_012125	ATC	2	6	3060714	3060719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10108	NC_012125	TCC	2	6	3060720	3060725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10109	NC_012125	GAA	2	6	3060767	3060772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10110	NC_012125	CAT	2	6	3060800	3060805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10111	NC_012125	TTC	2	6	3060825	3060830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10112	NC_012125	ATC	2	6	3060933	3060938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10113	NC_012125	GAT	2	6	3060962	3060967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10114	NC_012125	TCCT	2	8	3060981	3060988	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10115	NC_012125	ACT	2	6	3060994	3060999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10116	NC_012125	GC	3	6	3061003	3061008	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10117	NC_012125	GGTAAA	2	12	3061047	3061058	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10118	NC_012125	CAA	2	6	3061070	3061075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10119	NC_012125	CAC	2	6	3061109	3061114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10120	NC_012125	GGC	2	6	3061166	3061171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10121	NC_012125	ATC	2	6	3061175	3061180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10122	NC_012125	GAT	2	6	3061183	3061188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10123	NC_012125	CGC	2	6	3062792	3062797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10124	NC_012125	TTG	2	6	3062808	3062813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10125	NC_012125	C	6	6	3062871	3062876	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10126	NC_012125	TTG	2	6	3063679	3063684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10127	NC_012125	GGC	2	6	3063691	3063696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10128	NC_012125	CT	4	8	3065588	3065595	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10129	NC_012125	ACA	2	6	3065611	3065616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10131	NC_012125	AAT	2	6	3065652	3065657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10132	NC_012125	ATC	2	6	3065674	3065679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10133	NC_012125	T	7	7	3065914	3065920	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10135	NC_012125	GCTCT	2	10	3065952	3065961	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
10136	NC_012125	CAT	2	6	3065981	3065986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10242	NC_012125	G	7	7	3122599	3122605	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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10247	NC_012125	A	6	6	3124993	3124998	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10248	NC_012125	TTAA	2	8	3125028	3125035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10252	NC_012125	ACAG	2	8	3129434	3129441	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10253	NC_012125	ATA	2	6	3130109	3130114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10256	NC_012125	AAT	2	6	3130202	3130207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10257	NC_012125	CGAT	2	8	3130328	3130335	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10258	NC_012125	AAT	2	6	3130356	3130361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10259	NC_012125	ACAG	2	8	3130409	3130416	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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10261	NC_012125	ATGT	2	8	3130461	3130468	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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10264	NC_012125	A	6	6	3130544	3130549	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10380	NC_012125	A	7	7	3163286	3163292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10383	NC_012125	TC	3	6	3165222	3165227	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10384	NC_012125	TGT	2	6	3165293	3165298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10499	NC_012125	T	7	7	3195774	3195780	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10500	NC_012125	CAG	2	6	3196798	3196803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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