MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi C strain RKS4594 chromosome

Total Repeats: 15617

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_012125	AT	3	6	2233459	2233464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7002	NC_012125	AAAG	2	8	2233470	2233477	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7003	NC_012125	TCA	2	6	2233499	2233504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7004	NC_012125	A	6	6	2233508	2233513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7005	NC_012125	ACA	2	6	2233552	2233557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7006	NC_012125	AGC	2	6	2233590	2233595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7007	NC_012125	T	6	6	2233611	2233616	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7008	NC_012125	TGA	2	6	2234106	2234111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7009	NC_012125	GCTC	2	8	2234131	2234138	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7010	NC_012125	TGCC	2	8	2234153	2234160	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7011	NC_012125	TCA	2	6	2234256	2234261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7012	NC_012125	AAT	2	6	2234290	2234295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7013	NC_012125	GA	3	6	2234327	2234332	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7014	NC_012125	TAT	2	6	2234340	2234345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7015	NC_012125	TTAT	2	8	2234389	2234396	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7016	NC_012125	ATT	2	6	2234400	2234405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7017	NC_012125	TG	3	6	2234774	2234779	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7018	NC_012125	TCT	2	6	2234826	2234831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7019	NC_012125	TTC	2	6	2235761	2235766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7020	NC_012125	TGT	2	6	2235770	2235775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7021	NC_012125	GTGG	2	8	2240153	2240160	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
7022	NC_012125	T	6	6	2242288	2242293	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7023	NC_012125	GCG	2	6	2245453	2245458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7024	NC_012125	ATC	2	6	2245486	2245491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7025	NC_012125	TAG	2	6	2245516	2245521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7026	NC_012125	GTG	2	6	2245615	2245620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7027	NC_012125	GAT	2	6	2245632	2245637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7028	NC_012125	TGC	2	6	2246661	2246666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7029	NC_012125	CGA	2	6	2246962	2246967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7030	NC_012125	T	7	7	2246986	2246992	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7031	NC_012125	GCGTG	2	10	2246999	2247008	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
7032	NC_012125	TGC	2	6	2247009	2247014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7033	NC_012125	AGGGA	2	10	2247074	2247083	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
7034	NC_012125	T	6	6	2247104	2247109	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7035	NC_012125	ATA	2	6	2247167	2247172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7036	NC_012125	ATA	2	6	2247188	2247193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7037	NC_012125	AGC	2	6	2247207	2247212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7038	NC_012125	C	6	6	2247212	2247217	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7039	NC_012125	GGT	2	6	2247337	2247342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7040	NC_012125	TGT	2	6	2247357	2247362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7041	NC_012125	GAA	2	6	2247376	2247381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7042	NC_012125	CGC	2	6	2247406	2247411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7043	NC_012125	CAA	2	6	2247487	2247492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7044	NC_012125	TGG	2	6	2247574	2247579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7045	NC_012125	CGG	2	6	2247817	2247822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7046	NC_012125	ATT	2	6	2247887	2247892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7047	NC_012125	CAA	2	6	2247948	2247953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7048	NC_012125	GAA	2	6	2247974	2247979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7049	NC_012125	TGA	2	6	2248018	2248023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7050	NC_012125	AAC	2	6	2248059	2248064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7051	NC_012125	T	6	6	2248090	2248095	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7052	NC_012125	T	7	7	2248113	2248119	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7053	NC_012125	CGG	2	6	2248231	2248236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7054	NC_012125	TGCTC	2	10	2248273	2248282	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
7055	NC_012125	GCG	2	6	2248319	2248324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7056	NC_012125	TGT	2	6	2248441	2248446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7057	NC_012125	AG	3	6	2248462	2248467	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7058	NC_012125	CGG	2	6	2248471	2248476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7059	NC_012125	CATG	2	8	2248480	2248487	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7060	NC_012125	AT	3	6	2248497	2248502	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7061	NC_012125	CTGG	2	8	2248574	2248581	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7062	NC_012125	GCTATC	2	12	2248583	2248594	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7063	NC_012125	ATG	2	6	2249093	2249098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7064	NC_012125	TCT	2	6	2249109	2249114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7065	NC_012125	CCTG	2	8	2249127	2249134	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7066	NC_012125	TAAT	2	8	2249222	2249229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7067	NC_012125	CCG	2	6	2249255	2249260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7068	NC_012125	TTGT	2	8	2250416	2250423	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7069	NC_012125	AT	3	6	2250440	2250445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7070	NC_012125	TAAT	2	8	2250478	2250485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7071	NC_012125	TAA	2	6	2250506	2250511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7072	NC_012125	CA	3	6	2250719	2250724	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7073	NC_012125	GTT	2	6	2250733	2250738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7074	NC_012125	CTA	2	6	2250759	2250764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7075	NC_012125	ATG	2	6	2250797	2250802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7076	NC_012125	ACTA	2	8	2250808	2250815	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7077	NC_012125	CCAG	2	8	2253784	2253791	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7078	NC_012125	GTC	2	6	2253852	2253857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7079	NC_012125	GCC	2	6	2253883	2253888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7080	NC_012125	AC	3	6	2255771	2255776	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7081	NC_012125	A	6	6	2258084	2258089	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7082	NC_012125	ATA	2	6	2258111	2258116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7083	NC_012125	AAT	2	6	2258132	2258137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7084	NC_012125	AGG	2	6	2258169	2258174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7085	NC_012125	CTG	2	6	2259508	2259513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7086	NC_012125	TAA	2	6	2259514	2259519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7087	NC_012125	CAGT	2	8	2259620	2259627	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7088	NC_012125	CTT	2	6	2259641	2259646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7089	NC_012125	ATTT	2	8	2259675	2259682	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7090	NC_012125	TAC	2	6	2259709	2259714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7091	NC_012125	CTT	2	6	2259725	2259730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7092	NC_012125	TAA	2	6	2259822	2259827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7093	NC_012125	AAGT	2	8	2259834	2259841	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7094	NC_012125	ACA	3	9	2259848	2259856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7095	NC_012125	ACAA	2	8	2259898	2259905	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7096	NC_012125	ACT	2	6	2259925	2259930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7097	NC_012125	TTC	2	6	2260592	2260597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7098	NC_012125	CCCTG	2	10	2261637	2261646	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
7099	NC_012125	T	7	7	2261654	2261660	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7100	NC_012125	A	8	8	2261682	2261689	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7101	NC_012125	AACT	2	8	2261691	2261698	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7102	NC_012125	TGT	2	6	2261702	2261707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7103	NC_012125	AT	3	6	2261735	2261740	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7104	NC_012125	GCT	2	6	2261752	2261757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7105	NC_012125	GCT	2	6	2261806	2261811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7106	NC_012125	GCG	2	6	2262214	2262219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7107	NC_012125	AG	3	6	2262229	2262234	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7108	NC_012125	CCG	2	6	2262304	2262309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7109	NC_012125	TCG	2	6	2262430	2262435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7110	NC_012125	CAT	2	6	2262545	2262550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7111	NC_012125	TCA	2	6	2262572	2262577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7112	NC_012125	GCG	2	6	2262589	2262594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7113	NC_012125	GC	3	6	2262621	2262626	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7114	NC_012125	CGC	2	6	2262656	2262661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7115	NC_012125	GC	4	8	2262665	2262672	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7116	NC_012125	GC	3	6	2262698	2262703	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7117	NC_012125	ACC	2	6	2262730	2262735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7118	NC_012125	GC	3	6	2262737	2262742	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7119	NC_012125	TAA	2	6	2262749	2262754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7120	NC_012125	CCA	3	9	2262872	2262880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7121	NC_012125	CGCC	2	8	2262929	2262936	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7122	NC_012125	TGC	2	6	2262943	2262948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7123	NC_012125	GACG	2	8	2262990	2262997	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7124	NC_012125	TTCT	2	8	2264560	2264567	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7125	NC_012125	CAT	2	6	2264590	2264595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7126	NC_012125	AAT	2	6	2264623	2264628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7127	NC_012125	GC	3	6	2267612	2267617	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7128	NC_012125	ATTA	2	8	2267784	2267791	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7129	NC_012125	A	6	6	2268247	2268252	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7130	NC_012125	T	7	7	2268917	2268923	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7131	NC_012125	CCG	2	6	2268947	2268952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7132	NC_012125	TCT	2	6	2268989	2268994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7134	NC_012125	AGC	2	6	2269257	2269262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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