MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi C strain RKS4594 chromosome

Total Repeats: 15617

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_012125	GATA	2	8	2382614	2382621	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7502	NC_012125	CTAA	2	8	2382631	2382638	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7503	NC_012125	TAC	2	6	2382705	2382710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7504	NC_012125	GC	3	6	2382729	2382734	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7505	NC_012125	GGCT	2	8	2382747	2382754	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7506	NC_012125	TGG	2	6	2382770	2382775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7507	NC_012125	CTC	2	6	2386127	2386132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7508	NC_012125	ATTT	2	8	2386196	2386203	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7509	NC_012125	CTT	2	6	2386214	2386219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7510	NC_012125	A	6	6	2386318	2386323	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7511	NC_012125	ATT	2	6	2386338	2386343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7512	NC_012125	TAAA	2	8	2386347	2386354	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7513	NC_012125	TTA	2	6	2386382	2386387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7514	NC_012125	TA	4	8	2386415	2386422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7515	NC_012125	TCT	2	6	2386461	2386466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7516	NC_012125	GCA	2	6	2389324	2389329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7517	NC_012125	TGA	2	6	2390009	2390014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7518	NC_012125	TCA	2	6	2390037	2390042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7519	NC_012125	TAG	2	6	2390117	2390122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7520	NC_012125	TTC	2	6	2390892	2390897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7521	NC_012125	A	7	7	2390932	2390938	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7522	NC_012125	A	7	7	2390958	2390964	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7523	NC_012125	GTC	2	6	2391021	2391026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7524	NC_012125	CGG	2	6	2392028	2392033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7525	NC_012125	TCG	2	6	2392326	2392331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7526	NC_012125	TCT	2	6	2392359	2392364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7527	NC_012125	TAT	2	6	2392408	2392413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7528	NC_012125	TGT	2	6	2394808	2394813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7529	NC_012125	CAA	3	9	2394821	2394829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7530	NC_012125	ATC	2	6	2394887	2394892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7531	NC_012125	T	6	6	2394897	2394902	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7532	NC_012125	TTG	2	6	2394942	2394947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7533	NC_012125	TCG	2	6	2399813	2399818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7534	NC_012125	AT	3	6	2399918	2399923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7535	NC_012125	ACA	2	6	2399925	2399930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7536	NC_012125	ATT	2	6	2399993	2399998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7537	NC_012125	CATT	2	8	2400001	2400008	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7538	NC_012125	ACA	2	6	2400059	2400064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7539	NC_012125	CCTGC	2	10	2402106	2402115	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
7540	NC_012125	CA	3	6	2402116	2402121	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7541	NC_012125	CAA	2	6	2404406	2404411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7542	NC_012125	CGC	2	6	2404429	2404434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7543	NC_012125	GCG	2	6	2404445	2404450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7544	NC_012125	TAA	2	6	2404478	2404483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7545	NC_012125	T	6	6	2404537	2404542	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7546	NC_012125	GC	3	6	2404562	2404567	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7547	NC_012125	CA	3	6	2404654	2404659	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7548	NC_012125	CAT	2	6	2404704	2404709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7549	NC_012125	GC	3	6	2404744	2404749	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7550	NC_012125	TCC	2	6	2404769	2404774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7551	NC_012125	AAGACT	2	12	2404783	2404794	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7552	NC_012125	TTG	2	6	2406214	2406219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7553	NC_012125	TG	3	6	2406218	2406223	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7554	NC_012125	AATT	2	8	2406224	2406231	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7555	NC_012125	A	6	6	2406237	2406242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7556	NC_012125	T	7	7	2406258	2406264	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7557	NC_012125	TAA	2	6	2406285	2406290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7558	NC_012125	A	7	7	2406289	2406295	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7559	NC_012125	AAG	2	6	2406332	2406337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7560	NC_012125	T	6	6	2406369	2406374	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7561	NC_012125	CTT	2	6	2406398	2406403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7562	NC_012125	A	7	7	2406438	2406444	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7563	NC_012125	A	6	6	2406457	2406462	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7564	NC_012125	TAA	2	6	2406769	2406774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7565	NC_012125	T	8	8	2406797	2406804	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7566	NC_012125	CA	3	6	2406816	2406821	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7567	NC_012125	TGTTAT	2	12	2406830	2406841	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7568	NC_012125	AGT	2	6	2406872	2406877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7569	NC_012125	GTT	2	6	2406901	2406906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7570	NC_012125	AATGC	2	10	2406987	2406996	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
7571	NC_012125	GCT	2	6	2407011	2407016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7572	NC_012125	GAC	2	6	2407020	2407025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7573	NC_012125	CG	3	6	2407032	2407037	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7574	NC_012125	ACA	2	6	2407051	2407056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7575	NC_012125	AGT	2	6	2407058	2407063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7576	NC_012125	GTAA	2	8	2407075	2407082	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7577	NC_012125	ATA	2	6	2407144	2407149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7578	NC_012125	ATT	2	6	2407157	2407162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7579	NC_012125	GCA	2	6	2407193	2407198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7580	NC_012125	GTT	2	6	2407224	2407229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7581	NC_012125	AATGC	2	10	2407310	2407319	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
7582	NC_012125	GCT	2	6	2407334	2407339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7583	NC_012125	TGC	2	6	2407348	2407353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7584	NC_012125	CG	3	6	2407355	2407360	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7585	NC_012125	ACA	2	6	2407374	2407379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7587	NC_012125	T	7	7	2407441	2407447	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7588	NC_012125	CGT	2	6	2407451	2407456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7589	NC_012125	CCT	2	6	2408476	2408481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7590	NC_012125	CGA	2	6	2408504	2408509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7591	NC_012125	AAC	2	6	2408532	2408537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7592	NC_012125	CTGT	2	8	2408611	2408618	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7593	NC_012125	TCA	2	6	2412278	2412283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7594	NC_012125	CAA	2	6	2414238	2414243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7595	NC_012125	TTA	2	6	2414264	2414269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7596	NC_012125	GACA	2	8	2414298	2414305	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7597	NC_012125	A	6	6	2414305	2414310	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7598	NC_012125	TAA	2	6	2414331	2414336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7599	NC_012125	TAAT	2	8	2414399	2414406	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7600	NC_012125	GCG	2	6	2414426	2414431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7601	NC_012125	T	6	6	2414446	2414451	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7602	NC_012125	T	6	6	2415922	2415927	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7603	NC_012125	GAAAA	2	10	2415937	2415946	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
7604	NC_012125	AAT	2	6	2416043	2416048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7605	NC_012125	AG	3	6	2416056	2416061	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7606	NC_012125	T	8	8	2416093	2416100	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7607	NC_012125	GGC	2	6	2416173	2416178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7608	NC_012125	TGT	2	6	2419985	2419990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7609	NC_012125	GCGAGC	2	12	2420011	2420022	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
7610	NC_012125	TGT	2	6	2420071	2420076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7611	NC_012125	T	7	7	2420083	2420089	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7612	NC_012125	TCA	2	6	2420148	2420153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7613	NC_012125	GGC	2	6	2421351	2421356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7614	NC_012125	GCC	2	6	2421360	2421365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7615	NC_012125	CGC	2	6	2421429	2421434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7616	NC_012125	CTA	2	6	2421512	2421517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7617	NC_012125	AAC	2	6	2421576	2421581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7618	NC_012125	TG	3	6	2421589	2421594	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7619	NC_012125	T	9	9	2421623	2421631	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7620	NC_012125	CAG	2	6	2422123	2422128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7621	NC_012125	TACAA	2	10	2422145	2422154	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
7622	NC_012125	TAA	2	6	2422159	2422164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7623	NC_012125	CAT	2	6	2422175	2422180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7624	NC_012125	TTG	2	6	2422197	2422202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7625	NC_012125	GCC	2	6	2422215	2422220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7626	NC_012125	CTG	2	6	2422253	2422258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7627	NC_012125	T	6	6	2422950	2422955	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7628	NC_012125	ATA	2	6	2423020	2423025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7629	NC_012125	GGT	2	6	2423068	2423073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7630	NC_012125	T	6	6	2423091	2423096	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7632	NC_012125	CA	3	6	2423519	2423524	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7633	NC_012125	CCTG	2	8	2423562	2423569	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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