MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi C strain RKS4594 chromosome

Total Repeats: 15617

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_012125	T	7	7	1977098	1977104	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_012125	AT	3	6	1978063	1978068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_012125	AGAA	2	8	1979598	1979605	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_012125	ATAA	2	8	1979616	1979623	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_012125	CTA	2	6	1980018	1980023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6006	NC_012125	AGCCAA	2	12	1981768	1981779	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6007	NC_012125	T	6	6	1983320	1983325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_012125	GGCA	2	8	1983350	1983357	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6009	NC_012125	AATT	2	8	1983434	1983441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_012125	GGC	2	6	1983467	1983472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6011	NC_012125	GTC	2	6	1983539	1983544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6012	NC_012125	CGG	2	6	1983549	1983554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6013	NC_012125	CGCTCC	2	12	1983719	1983730	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
6014	NC_012125	AG	3	6	1986444	1986449	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_012125	CG	3	6	1992090	1992095	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6016	NC_012125	AAT	2	6	1992144	1992149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_012125	A	6	6	1992153	1992158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_012125	GT	3	6	1992192	1992197	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_012125	AGG	2	6	1992364	1992369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_012125	GAG	2	6	1992370	1992375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_012125	AAG	2	6	1992392	1992397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_012125	TGA	2	6	1992407	1992412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_012125	TA	3	6	1992417	1992422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_012125	GTG	2	6	1992428	1992433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_012125	A	6	6	1992452	1992457	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_012125	AAGAA	2	10	1993751	1993760	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_012125	CGC	2	6	1994028	1994033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6028	NC_012125	GCG	2	6	1994036	1994041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6029	NC_012125	TAC	2	6	1994077	1994082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6030	NC_012125	GC	3	6	1994101	1994106	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6031	NC_012125	TGG	2	6	1994141	1994146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_012125	GTAT	2	8	1994214	1994221	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_012125	TATG	2	8	1994494	1994501	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_012125	GAT	2	6	1994503	1994508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_012125	AT	3	6	1994515	1994520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_012125	GAA	2	6	1994559	1994564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_012125	CAA	2	6	1994580	1994585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6038	NC_012125	A	8	8	1994584	1994591	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_012125	A	6	6	1994633	1994638	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_012125	ATAA	2	8	1994694	1994701	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_012125	CTA	2	6	1995382	1995387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6042	NC_012125	TTA	2	6	1995388	1995393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_012125	TGA	2	6	1995413	1995418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_012125	TAAAA	2	10	1995447	1995456	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_012125	A	7	7	1995507	1995513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_012125	T	6	6	1995581	1995586	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_012125	ATTC	2	8	1995587	1995594	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6048	NC_012125	ATTAA	2	10	1995604	1995613	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_012125	GGT	2	6	1995700	1995705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_012125	G	6	6	1995713	1995718	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_012125	ACA	2	6	1995843	1995848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6052	NC_012125	TTTA	2	8	1995907	1995914	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_012125	GAA	2	6	1995950	1995955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_012125	TGT	2	6	1995956	1995961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_012125	ATGAA	2	10	1996004	1996013	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_012125	TAA	2	6	1997211	1997216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6057	NC_012125	TAT	2	6	1997264	1997269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_012125	CTGT	2	8	1997931	1997938	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6059	NC_012125	TAAAT	2	10	1997974	1997983	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_012125	ATT	2	6	1997998	1998003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_012125	GT	3	6	1998022	1998027	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_012125	AAC	2	6	1998137	1998142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6063	NC_012125	AAT	2	6	2000174	2000179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_012125	CAT	2	6	2000196	2000201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6066	NC_012125	A	7	7	2000259	2000265	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_012125	CGC	2	6	2000268	2000273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6070	NC_012125	TTCA	2	8	2001405	2001412	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6071	NC_012125	AT	3	6	2001460	2001465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6072	NC_012125	TGA	2	6	2002985	2002990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6074	NC_012125	ATC	2	6	2003174	2003179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6076	NC_012125	CT	4	8	2003216	2003223	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6077	NC_012125	ATG	2	6	2003247	2003252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6078	NC_012125	TAC	2	6	2003280	2003285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6079	NC_012125	AAG	2	6	2003492	2003497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6080	NC_012125	A	6	6	2003659	2003664	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6081	NC_012125	GC	3	6	2003702	2003707	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6082	NC_012125	GCC	2	6	2003797	2003802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6083	NC_012125	CGCC	2	8	2003811	2003818	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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6088	NC_012125	TGG	2	6	2004077	2004082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6089	NC_012125	GC	3	6	2004084	2004089	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6090	NC_012125	TGC	2	6	2004116	2004121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6091	NC_012125	TGG	2	6	2004122	2004127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6092	NC_012125	CG	3	6	2004140	2004145	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6093	NC_012125	GAT	2	6	2004196	2004201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6094	NC_012125	CAT	2	6	2004210	2004215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6095	NC_012125	TTG	2	6	2004266	2004271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6096	NC_012125	AGTC	2	8	2004343	2004350	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6097	NC_012125	AGC	2	6	2004551	2004556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6099	NC_012125	T	6	6	2004568	2004573	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6100	NC_012125	CG	3	6	2004708	2004713	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6101	NC_012125	GAT	2	6	2004790	2004795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_012125	CGA	2	6	2004799	2004804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6103	NC_012125	GAA	2	6	2004830	2004835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_012125	GCGAA	2	10	2004840	2004849	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6105	NC_012125	A	6	6	2004852	2004857	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6106	NC_012125	AAC	2	6	2004861	2004866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6107	NC_012125	CTG	3	9	2004887	2004895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6109	NC_012125	CGA	2	6	2004955	2004960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6110	NC_012125	GC	3	6	2005013	2005018	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6111	NC_012125	CATGAG	2	12	2005036	2005047	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6112	NC_012125	ATC	2	6	2005076	2005081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6114	NC_012125	CGG	2	6	2005129	2005134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6115	NC_012125	CGG	2	6	2005248	2005253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6116	NC_012125	TTC	2	6	2005276	2005281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6117	NC_012125	GCGG	2	8	2005286	2005293	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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6119	NC_012125	GTG	2	6	2005352	2005357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6121	NC_012125	AAAGCG	2	12	2005391	2005402	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6122	NC_012125	GC	3	6	2005418	2005423	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6123	NC_012125	CGC	2	6	2005429	2005434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6126	NC_012125	ATC	2	6	2005548	2005553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6127	NC_012125	TGA	2	6	2005579	2005584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6128	NC_012125	GCC	2	6	2005652	2005657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6129	NC_012125	T	6	6	2008647	2008652	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6130	NC_012125	T	7	7	2009827	2009833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6132	NC_012125	T	7	7	2009868	2009874	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6398	NC_012125	T	6	6	2088764	2088769	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6399	NC_012125	T	6	6	2088776	2088781	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6400	NC_012125	AT	3	6	2088782	2088787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6401	NC_012125	ATTG	2	8	2088799	2088806	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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