MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Streptococcus uberis 0140J chromosome

Total Repeats: 5830

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012004	A	6	6	1372	1377	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012004	AAC	2	6	1403	1408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_012004	CTA	5	15	1464	1478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_012004	A	6	6	2652	2657	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012004	A	6	6	3014	3019	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012004	ATAG	2	8	3451	3458	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012004	TTTG	2	8	3470	3477	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012004	TAA	2	6	3483	3488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012004	ATA	2	6	4642	4647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012004	A	6	6	16157	16162	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012004	T	7	7	16185	16191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012004	TTA	2	6	16226	16231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012004	TAT	2	6	16251	16256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012004	A	6	6	17705	17710	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012004	A	7	7	17714	17720	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012004	TAA	2	6	17762	17767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012004	A	6	6	17796	17801	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012004	A	7	7	17807	17813	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012004	A	6	6	17815	17820	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012004	ATA	2	6	17854	17859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012004	ACGA	2	8	17985	17992	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_012004	GGC	2	6	18042	18047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_012004	ACCT	2	8	18133	18140	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_012004	GGTAA	2	10	18264	18273	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012004	CGA	2	6	18287	18292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_012004	GCA	2	6	18361	18366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_012004	G	6	6	18386	18391	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012004	CGC	2	6	18408	18413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_012004	GTGA	2	8	18414	18421	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012004	TGT	2	6	18447	18452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012004	AGA	2	6	18456	18461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012004	TAAC	2	8	18497	18504	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_012004	CAG	2	6	18530	18535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_012004	AGCG	2	8	18585	18592	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_012004	AT	3	6	18714	18719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012004	GGA	2	6	18720	18725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012004	CT	3	6	18745	18750	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_012004	GAA	2	6	18984	18989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012004	GGT	2	6	19058	19063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012004	GTC	2	6	19072	19077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_012004	TCGTG	2	10	19081	19090	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_012004	CAT	2	6	19140	19145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_012004	TAA	2	6	19175	19180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012004	GGA	2	6	19184	19189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012004	ATC	2	6	19208	19213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_012004	AC	3	6	19235	19240	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_012004	TGGT	2	8	19250	19257	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012004	CGC	2	6	19374	19379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_012004	AC	3	6	19404	19409	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_012004	CAC	2	6	19419	19424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_012004	AGCC	2	8	19467	19474	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_012004	GAT	2	6	19490	19495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012004	CCT	2	6	19546	19551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_012004	TAAGGA	2	12	19555	19566	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012004	AGG	2	6	19667	19672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012004	GAAGT	2	10	19727	19736	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012004	A	7	7	19834	19840	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012004	A	8	8	19859	19866	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012004	AAG	2	6	19869	19874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012004	GTTAA	2	10	19895	19904	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012004	GAA	2	6	19941	19946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012004	ACG	2	6	19958	19963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_012004	GTAA	2	8	19981	19988	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012004	GAAG	2	8	20063	20070	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012004	TAG	2	6	20129	20134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012004	GCGA	2	8	20137	20144	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_012004	AGG	2	6	20151	20156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012004	GAG	2	6	20164	20169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012004	CTC	2	6	20174	20179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_012004	AGA	2	6	20217	20222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012004	AG	3	6	20245	20250	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012004	TCG	2	6	20320	20325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_012004	GGA	2	6	20333	20338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012004	CT	3	6	20359	20364	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_012004	GGGAG	2	10	20414	20423	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012004	ACA	2	6	20451	20456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_012004	ATG	2	6	20518	20523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012004	TGT	2	6	20588	20593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012004	GGA	2	6	20651	20656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012004	TC	3	6	20737	20742	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_012004	ACC	2	6	20916	20921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_012004	AAT	2	6	20936	20941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012004	AGC	2	6	20996	21001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_012004	ATTC	2	8	21003	21010	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_012004	TG	3	6	21123	21128	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012004	AAG	2	6	21129	21134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012004	GAG	2	6	21144	21149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012004	GA	3	6	21274	21279	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012004	GTAT	2	8	21325	21332	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012004	CTAA	2	8	21355	21362	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_012004	ATAC	2	8	21509	21516	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_012004	GA	3	6	21570	21575	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012004	CT	3	6	21687	21692	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_012004	GAT	2	6	21705	21710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012004	CGG	2	6	21796	21801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_012004	GA	3	6	21894	21899	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012004	TAGG	2	8	22012	22019	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012004	GTT	2	6	22056	22061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012004	TAC	2	6	22066	22071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_012004	CCT	2	6	22154	22159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_012004	CAA	2	6	22250	22255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_012004	GGT	2	6	22290	22295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012004	TCG	2	6	22405	22410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_012004	CGT	2	6	22485	22490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_012004	AGGGA	2	10	22623	22632	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012004	C	6	6	22661	22666	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
107	NC_012004	GA	3	6	22709	22714	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012004	GAAGTG	2	12	22734	22745	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012004	ACTAAT	2	12	22764	22775	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_012004	CTT	2	6	22828	22833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_012004	AGATAT	2	12	22838	22849	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012004	AGT	2	6	23044	23049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012004	AGT	2	6	23069	23074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012004	GCTTA	2	10	23106	23115	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
115	NC_012004	A	8	8	23315	23322	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012004	A	6	6	23526	23531	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012004	ACC	2	6	23645	23650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_012004	CGT	2	6	23682	23687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_012004	TAA	2	6	23787	23792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012004	CTC	2	6	23863	23868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_012004	CAT	2	6	23876	23881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_012004	CGC	2	6	24029	24034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_012004	TATT	2	8	24035	24042	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012004	GGA	2	6	24141	24146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012004	GCGT	2	8	24200	24207	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_012004	TCC	2	6	24224	24229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_012004	AGC	2	6	24251	24256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_012004	TCG	2	6	24265	24270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_012004	CGG	2	6	24383	24388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_012004	TGT	2	6	24459	24464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012004	TAT	2	6	24508	24513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012004	GGT	2	6	24537	24542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012004	GGT	2	6	24572	24577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012004	ATA	2	6	24704	24709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012004	TGA	2	6	24714	24719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012004	T	14	14	24727	24740	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012004	T	7	7	26169	26175	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012004	T	7	7	27481	27487	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012004	A	6	6	27510	27515	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012004	GGA	2	6	27555	27560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012004	T	7	7	28545	28551	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_012004	TAA	2	6	28585	28590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_012004	TAT	2	6	28594	28599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_012004	G	6	6	28604	28609	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
145	NC_012004	AGA	2	6	30562	30567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_012004	T	7	7	31924	31930	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_012004	GTT	2	6	31931	31936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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152	NC_012004	A	7	7	32785	32791	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_012004	AGT	2	6	38113	38118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
154	NC_012004	AGT	2	6	38237	38242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
155	NC_012004	AGT	2	6	38361	38366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_012004	AAAAG	2	10	38535	38544	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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163	NC_012004	TGTT	2	8	41792	41799	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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167	NC_012004	TTTTA	2	10	41845	41854	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_012004	A	8	8	42067	42074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_012004	A	6	6	42096	42101	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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277	NC_012004	T	6	6	73561	73566	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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289	NC_012004	AAT	2	6	80580	80585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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293	NC_012004	TTG	2	6	81234	81239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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