MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi C strain RKS4594 chromosome

Total Repeats: 15617

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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9002	NC_012125	TCGGT	2	10	2798130	2798139	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
9003	NC_012125	CA	3	6	2798314	2798319	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9004	NC_012125	GTAC	2	8	2798344	2798351	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9005	NC_012125	GTCA	2	8	2798427	2798434	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9006	NC_012125	GGA	2	6	2798450	2798455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9007	NC_012125	C	6	6	2798460	2798465	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9008	NC_012125	CG	3	6	2798552	2798557	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9009	NC_012125	AC	3	6	2798579	2798584	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9010	NC_012125	CTC	2	6	2798605	2798610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9011	NC_012125	TCGC	2	8	2798616	2798623	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9012	NC_012125	GA	3	6	2798919	2798924	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9013	NC_012125	AAC	2	6	2798931	2798936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9014	NC_012125	GTT	2	6	2798941	2798946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9015	NC_012125	CA	3	6	2799044	2799049	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9016	NC_012125	CCG	2	6	2799094	2799099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9017	NC_012125	TCA	2	6	2799177	2799182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9018	NC_012125	TG	3	6	2799190	2799195	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9019	NC_012125	CTT	2	6	2799212	2799217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9020	NC_012125	TAAGG	2	10	2799218	2799227	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
9021	NC_012125	CTAC	2	8	2799323	2799330	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9022	NC_012125	GT	3	6	2799366	2799371	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9023	NC_012125	ACG	2	6	2799467	2799472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9024	NC_012125	GT	3	6	2799535	2799540	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9025	NC_012125	ATG	2	6	2799560	2799565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9026	NC_012125	TCC	2	6	2799586	2799591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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9030	NC_012125	TTC	2	6	2799787	2799792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9031	NC_012125	GCC	2	6	2800030	2800035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9032	NC_012125	TCC	2	6	2800050	2800055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9033	NC_012125	C	6	6	2800094	2800099	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9034	NC_012125	TGCG	2	8	2800182	2800189	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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9037	NC_012125	TGC	2	6	2800288	2800293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9039	NC_012125	TCC	2	6	2800314	2800319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9040	NC_012125	CTT	2	6	2800349	2800354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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9043	NC_012125	CAA	2	6	2800511	2800516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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9047	NC_012125	GCC	2	6	2800722	2800727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9048	NC_012125	CA	3	6	2800876	2800881	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9049	NC_012125	CTT	2	6	2801003	2801008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9050	NC_012125	CGG	2	6	2801027	2801032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9051	NC_012125	GTT	2	6	2801043	2801048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9053	NC_012125	TTA	2	6	2801078	2801083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9058	NC_012125	CTT	2	6	2806638	2806643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9059	NC_012125	AAT	2	6	2806688	2806693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9061	NC_012125	T	6	6	2807152	2807157	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9062	NC_012125	GTACT	2	10	2807182	2807191	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
9063	NC_012125	AAG	2	6	2807305	2807310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9064	NC_012125	T	6	6	2807331	2807336	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9065	NC_012125	A	6	6	2807346	2807351	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9066	NC_012125	A	6	6	2809407	2809412	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9069	NC_012125	GGCT	2	8	2810807	2810814	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9070	NC_012125	GGC	2	6	2810815	2810820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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9075	NC_012125	GC	4	8	2811153	2811160	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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9088	NC_012125	AAT	2	6	2812015	2812020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9097	NC_012125	A	6	6	2816087	2816092	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9099	NC_012125	GC	3	6	2816158	2816163	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9100	NC_012125	AT	3	6	2816240	2816245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9101	NC_012125	TC	3	6	2817610	2817615	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9102	NC_012125	CGC	2	6	2817638	2817643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9103	NC_012125	TGT	2	6	2817692	2817697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9105	NC_012125	ATC	2	6	2818623	2818628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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9107	NC_012125	AAT	2	6	2819951	2819956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9109	NC_012125	GAC	2	6	2820033	2820038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9110	NC_012125	CGT	2	6	2820044	2820049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9111	NC_012125	T	7	7	2820058	2820064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9112	NC_012125	CAACC	2	10	2820071	2820080	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
9113	NC_012125	TC	3	6	2820097	2820102	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9114	NC_012125	GTG	2	6	2820178	2820183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9115	NC_012125	TGAAGA	2	12	2820269	2820280	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9117	NC_012125	TCT	2	6	2820359	2820364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9118	NC_012125	TGAA	2	8	2820487	2820494	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9119	NC_012125	T	6	6	2820582	2820587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9120	NC_012125	A	7	7	2820593	2820599	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9121	NC_012125	A	6	6	2822247	2822252	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9122	NC_012125	T	6	6	2823971	2823976	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9123	NC_012125	CAA	2	6	2823999	2824004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9124	NC_012125	TGA	2	6	2824041	2824046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9125	NC_012125	TAT	2	6	2824053	2824058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9126	NC_012125	TGA	2	6	2824471	2824476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9127	NC_012125	TCA	2	6	2824485	2824490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9128	NC_012125	A	8	8	2825390	2825397	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9129	NC_012125	AGAT	2	8	2825452	2825459	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9130	NC_012125	TCA	2	6	2825469	2825474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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9132	NC_012125	CATG	2	8	2826064	2826071	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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9263	NC_012125	CGG	2	6	2832703	2832708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9264	NC_012125	CGT	2	6	2832785	2832790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9265	NC_012125	AACG	2	8	2832836	2832843	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9266	NC_012125	CGA	2	6	2832883	2832888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9267	NC_012125	ACG	2	6	2832930	2832935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9270	NC_012125	CGG	2	6	2833021	2833026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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9273	NC_012125	ATA	2	6	2833111	2833116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9274	NC_012125	CGG	2	6	2833145	2833150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9275	NC_012125	CGA	2	6	2833153	2833158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9281	NC_012125	GCT	2	6	2833541	2833546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9284	NC_012125	CGC	3	9	2833699	2833707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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9382	NC_012125	CTTAC	2	10	2842977	2842986	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
9383	NC_012125	A	7	7	2843070	2843076	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9384	NC_012125	ACG	2	6	2843086	2843091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9387	NC_012125	CT	3	6	2843131	2843136	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9388	NC_012125	TGG	2	6	2843485	2843490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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