MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi C strain RKS4594 chromosome

Total Repeats: 15617

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_012125	G	6	6	2650972	2650977	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8502	NC_012125	ACC	2	6	2650984	2650989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8503	NC_012125	GAC	2	6	2651026	2651031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8504	NC_012125	GAG	2	6	2651040	2651045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8505	NC_012125	C	7	7	2651077	2651083	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8506	NC_012125	AAGA	2	8	2651098	2651105	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8507	NC_012125	T	7	7	2651126	2651132	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8508	NC_012125	GGC	2	6	2651161	2651166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8509	NC_012125	AGCGC	2	10	2651199	2651208	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
8510	NC_012125	ACC	2	6	2651223	2651228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8511	NC_012125	AATT	2	8	2653684	2653691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8512	NC_012125	ATC	2	6	2653788	2653793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8513	NC_012125	GTCT	2	8	2653958	2653965	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8514	NC_012125	TAT	2	6	2653974	2653979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8515	NC_012125	GTTT	2	8	2654062	2654069	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8516	NC_012125	T	7	7	2654067	2654073	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8517	NC_012125	AATTT	2	10	2654081	2654090	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8518	NC_012125	ATCC	2	8	2654098	2654105	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8519	NC_012125	TCA	2	6	2654132	2654137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8520	NC_012125	TA	3	6	2654149	2654154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8521	NC_012125	TCA	3	9	2654177	2654185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8522	NC_012125	CAAAA	2	10	2654326	2654335	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
8523	NC_012125	TTATAA	2	12	2654348	2654359	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8524	NC_012125	CGA	2	6	2654384	2654389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8525	NC_012125	CTC	2	6	2654423	2654428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8526	NC_012125	TTA	2	6	2654500	2654505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8527	NC_012125	ATG	2	6	2654561	2654566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8528	NC_012125	AGA	2	6	2654593	2654598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8529	NC_012125	TTG	2	6	2654602	2654607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8530	NC_012125	TCA	2	6	2654628	2654633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8531	NC_012125	A	6	6	2654655	2654660	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8532	NC_012125	GAA	2	6	2655818	2655823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8533	NC_012125	TCA	2	6	2655843	2655848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8534	NC_012125	ATAATG	2	12	2655876	2655887	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8535	NC_012125	AAT	2	6	2655911	2655916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8536	NC_012125	AATA	2	8	2656017	2656024	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8537	NC_012125	CAA	2	6	2656025	2656030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8538	NC_012125	TAA	2	6	2656113	2656118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8539	NC_012125	TGC	2	6	2656128	2656133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8540	NC_012125	AACA	2	8	2656205	2656212	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8541	NC_012125	GCA	2	6	2656256	2656261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8542	NC_012125	AACAT	2	10	2656271	2656280	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
8543	NC_012125	AT	3	6	2656302	2656307	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8544	NC_012125	GAAAA	2	10	2657006	2657015	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
8545	NC_012125	AAT	2	6	2657051	2657056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8546	NC_012125	TAA	2	6	2657064	2657069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8547	NC_012125	TGG	2	6	2657174	2657179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8548	NC_012125	ATCGT	2	10	2657255	2657264	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8549	NC_012125	ATG	2	6	2657269	2657274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8550	NC_012125	CG	3	6	2658880	2658885	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8551	NC_012125	GC	3	6	2658927	2658932	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8552	NC_012125	TCC	3	9	2659007	2659015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8553	NC_012125	TTAC	2	8	2659017	2659024	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8554	NC_012125	T	7	7	2659032	2659038	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8555	NC_012125	GCTCT	2	10	2659058	2659067	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
8556	NC_012125	T	6	6	2660030	2660035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8557	NC_012125	CTG	2	6	2660046	2660051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8558	NC_012125	ACA	2	6	2660064	2660069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8559	NC_012125	GCTT	2	8	2660992	2660999	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8560	NC_012125	ACG	2	6	2661006	2661011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8561	NC_012125	CA	3	6	2661013	2661018	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8562	NC_012125	CAC	2	6	2661029	2661034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8563	NC_012125	ATG	2	6	2661067	2661072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8564	NC_012125	ACC	3	9	2661093	2661101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8565	NC_012125	GA	4	8	2661103	2661110	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8566	NC_012125	ACT	2	6	2661132	2661137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8567	NC_012125	AGTG	2	8	2661184	2661191	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8568	NC_012125	TAC	2	6	2661220	2661225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8569	NC_012125	ACA	2	6	2661231	2661236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8570	NC_012125	AAT	2	6	2661246	2661251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8571	NC_012125	CAA	2	6	2661253	2661258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8572	NC_012125	ATT	2	6	2661284	2661289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8573	NC_012125	ATT	2	6	2661325	2661330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8574	NC_012125	A	6	6	2661347	2661352	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8575	NC_012125	CTA	2	6	2661365	2661370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8576	NC_012125	ACC	2	6	2661388	2661393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8577	NC_012125	CT	3	6	2661450	2661455	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8578	NC_012125	ATT	2	6	2661473	2661478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8579	NC_012125	AT	3	6	2661586	2661591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8580	NC_012125	CAGG	2	8	2661722	2661729	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8581	NC_012125	CGC	2	6	2661737	2661742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8582	NC_012125	AAT	2	6	2661765	2661770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8583	NC_012125	ATTT	2	8	2663310	2663317	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8584	NC_012125	GGT	2	6	2663408	2663413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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8586	NC_012125	CT	3	6	2663488	2663493	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8587	NC_012125	T	6	6	2663498	2663503	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8588	NC_012125	AAAT	2	8	2663542	2663549	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8589	NC_012125	CTTT	2	8	2663578	2663585	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8590	NC_012125	T	7	7	2663583	2663589	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8591	NC_012125	CAGA	2	8	2663688	2663695	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8592	NC_012125	TTAA	2	8	2667689	2667696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8593	NC_012125	A	7	7	2668822	2668828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8594	NC_012125	CCG	2	6	2668829	2668834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8595	NC_012125	CGG	3	9	2668841	2668849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8596	NC_012125	TGT	2	6	2668892	2668897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8597	NC_012125	ATTA	2	8	2669338	2669345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8598	NC_012125	AGG	2	6	2669390	2669395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8599	NC_012125	AC	3	6	2669427	2669432	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8600	NC_012125	GAG	2	6	2669444	2669449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8601	NC_012125	AGG	2	6	2670063	2670068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8602	NC_012125	TTG	2	6	2671590	2671595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8603	NC_012125	T	6	6	2674714	2674719	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8604	NC_012125	GC	3	6	2675202	2675207	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8605	NC_012125	AAC	2	6	2675229	2675234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8606	NC_012125	TGTA	2	8	2675330	2675337	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8607	NC_012125	GAT	2	6	2675350	2675355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8609	NC_012125	GAA	2	6	2676850	2676855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8610	NC_012125	CT	3	6	2676878	2676883	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8611	NC_012125	ACA	2	6	2676967	2676972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8612	NC_012125	TAA	2	6	2676986	2676991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8613	NC_012125	GCC	2	6	2677013	2677018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8614	NC_012125	ATAAA	2	10	2677078	2677087	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8615	NC_012125	TTA	2	6	2677092	2677097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8616	NC_012125	A	6	6	2677097	2677102	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8617	NC_012125	A	6	6	2677126	2677131	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8618	NC_012125	TAC	2	6	2677623	2677628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8619	NC_012125	T	6	6	2677706	2677711	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8620	NC_012125	GAG	2	6	2677744	2677749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8621	NC_012125	ATC	2	6	2677859	2677864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8623	NC_012125	A	6	6	2677905	2677910	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8624	NC_012125	CAT	2	6	2677970	2677975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8625	NC_012125	TAC	2	6	2681273	2681278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8626	NC_012125	GCGCT	2	10	2681291	2681300	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
8627	NC_012125	T	6	6	2682108	2682113	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8628	NC_012125	TGC	3	9	2682945	2682953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8629	NC_012125	T	8	8	2683015	2683022	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8630	NC_012125	CTC	2	6	2687055	2687060	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8631	NC_012125	AT	3	6	2687091	2687096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8633	NC_012125	TGTGA	2	10	2687151	2687160	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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