MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Enteritidis str. P125109 chromosome

Total Repeats: 14062

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_011294	GTTAT	2	10	4669162	4669171	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
14002	NC_011294	CGG	2	6	4669198	4669203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14003	NC_011294	CGC	2	6	4669581	4669586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14004	NC_011294	A	8	8	4670193	4670200	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14005	NC_011294	CAA	2	6	4671734	4671739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14006	NC_011294	ATA	2	6	4671765	4671770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14007	NC_011294	T	6	6	4671774	4671779	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14008	NC_011294	T	8	8	4671799	4671806	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14009	NC_011294	T	7	7	4671819	4671825	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14010	NC_011294	ATT	2	6	4671843	4671848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14011	NC_011294	ATTTT	2	10	4671870	4671879	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14012	NC_011294	TAA	2	6	4671888	4671893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14013	NC_011294	CTG	2	6	4674558	4674563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14014	NC_011294	GC	4	8	4675943	4675950	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14015	NC_011294	CCA	2	6	4677683	4677688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14016	NC_011294	AAAGT	2	10	4680251	4680260	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
14017	NC_011294	CCTG	2	8	4680999	4681006	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14018	NC_011294	TTG	2	6	4681580	4681585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14019	NC_011294	TA	3	6	4681618	4681623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14020	NC_011294	AAATA	2	10	4681624	4681633	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14021	NC_011294	CTT	2	6	4681655	4681660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14022	NC_011294	TCTGT	2	10	4681661	4681670	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
14023	NC_011294	GGC	2	6	4681680	4681685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14024	NC_011294	TAA	2	6	4681772	4681777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14025	NC_011294	AAG	2	6	4681788	4681793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14026	NC_011294	TGA	2	6	4681800	4681805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14027	NC_011294	T	6	6	4681829	4681834	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14028	NC_011294	ATA	2	6	4681836	4681841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14029	NC_011294	TTA	2	6	4681843	4681848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14030	NC_011294	GGA	2	6	4681855	4681860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14031	NC_011294	TTTA	2	8	4681861	4681868	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14032	NC_011294	ACG	2	6	4681898	4681903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14033	NC_011294	ATT	2	6	4682594	4682599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14034	NC_011294	CAA	2	6	4682684	4682689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14035	NC_011294	TGA	2	6	4682766	4682771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14036	NC_011294	AGCGA	2	10	4682843	4682852	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
14037	NC_011294	TGT	2	6	4682863	4682868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14038	NC_011294	GA	3	6	4682880	4682885	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14039	NC_011294	GGCG	2	8	4682901	4682908	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
14040	NC_011294	CGC	2	6	4682928	4682933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14041	NC_011294	CTC	2	6	4682943	4682948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14042	NC_011294	CGG	2	6	4682950	4682955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14043	NC_011294	T	6	6	4683319	4683324	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14044	NC_011294	CAA	2	6	4683331	4683336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14045	NC_011294	AGG	2	6	4683452	4683457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14046	NC_011294	CCTG	2	8	4684321	4684328	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14047	NC_011294	TAA	2	6	4684526	4684531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14048	NC_011294	AT	3	6	4684549	4684554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14049	NC_011294	TGA	2	6	4684583	4684588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14050	NC_011294	ATC	2	6	4684590	4684595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14051	NC_011294	TCA	2	6	4684614	4684619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14052	NC_011294	TAA	2	6	4684657	4684662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14053	NC_011294	TGA	2	6	4684666	4684671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14054	NC_011294	TAAAT	2	10	4684694	4684703	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14055	NC_011294	TAAA	2	8	4684709	4684716	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14056	NC_011294	ATA	2	6	4685607	4685612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14057	NC_011294	AT	3	6	4685667	4685672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14058	NC_011294	CAG	2	6	4685676	4685681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14059	NC_011294	AGAC	2	8	4685765	4685772	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14060	NC_011294	ACA	2	6	4685793	4685798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14061	NC_011294	CAC	3	9	4685816	4685824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14062	NC_011294	ACC	2	6	4685829	4685834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.