MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Enteritidis str. P125109 chromosome

Total Repeats: 14062

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_011294	TGC	2	6	1183624	1183629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3502	NC_011294	CTTT	2	8	1187251	1187258	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3503	NC_011294	CT	3	6	1187277	1187282	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3504	NC_011294	AATA	2	8	1187288	1187295	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_011294	AGGT	2	8	1187320	1187327	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_011294	AGCTT	2	10	1187394	1187403	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3507	NC_011294	CGG	2	6	1187427	1187432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3508	NC_011294	GCA	2	6	1187444	1187449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3509	NC_011294	TACCTG	2	12	1190546	1190557	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3510	NC_011294	CCG	2	6	1190564	1190569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3511	NC_011294	TC	3	6	1190618	1190623	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3512	NC_011294	TGA	2	6	1190711	1190716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_011294	ACG	2	6	1190722	1190727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3514	NC_011294	GC	4	8	1192564	1192571	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3515	NC_011294	CAA	2	6	1192594	1192599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3516	NC_011294	AATCA	2	10	1192629	1192638	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3517	NC_011294	GGTT	2	8	1192641	1192648	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_011294	AAG	2	6	1192687	1192692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_011294	CAT	2	6	1194052	1194057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3520	NC_011294	ATG	2	6	1194068	1194073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_011294	T	7	7	1194112	1194118	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_011294	GCA	2	6	1194138	1194143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3523	NC_011294	GCC	2	6	1194150	1194155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3524	NC_011294	CTAC	2	8	1194177	1194184	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3525	NC_011294	TGC	2	6	1194198	1194203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3526	NC_011294	GCC	2	6	1194207	1194212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3527	NC_011294	TGC	2	6	1194214	1194219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3528	NC_011294	CAGT	2	8	1197980	1197987	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3529	NC_011294	GCC	2	6	1198080	1198085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3530	NC_011294	T	6	6	1198086	1198091	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_011294	TCG	2	6	1198126	1198131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3532	NC_011294	GGCA	2	8	1198139	1198146	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3533	NC_011294	CAT	2	6	1199972	1199977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3534	NC_011294	CGG	2	6	1199991	1199996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3535	NC_011294	TCA	2	6	1200013	1200018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3536	NC_011294	CAA	2	6	1200041	1200046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3537	NC_011294	GC	3	6	1200513	1200518	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3538	NC_011294	T	7	7	1200519	1200525	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_011294	CGG	2	6	1201295	1201300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3540	NC_011294	G	6	6	1201304	1201309	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_011294	ATT	2	6	1202449	1202454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_011294	AAAT	2	8	1202457	1202464	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_011294	TATT	2	8	1202471	1202478	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_011294	AT	3	6	1202576	1202581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_011294	G	7	7	1202584	1202590	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_011294	GGT	2	6	1202596	1202601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_011294	TCA	2	6	1202609	1202614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3548	NC_011294	TC	3	6	1202620	1202625	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3549	NC_011294	ATT	2	6	1203359	1203364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_011294	T	7	7	1203384	1203390	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_011294	ATT	2	6	1203431	1203436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_011294	ATT	2	6	1203455	1203460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_011294	GTT	2	6	1203500	1203505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_011294	CGT	2	6	1203571	1203576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3555	NC_011294	T	7	7	1203647	1203653	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_011294	GAT	2	6	1204317	1204322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_011294	CAG	2	6	1204343	1204348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3558	NC_011294	AGA	2	6	1204362	1204367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_011294	TCA	2	6	1205347	1205352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3560	NC_011294	AGCGC	2	10	1205380	1205389	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3561	NC_011294	AC	3	6	1205399	1205404	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3562	NC_011294	TG	3	6	1209331	1209336	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_011294	T	6	6	1209342	1209347	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_011294	TG	3	6	1209352	1209357	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_011294	CAG	2	6	1209400	1209405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3566	NC_011294	AG	3	6	1210406	1210411	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_011294	TAC	2	6	1210433	1210438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3568	NC_011294	TGA	2	6	1210440	1210445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_011294	AAC	2	6	1211925	1211930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3570	NC_011294	ATG	2	6	1212932	1212937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_011294	GGC	2	6	1212974	1212979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3572	NC_011294	A	6	6	1213002	1213007	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_011294	T	8	8	1213015	1213022	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_011294	TG	3	6	1213059	1213064	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_011294	TTA	2	6	1213079	1213084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_011294	TAA	2	6	1213181	1213186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_011294	GAG	2	6	1213228	1213233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_011294	CACT	2	8	1214722	1214729	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3579	NC_011294	GGT	2	6	1214734	1214739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_011294	T	7	7	1214821	1214827	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_011294	CAT	2	6	1214868	1214873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3582	NC_011294	TGA	2	6	1214896	1214901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_011294	AC	3	6	1216766	1216771	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3584	NC_011294	GA	3	6	1216784	1216789	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_011294	GCTT	2	8	1217461	1217468	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3586	NC_011294	CAGG	2	8	1217490	1217497	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3587	NC_011294	GC	3	6	1218741	1218746	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3588	NC_011294	TA	3	6	1218749	1218754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_011294	TA	3	6	1218817	1218822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3590	NC_011294	CTT	2	6	1219575	1219580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3591	NC_011294	ATT	2	6	1219627	1219632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3592	NC_011294	CAT	2	6	1220345	1220350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3593	NC_011294	GGAT	2	8	1220374	1220381	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_011294	TCAT	2	8	1220390	1220397	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3595	NC_011294	GCG	2	6	1220409	1220414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3596	NC_011294	CGC	2	6	1220469	1220474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3597	NC_011294	AT	3	6	1220490	1220495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_011294	A	6	6	1220516	1220521	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_011294	CG	4	8	1222579	1222586	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3600	NC_011294	ATTC	2	8	1223314	1223321	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3601	NC_011294	GTC	2	6	1224062	1224067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3602	NC_011294	TA	3	6	1224090	1224095	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_011294	T	6	6	1224341	1224346	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_011294	GCC	2	6	1224350	1224355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3605	NC_011294	ATG	2	6	1224394	1224399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_011294	ATTG	2	8	1224411	1224418	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_011294	TAA	2	6	1226097	1226102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_011294	A	6	6	1226101	1226106	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_011294	T	7	7	1226135	1226141	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_011294	T	6	6	1226169	1226174	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_011294	TCG	2	6	1226184	1226189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3612	NC_011294	CGT	2	6	1226207	1226212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3613	NC_011294	CT	3	6	1226273	1226278	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3614	NC_011294	AAATT	2	10	1226430	1226439	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_011294	ATTT	2	8	1226444	1226451	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_011294	CCG	2	6	1227821	1227826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3617	NC_011294	CGGT	2	8	1227844	1227851	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3618	NC_011294	CTG	2	6	1227891	1227896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3619	NC_011294	CCG	2	6	1227898	1227903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3620	NC_011294	GC	3	6	1227928	1227933	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3621	NC_011294	GCGCG	2	10	1227956	1227965	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3622	NC_011294	TCAG	2	8	1227985	1227992	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3623	NC_011294	ATTT	2	8	1228067	1228074	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_011294	AG	3	6	1228118	1228123	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3625	NC_011294	TAAT	2	8	1228164	1228171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3626	NC_011294	GCG	2	6	1230208	1230213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3627	NC_011294	CAT	2	6	1230473	1230478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3628	NC_011294	GCA	2	6	1230480	1230485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3629	NC_011294	TAAG	2	8	1230627	1230634	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3630	NC_011294	CGG	2	6	1230710	1230715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3631	NC_011294	T	7	7	1230716	1230722	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3632	NC_011294	A	6	6	1230746	1230751	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3633	NC_011294	A	6	6	1230807	1230812	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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