MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi C strain RKS4594 chromosome

Total Repeats: 15617

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012125	AGA	2	6	181929	181934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
502	NC_012125	TGC	2	6	181959	181964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_012125	TCCT	2	8	185032	185039	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
504	NC_012125	A	6	6	185063	185068	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_012125	CTG	2	6	185089	185094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_012125	CAA	2	6	185142	185147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_012125	GAT	2	6	185166	185171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_012125	TGA	2	6	185218	185223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
509	NC_012125	A	6	6	185230	185235	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_012125	ATA	2	6	185314	185319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_012125	GC	3	6	185336	185341	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
512	NC_012125	GTC	2	6	185359	185364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_012125	GATG	2	8	185403	185410	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
514	NC_012125	CCG	2	6	185707	185712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
515	NC_012125	CATT	2	8	185752	185759	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
516	NC_012125	AAAT	2	8	185760	185767	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_012125	GT	3	6	185799	185804	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
518	NC_012125	AT	3	6	185866	185871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_012125	AAT	2	6	185899	185904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_012125	TTTTA	2	10	185920	185929	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_012125	CT	3	6	186394	186399	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
522	NC_012125	T	6	6	186490	186495	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_012125	T	6	6	186508	186513	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_012125	TTA	2	6	186519	186524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_012125	TTGA	2	8	186566	186573	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
526	NC_012125	TTTA	2	8	186590	186597	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_012125	CAA	2	6	186602	186607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_012125	TGA	2	6	190620	190625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
529	NC_012125	CCT	2	6	191431	191436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
530	NC_012125	A	7	7	192332	192338	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_012125	CAT	2	6	192347	192352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_012125	ATT	2	6	192381	192386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_012125	GGA	2	6	192403	192408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
534	NC_012125	CGA	2	6	192809	192814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_012125	TAT	2	6	192819	192824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_012125	TATTG	2	10	192852	192861	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
537	NC_012125	T	6	6	197063	197068	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_012125	TG	3	6	197096	197101	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
539	NC_012125	TCA	2	6	197106	197111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_012125	GAAT	2	8	197140	197147	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
541	NC_012125	GCG	2	6	197184	197189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_012125	TTA	2	6	197190	197195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_012125	ATT	2	6	198557	198562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_012125	AT	3	6	198569	198574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_012125	AAGT	2	8	198591	198598	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
546	NC_012125	GCTTC	2	10	200333	200342	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
547	NC_012125	AGCGC	2	10	204007	204016	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
548	NC_012125	ATAA	2	8	204018	204025	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_012125	TGA	2	6	204762	204767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
550	NC_012125	CCA	2	6	204800	204805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
551	NC_012125	GAT	2	6	205453	205458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
552	NC_012125	GAA	2	6	205470	205475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
553	NC_012125	AT	4	8	205509	205516	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_012125	ATT	2	6	205524	205529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_012125	GTTT	2	8	205539	205546	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
556	NC_012125	CAT	2	6	205682	205687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_012125	GGA	2	6	205706	205711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
558	NC_012125	GAC	2	6	206170	206175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_012125	T	6	6	206197	206202	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_012125	AT	3	6	206216	206221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_012125	CTT	2	6	207839	207844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_012125	TGA	2	6	208807	208812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
563	NC_012125	GCGCT	2	10	208825	208834	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
564	NC_012125	CGCGT	2	10	208877	208886	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
565	NC_012125	G	6	6	209757	209762	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
566	NC_012125	TAA	2	6	211722	211727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_012125	AG	3	6	211772	211777	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
568	NC_012125	CAT	2	6	211799	211804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_012125	CGC	2	6	211808	211813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
570	NC_012125	AACG	2	8	212812	212819	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
571	NC_012125	ACGC	2	8	213413	213420	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
572	NC_012125	TAA	2	6	213433	213438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_012125	GA	3	6	217272	217277	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
574	NC_012125	TCT	3	9	217280	217288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_012125	GTC	2	6	217289	217294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_012125	GAA	2	6	217300	217305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
577	NC_012125	ATAA	2	8	219985	219992	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_012125	TGA	2	6	226426	226431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
579	NC_012125	AAT	2	6	226454	226459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_012125	TAA	3	9	226548	226556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_012125	ATA	2	6	226577	226582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_012125	ATT	2	6	226587	226592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_012125	T	7	7	226591	226597	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_012125	TAA	2	6	226605	226610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_012125	A	6	6	226609	226614	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_012125	AAAT	2	8	226626	226633	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_012125	A	7	7	226652	226658	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_012125	T	6	6	226671	226676	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_012125	T	8	8	226678	226685	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_012125	AAAT	2	8	226703	226710	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_012125	TA	3	6	226726	226731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_012125	T	7	7	226753	226759	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_012125	T	7	7	226782	226788	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_012125	CTTG	2	8	226800	226807	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
595	NC_012125	TTTG	2	8	226809	226816	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
596	NC_012125	T	6	6	226817	226822	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_012125	TAT	2	6	226839	226844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_012125	TAAA	2	8	226863	226870	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_012125	A	6	6	226868	226873	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_012125	TTAT	2	8	226925	226932	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_012125	GTT	2	6	226939	226944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
602	NC_012125	CTT	2	6	226947	226952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_012125	ATATA	2	10	226986	226995	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_012125	CTA	2	6	226999	227004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_012125	TAA	2	6	227067	227072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_012125	ATC	2	6	227650	227655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_012125	A	7	7	227690	227696	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_012125	TA	3	6	227702	227707	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_012125	ATG	2	6	230403	230408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
610	NC_012125	TGC	2	6	230440	230445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_012125	GGC	2	6	230454	230459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_012125	GCC	2	6	230475	230480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
613	NC_012125	TCG	2	6	230626	230631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_012125	T	6	6	230728	230733	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_012125	CCG	2	6	230754	230759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
616	NC_012125	T	6	6	230812	230817	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_012125	CCGC	2	8	230819	230826	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
618	NC_012125	GCA	2	6	230849	230854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_012125	TAC	2	6	230922	230927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_012125	GTG	2	6	230928	230933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
621	NC_012125	CCAG	2	8	230967	230974	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
622	NC_012125	GC	3	6	231079	231084	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
623	NC_012125	ACA	2	6	231112	231117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_012125	A	8	8	233581	233588	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_012125	GGC	2	6	233596	233601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_012125	GTT	2	6	233621	233626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
627	NC_012125	TCT	2	6	235085	235090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_012125	AGGC	2	8	237691	237698	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
629	NC_012125	C	6	6	242402	242407	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
630	NC_012125	CGG	2	6	243664	243669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_012125	AT	3	6	243695	243700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_012125	AC	3	6	243740	243745	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
633	NC_012125	AAT	2	6	244167	244172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_012125	CCA	2	6	244194	244199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
635	NC_012125	A	6	6	244208	244213	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_012125	AGA	2	6	244228	244233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
637	NC_012125	GCG	2	6	244261	244266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_012125	AGG	2	6	245688	245693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
639	NC_012125	ATAA	2	8	246560	246567	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_012125	TGG	2	6	249271	249276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
641	NC_012125	AGT	2	6	249302	249307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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644	NC_012125	TCAG	2	8	250213	250220	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
645	NC_012125	T	6	6	250289	250294	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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653	NC_012125	GGC	2	6	251370	251375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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664	NC_012125	T	6	6	255472	255477	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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673	NC_012125	T	6	6	272315	272320	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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679	NC_012125	CTG	2	6	275355	275360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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681	NC_012125	CTT	2	6	275433	275438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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939	NC_012125	AAC	2	6	338088	338093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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941	NC_012125	GTCA	2	8	338342	338349	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
942	NC_012125	AGC	2	6	338398	338403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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952	NC_012125	CGCA	2	8	338921	338928	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
953	NC_012125	ACA	2	6	338967	338972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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981	NC_012125	AAT	2	6	341272	341277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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