MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi C strain RKS4594 chromosome

Total Repeats: 15617

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_012125	ATT	2	6	2118217	2118222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6502	NC_012125	TCC	2	6	2118845	2118850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6503	NC_012125	AGA	2	6	2119931	2119936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6504	NC_012125	TCT	2	6	2119964	2119969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6505	NC_012125	AAC	2	6	2120601	2120606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6506	NC_012125	AGA	2	6	2121796	2121801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6507	NC_012125	CG	3	6	2121877	2121882	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6508	NC_012125	TTG	2	6	2121895	2121900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6509	NC_012125	A	6	6	2121910	2121915	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6510	NC_012125	TGAA	2	8	2123253	2123260	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6511	NC_012125	AGA	2	6	2123315	2123320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6512	NC_012125	AAT	2	6	2124181	2124186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6513	NC_012125	TGA	2	6	2124200	2124205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6514	NC_012125	ATTT	2	8	2124233	2124240	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6515	NC_012125	GTT	2	6	2124241	2124246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6516	NC_012125	TC	3	6	2124813	2124818	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6517	NC_012125	AG	3	6	2124939	2124944	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6518	NC_012125	GGA	2	6	2125054	2125059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6519	NC_012125	CG	3	6	2125668	2125673	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6520	NC_012125	TAA	2	6	2125737	2125742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6521	NC_012125	ATT	2	6	2126052	2126057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6522	NC_012125	TGG	2	6	2126083	2126088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6523	NC_012125	ATT	2	6	2126142	2126147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6524	NC_012125	TGG	2	6	2126172	2126177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6525	NC_012125	GAA	2	6	2126216	2126221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6526	NC_012125	GCA	2	6	2126238	2126243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6527	NC_012125	AAT	2	6	2126277	2126282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6528	NC_012125	GGA	2	6	2126321	2126326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6529	NC_012125	AAC	2	6	2126386	2126391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6530	NC_012125	GGC	2	6	2126393	2126398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6531	NC_012125	GC	3	6	2126397	2126402	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6532	NC_012125	CAG	2	6	2126430	2126435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6533	NC_012125	GCC	2	6	2126457	2126462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6534	NC_012125	GGC	2	6	2126477	2126482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6535	NC_012125	ATA	2	6	2126503	2126508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6536	NC_012125	ATTG	2	8	2126639	2126646	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6537	NC_012125	CGG	2	6	2126686	2126691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6538	NC_012125	GCGG	2	8	2126702	2126709	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6539	NC_012125	GTG	2	6	2126733	2126738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6540	NC_012125	GGC	2	6	2126777	2126782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6541	NC_012125	A	6	6	2126783	2126788	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6542	NC_012125	GCC	2	6	2126835	2126840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6543	NC_012125	AGG	2	6	2126848	2126853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6544	NC_012125	A	7	7	2126857	2126863	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6545	NC_012125	TTG	2	6	2126875	2126880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6546	NC_012125	TGA	2	6	2126905	2126910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6547	NC_012125	CCA	3	9	2126920	2126928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6548	NC_012125	CTT	2	6	2127028	2127033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6549	NC_012125	AGCC	2	8	2127093	2127100	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6550	NC_012125	ATA	2	6	2127176	2127181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6551	NC_012125	T	6	6	2127213	2127218	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6552	NC_012125	GA	3	6	2127257	2127262	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6553	NC_012125	A	6	6	2128335	2128340	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6554	NC_012125	TC	4	8	2128393	2128400	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6555	NC_012125	T	6	6	2128456	2128461	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6556	NC_012125	ACG	2	6	2128490	2128495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6557	NC_012125	T	9	9	2128515	2128523	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6558	NC_012125	TTA	2	6	2128600	2128605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6559	NC_012125	CGC	2	6	2128694	2128699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6560	NC_012125	GAA	2	6	2128705	2128710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6561	NC_012125	CTG	2	6	2128758	2128763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6562	NC_012125	CAGC	2	8	2131338	2131345	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6563	NC_012125	CGA	2	6	2131381	2131386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6564	NC_012125	ATC	2	6	2131463	2131468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6565	NC_012125	GAT	3	9	2131842	2131850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6566	NC_012125	CT	3	6	2131866	2131871	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6567	NC_012125	CCT	2	6	2132328	2132333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6568	NC_012125	TGC	2	6	2132404	2132409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6569	NC_012125	AAT	2	6	2132475	2132480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6570	NC_012125	AAT	2	6	2132554	2132559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6571	NC_012125	AAT	2	6	2132566	2132571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6572	NC_012125	TAT	2	6	2132614	2132619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6573	NC_012125	T	7	7	2132770	2132776	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6574	NC_012125	A	6	6	2136350	2136355	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6575	NC_012125	GCG	2	6	2136874	2136879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6576	NC_012125	CA	3	6	2138452	2138457	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6577	NC_012125	A	6	6	2138480	2138485	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6578	NC_012125	AAT	2	6	2138491	2138496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6579	NC_012125	CATA	2	8	2138504	2138511	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6580	NC_012125	AAT	2	6	2138517	2138522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6581	NC_012125	GGC	2	6	2138563	2138568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6582	NC_012125	T	7	7	2141865	2141871	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6583	NC_012125	CTG	2	6	2142012	2142017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6584	NC_012125	CGT	2	6	2142034	2142039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6585	NC_012125	TTG	2	6	2143088	2143093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6586	NC_012125	AT	3	6	2143130	2143135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6587	NC_012125	ATT	2	6	2143153	2143158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6588	NC_012125	AAC	2	6	2143160	2143165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6589	NC_012125	A	7	7	2143168	2143174	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6590	NC_012125	TGC	2	6	2143229	2143234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6591	NC_012125	CGA	2	6	2147158	2147163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6592	NC_012125	AGG	2	6	2147202	2147207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6593	NC_012125	ACC	2	6	2148049	2148054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6594	NC_012125	ATT	2	6	2148073	2148078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6595	NC_012125	TGT	2	6	2148094	2148099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6596	NC_012125	TTCA	2	8	2148112	2148119	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6597	NC_012125	ACT	2	6	2148694	2148699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6598	NC_012125	AGG	2	6	2148786	2148791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6599	NC_012125	TAT	2	6	2148814	2148819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6600	NC_012125	AAATA	2	10	2148835	2148844	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6601	NC_012125	TC	3	6	2149596	2149601	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6602	NC_012125	AAT	2	6	2149606	2149611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6603	NC_012125	AAC	2	6	2149628	2149633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6604	NC_012125	GTGA	2	8	2149663	2149670	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6605	NC_012125	CGA	2	6	2149682	2149687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6606	NC_012125	ATA	3	9	2149736	2149744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6607	NC_012125	ATT	2	6	2149770	2149775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6608	NC_012125	TAAT	2	8	2149785	2149792	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6609	NC_012125	ATA	2	6	2149824	2149829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6610	NC_012125	GAA	2	6	2149849	2149854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6611	NC_012125	ATT	2	6	2149881	2149886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6612	NC_012125	TTTA	2	8	2149930	2149937	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6613	NC_012125	ACCT	2	8	2149943	2149950	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6614	NC_012125	TGGCAG	2	12	2150009	2150020	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
6615	NC_012125	CACTG	2	10	2150031	2150040	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6616	NC_012125	A	6	6	2150044	2150049	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6617	NC_012125	CCG	2	6	2150177	2150182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6618	NC_012125	ACCA	2	8	2150186	2150193	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6619	NC_012125	AT	3	6	2150234	2150239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6620	NC_012125	TTA	2	6	2150348	2150353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6621	NC_012125	AAT	2	6	2150370	2150375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6622	NC_012125	CAT	2	6	2150400	2150405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6623	NC_012125	TTA	2	6	2150468	2150473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6624	NC_012125	AAT	2	6	2150492	2150497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6625	NC_012125	T	7	7	2150533	2150539	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6626	NC_012125	GTAA	2	8	2150546	2150553	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6627	NC_012125	GGA	2	6	2150567	2150572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6628	NC_012125	GAA	3	9	2150587	2150595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6629	NC_012125	CGAT	2	8	2150600	2150607	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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6631	NC_012125	ATG	2	6	2150630	2150635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6895	NC_012125	TAA	2	6	2223333	2223338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6896	NC_012125	AT	3	6	2223340	2223345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6897	NC_012125	ATTTT	2	10	2223375	2223384	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6898	NC_012125	GTA	2	6	2223387	2223392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6899	NC_012125	GATT	2	8	2223395	2223402	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6900	NC_012125	TAA	2	6	2223414	2223419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6901	NC_012125	TA	3	6	2223441	2223446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6902	NC_012125	CATTA	2	10	2223466	2223475	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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6934	NC_012125	CTG	2	6	2225903	2225908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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