MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Enteritidis str. P125109 chromosome

Total Repeats: 14062

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_011294	CAA	2	6	3278172	3278177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10002	NC_011294	TG	3	6	3280066	3280071	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10003	NC_011294	TTG	2	6	3280129	3280134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10004	NC_011294	T	10	10	3280205	3280214	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10005	NC_011294	A	6	6	3281316	3281321	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10006	NC_011294	CCCT	2	8	3282894	3282901	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
10007	NC_011294	ACG	2	6	3282926	3282931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10008	NC_011294	TG	3	6	3282991	3282996	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10009	NC_011294	TGCT	2	8	3283001	3283008	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10010	NC_011294	TCAC	2	8	3284218	3284225	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10011	NC_011294	TAA	2	6	3284257	3284262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10012	NC_011294	TTA	2	6	3284284	3284289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10013	NC_011294	ACTC	2	8	3284729	3284736	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10014	NC_011294	GC	3	6	3284780	3284785	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10015	NC_011294	GAA	2	6	3284814	3284819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10016	NC_011294	AGA	2	6	3284849	3284854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10017	NC_011294	GC	4	8	3284882	3284889	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10018	NC_011294	AG	3	6	3284894	3284899	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10019	NC_011294	GTGAT	2	10	3284923	3284932	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
10020	NC_011294	CGC	3	9	3284951	3284959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10021	NC_011294	GAT	2	6	3284967	3284972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10022	NC_011294	CTG	2	6	3285039	3285044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10023	NC_011294	CGT	2	6	3285048	3285053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10024	NC_011294	TCTTT	2	10	3285756	3285765	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
10025	NC_011294	TGG	2	6	3285804	3285809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10026	NC_011294	T	6	6	3285853	3285858	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10027	NC_011294	A	6	6	3285860	3285865	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10028	NC_011294	A	6	6	3286411	3286416	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10029	NC_011294	GA	4	8	3286452	3286459	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10030	NC_011294	TCC	2	6	3287457	3287462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10031	NC_011294	TTA	2	6	3287471	3287476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10032	NC_011294	ATT	2	6	3287556	3287561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10033	NC_011294	GGC	2	6	3287938	3287943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10034	NC_011294	GCG	2	6	3287944	3287949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10035	NC_011294	CG	3	6	3287965	3287970	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10036	NC_011294	AG	3	6	3288960	3288965	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10037	NC_011294	TAA	2	6	3288968	3288973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10038	NC_011294	GGC	2	6	3289879	3289884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10039	NC_011294	AGCGC	2	10	3289924	3289933	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10040	NC_011294	AAC	3	9	3291289	3291297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10041	NC_011294	GTAG	2	8	3292664	3292671	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10042	NC_011294	T	7	7	3292675	3292681	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10043	NC_011294	GCA	2	6	3292694	3292699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10044	NC_011294	TAA	2	6	3292738	3292743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10045	NC_011294	ATT	2	6	3292812	3292817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10046	NC_011294	TATT	2	8	3292828	3292835	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10047	NC_011294	CAA	2	6	3292870	3292875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10048	NC_011294	A	6	6	3292874	3292879	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10049	NC_011294	TCT	2	6	3292915	3292920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10050	NC_011294	TC	3	6	3296698	3296703	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10051	NC_011294	ATCCT	2	10	3299329	3299338	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
10052	NC_011294	TAAA	2	8	3301489	3301496	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10053	NC_011294	TCAA	2	8	3301551	3301558	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10054	NC_011294	A	6	6	3301557	3301562	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10055	NC_011294	AT	3	6	3301579	3301584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10056	NC_011294	TCAA	2	8	3301643	3301650	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10057	NC_011294	T	7	7	3301757	3301763	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10058	NC_011294	TTTG	2	8	3301770	3301777	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10059	NC_011294	TAA	2	6	3301790	3301795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10060	NC_011294	ACA	2	6	3301835	3301840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10061	NC_011294	AAT	2	6	3301841	3301846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10062	NC_011294	GAAA	2	8	3301887	3301894	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10063	NC_011294	TCA	2	6	3301950	3301955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10064	NC_011294	AAT	2	6	3301964	3301969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10065	NC_011294	CAC	2	6	3301977	3301982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10066	NC_011294	AATT	2	8	3301990	3301997	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10067	NC_011294	TCT	2	6	3302018	3302023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10069	NC_011294	CTTT	2	8	3302109	3302116	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10070	NC_011294	CGT	2	6	3302126	3302131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10071	NC_011294	TCAT	2	8	3302138	3302145	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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10074	NC_011294	TCAT	2	8	3302234	3302241	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10075	NC_011294	AGC	2	6	3302269	3302274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10077	NC_011294	CGG	2	6	3302424	3302429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10078	NC_011294	CT	3	6	3302434	3302439	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10079	NC_011294	C	7	7	3302460	3302466	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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10081	NC_011294	GAC	3	9	3302534	3302542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10083	NC_011294	GC	3	6	3302570	3302575	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10084	NC_011294	CG	3	6	3302589	3302594	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10085	NC_011294	TC	3	6	3304740	3304745	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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10087	NC_011294	TAT	3	9	3305703	3305711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10088	NC_011294	ATT	2	6	3305811	3305816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10089	NC_011294	CA	3	6	3305862	3305867	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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10093	NC_011294	CAGT	2	8	3307634	3307641	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10094	NC_011294	T	6	6	3307708	3307713	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10095	NC_011294	T	7	7	3307755	3307761	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10096	NC_011294	A	7	7	3307824	3307830	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10097	NC_011294	AAAC	2	8	3307862	3307869	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10098	NC_011294	GGA	2	6	3307880	3307885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10099	NC_011294	ATT	2	6	3308798	3308803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10100	NC_011294	ATA	2	6	3310624	3310629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10101	NC_011294	ATCA	2	8	3314372	3314379	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10102	NC_011294	GTC	2	6	3315301	3315306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10103	NC_011294	A	7	7	3315338	3315344	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10104	NC_011294	ATC	2	6	3319006	3319011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10105	NC_011294	CAT	2	6	3319734	3319739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10107	NC_011294	GGA	2	6	3319775	3319780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10108	NC_011294	GGC	2	6	3322148	3322153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10109	NC_011294	CAA	2	6	3322160	3322165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10110	NC_011294	ATT	2	6	3322187	3322192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10111	NC_011294	GCA	2	6	3322237	3322242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10112	NC_011294	GAG	2	6	3323303	3323308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10113	NC_011294	GGC	2	6	3324196	3324201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10114	NC_011294	AAC	2	6	3324305	3324310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10115	NC_011294	TA	3	6	3326105	3326110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10116	NC_011294	TATGA	2	10	3326117	3326126	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10117	NC_011294	TTA	2	6	3326209	3326214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10118	NC_011294	ATC	2	6	3326224	3326229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10121	NC_011294	CAC	2	6	3328012	3328017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10122	NC_011294	GCC	2	6	3328018	3328023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10123	NC_011294	AGC	2	6	3328025	3328030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10124	NC_011294	GTG	2	6	3328046	3328051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10125	NC_011294	CT	4	8	3328070	3328077	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10126	NC_011294	TC	3	6	3328100	3328105	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10127	NC_011294	A	7	7	3328146	3328152	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10128	NC_011294	TTTAC	2	10	3328183	3328192	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
10129	NC_011294	GTA	2	6	3330109	3330114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10130	NC_011294	GGC	2	6	3330134	3330139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10131	NC_011294	TCA	2	6	3330153	3330158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10132	NC_011294	AAC	3	9	3330220	3330228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10133	NC_011294	TGAA	2	8	3331195	3331202	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10134	NC_011294	CAA	2	6	3331223	3331228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10135	NC_011294	CCAG	2	8	3331234	3331241	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10136	NC_011294	ATA	2	6	3333418	3333423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10137	NC_011294	ATA	2	6	3333445	3333450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10138	NC_011294	CGT	2	6	3333456	3333461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10139	NC_011294	TCT	2	6	3333472	3333477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10140	NC_011294	AACCCT	2	12	3333500	3333511	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
10141	NC_011294	CG	3	6	3333537	3333542	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10142	NC_011294	TCAT	2	8	3333561	3333568	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10143	NC_011294	CAA	2	6	3333571	3333576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10147	NC_011294	CGC	2	6	3333992	3333997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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10151	NC_011294	ATC	2	6	3335517	3335522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10153	NC_011294	GGC	2	6	3335548	3335553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10157	NC_011294	A	7	7	3340347	3340353	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10161	NC_011294	CGA	2	6	3340561	3340566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10164	NC_011294	CTG	2	6	3340661	3340666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10165	NC_011294	GGACG	2	10	3340681	3340690	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
10166	NC_011294	ATGA	2	8	3340754	3340761	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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10171	NC_011294	TAAAA	2	10	3342396	3342405	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10174	NC_011294	TTTA	2	8	3342434	3342441	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10175	NC_011294	GGC	2	6	3343422	3343427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10195	NC_011294	A	7	7	3350250	3350256	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10196	NC_011294	GC	3	6	3350268	3350273	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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10203	NC_011294	GC	3	6	3354880	3354885	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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10246	NC_011294	TCCTC	2	10	3382215	3382224	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
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10252	NC_011294	T	6	6	3383561	3383566	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10253	NC_011294	CAC	2	6	3386139	3386144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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10257	NC_011294	TGT	2	6	3389827	3389832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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