MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella baltica OS223 plasmid pS22303

Total Repeats: 193

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011665	A	6	6	203	208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011665	C	6	6	248	253	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3	NC_011665	CAG	2	6	281	286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_011665	ATG	2	6	304	309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011665	A	6	6	425	430	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011665	TAC	2	6	473	478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_011665	GTAA	3	12	479	490	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011665	AGC	2	6	517	522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_011665	T	9	9	544	552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011665	TAA	2	6	634	639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011665	ATT	2	6	660	665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011665	TTA	2	6	733	738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011665	AGATTT	2	12	759	770	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011665	T	7	7	874	880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011665	A	8	8	896	903	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011665	A	6	6	1026	1031	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011665	CAC	2	6	1043	1048	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_011665	A	6	6	1501	1506	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011665	A	6	6	1511	1516	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011665	T	6	6	1526	1531	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011665	GA	3	6	1539	1544	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011665	TTC	2	6	2101	2106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_011665	TTA	2	6	2140	2145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011665	GTG	2	6	2210	2215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011665	CAT	2	6	2286	2291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_011665	CAC	2	6	2394	2399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_011665	ATCC	2	8	2474	2481	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_011665	TC	3	6	2483	2488	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_011665	TAAG	2	8	2622	2629	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011665	CTTT	2	8	5081	5088	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_011665	CTG	2	6	5092	5097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_011665	CAT	2	6	5098	5103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_011665	TCG	2	6	5131	5136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_011665	ATG	2	6	5171	5176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011665	TCA	2	6	5184	5189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_011665	CTTC	2	8	5210	5217	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_011665	TAG	2	6	5253	5258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011665	TAA	2	6	5267	5272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011665	CGG	2	6	5375	5380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_011665	GCG	2	6	5433	5438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_011665	GCT	2	6	5442	5447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_011665	AATC	2	8	5452	5459	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_011665	TAT	2	6	5818	5823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011665	CTT	2	6	5842	5847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_011665	TCTTT	2	10	6036	6045	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_011665	GCAT	2	8	6119	6126	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_011665	TTA	2	6	6158	6163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011665	ACT	2	6	6202	6207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_011665	CAAC	2	8	6267	6274	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_011665	AAT	2	6	6336	6341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011665	AGG	2	6	7479	7484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011665	ACGGT	2	10	7495	7504	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_011665	GCC	2	6	7552	7557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_011665	TGC	2	6	7664	7669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_011665	GCA	2	6	7737	7742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_011665	CAG	2	6	7750	7755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_011665	ATG	2	6	7768	7773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011665	GCC	2	6	7781	7786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_011665	CAT	2	6	7814	7819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_011665	T	6	6	7836	7841	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011665	CCA	2	6	7843	7848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_011665	GGA	2	6	7943	7948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011665	TCAAAC	2	12	7972	7983	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_011665	CCTT	2	8	7988	7995	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_011665	AAT	2	6	8013	8018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011665	TCT	2	6	8087	8092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_011665	CTT	2	6	8118	8123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_011665	TCA	2	6	8144	8149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_011665	CCG	2	6	8188	8193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_011665	A	6	6	8326	8331	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011665	G	6	6	8393	8398	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011665	CTT	2	6	8400	8405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_011665	AAG	2	6	8473	8478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011665	AT	3	6	8484	8489	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011665	TCA	2	6	11206	11211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_011665	T	6	6	11214	11219	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011665	TGT	2	6	11302	11307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011665	TAAT	2	8	11390	11397	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011665	TTC	2	6	11425	11430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_011665	AGG	2	6	11448	11453	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011665	CAA	2	6	15324	15329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_011665	TA	3	6	15436	15441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011665	A	6	6	15485	15490	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011665	TCC	2	6	15583	15588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_011665	A	6	6	15956	15961	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011665	T	6	6	16057	16062	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011665	GCT	2	6	16068	16073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_011665	ACTT	2	8	16114	16121	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_011665	ATT	2	6	16173	16178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011665	TAC	2	6	16232	16237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_011665	AAAG	2	8	16256	16263	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011665	AAC	2	6	16353	16358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_011665	AC	3	6	17236	17241	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_011665	AGA	2	6	17266	17271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011665	TGC	2	6	17327	17332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_011665	T	6	6	17361	17366	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011665	GCT	2	6	17387	17392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_011665	TAAAC	2	10	17424	17433	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_011665	A	6	6	17468	17473	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011665	GTC	2	6	17487	17492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_011665	T	6	6	17496	17501	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011665	GTA	2	6	17575	17580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011665	TCAAA	2	10	17603	17612	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_011665	GTT	2	6	17651	17656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011665	AAAC	2	8	18387	18394	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_011665	TTG	2	6	18414	18419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011665	ATC	2	6	18424	18429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_011665	ATC	2	6	18440	18445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_011665	TC	3	6	18459	18464	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_011665	T	7	7	18647	18653	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011665	ATG	2	6	19393	19398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011665	CG	3	6	39443	39448	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_011665	CT	3	6	45747	45752	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_011665	T	7	7	45770	45776	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011665	CTAAT	2	10	46155	46164	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_011665	A	9	9	46440	46448	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011665	TATT	2	8	46449	46456	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011665	ATTAT	2	10	46468	46477	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011665	AAC	2	6	46502	46507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_011665	T	6	6	46599	46604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011665	T	6	6	46609	46614	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011665	GGC	2	6	46637	46642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_011665	A	8	8	46683	46690	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011665	GGC	2	6	46722	46727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_011665	ATA	2	6	47018	47023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011665	TCA	2	6	47046	47051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_011665	TAA	2	6	47060	47065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011665	AGCGA	2	10	48380	48389	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
129	NC_011665	CCGA	2	8	48395	48402	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_011665	TCA	2	6	48418	48423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_011665	T	6	6	48990	48995	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011665	GACA	2	8	51028	51035	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_011665	GC	3	6	51039	51044	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_011665	GCG	2	6	51046	51051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_011665	TTTGG	2	10	51216	51225	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011665	TGG	2	6	51230	51235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011665	GCTT	2	8	51278	51285	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_011665	AGCGA	2	10	51314	51323	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
139	NC_011665	CCGA	2	8	51329	51336	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
140	NC_011665	TCA	2	6	51352	51357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_011665	CAG	2	6	51383	51388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_011665	CCG	2	6	51418	51423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_011665	GCG	2	6	51474	51479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_011665	GCC	2	6	51482	51487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_011665	GCT	2	6	52649	52654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_011665	ATC	2	6	52672	52677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_011665	GCTC	2	8	52699	52706	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
148	NC_011665	GC	3	6	52729	52734	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
149	NC_011665	GCG	2	6	52736	52741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_011665	ATG	2	6	52824	52829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_011665	GCTT	2	8	52941	52948	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
152	NC_011665	AGCGA	2	10	52977	52986	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
153	NC_011665	CCGA	2	8	52992	52999	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
154	NC_011665	TCA	2	6	53015	53020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_011665	CAG	2	6	53046	53051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_011665	GAAT	2	8	53066	53073	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
157	NC_011665	ACC	2	6	53080	53085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
158	NC_011665	AGCT	2	8	53100	53107	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
159	NC_011665	TAT	2	6	53114	53119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_011665	GCG	2	6	53137	53142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_011665	GCC	2	6	53145	53150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
162	NC_011665	TGA	2	6	53233	53238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
163	NC_011665	T	6	6	53246	53251	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_011665	GCT	2	6	53272	53277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_011665	ATT	2	6	53293	53298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_011665	C	6	6	53300	53305	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
167	NC_011665	GAC	2	6	53309	53314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
168	NC_011665	TGT	2	6	54658	54663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
169	NC_011665	GTT	2	6	54758	54763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
170	NC_011665	ATG	2	6	54828	54833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
171	NC_011665	TTAA	2	8	54966	54973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_011665	GGA	2	6	54979	54984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
173	NC_011665	TGG	2	6	55044	55049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
174	NC_011665	GAT	2	6	55234	55239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
175	NC_011665	GTT	2	6	55240	55245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
176	NC_011665	TGC	2	6	55336	55341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
177	NC_011665	T	8	8	55357	55364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
178	NC_011665	A	6	6	55380	55385	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NC_011665	TCA	2	6	55637	55642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
180	NC_011665	TCTG	2	8	55648	55655	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
181	NC_011665	TG	3	6	55677	55682	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
182	NC_011665	TA	3	6	55722	55727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_011665	T	6	6	57301	57306	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_011665	GAA	2	6	57444	57449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
185	NC_011665	TCA	2	6	57510	57515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
186	NC_011665	ACT	2	6	57625	57630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
187	NC_011665	GC	3	6	57652	57657	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
188	NC_011665	ATTT	2	8	57729	57736	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_011665	CTG	2	6	58886	58891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
190	NC_011665	CTTC	2	8	59051	59058	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
191	NC_011665	T	7	7	59068	59074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
192	NC_011665	CTG	2	6	59134	59139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
193	NC_011665	CAA	2	6	59179	59184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.