MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum str. 287/91 chromosome

Total Repeats: 19633

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_011274	ATA	2	6	1064531	1064536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_011274	A	7	7	1064536	1064542	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_011274	TGAGTA	2	12	1064577	1064588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_011274	GAT	2	6	1064613	1064618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_011274	AAT	2	6	1064658	1064663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_011274	CTTC	2	8	1064684	1064691	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4007	NC_011274	TCA	2	6	1064713	1064718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4008	NC_011274	TTG	2	6	1064740	1064745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_011274	A	6	6	1064765	1064770	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_011274	TAA	2	6	1064771	1064776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_011274	T	6	6	1064786	1064791	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_011274	GCA	2	6	1064792	1064797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4013	NC_011274	TGA	2	6	1064843	1064848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_011274	AC	3	6	1064861	1064866	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4015	NC_011274	GA	4	8	1064896	1064903	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_011274	CCA	2	6	1064926	1064931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4017	NC_011274	AAC	2	6	1067103	1067108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4018	NC_011274	A	7	7	1067147	1067153	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_011274	CTT	2	6	1067305	1067310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4020	NC_011274	GT	4	8	1067377	1067384	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_011274	CT	3	6	1067675	1067680	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4022	NC_011274	ATA	2	6	1067689	1067694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_011274	ATT	2	6	1067695	1067700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_011274	AT	3	6	1071552	1071557	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_011274	CGC	2	6	1072083	1072088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4026	NC_011274	GCG	2	6	1072091	1072096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4027	NC_011274	TAC	2	6	1072132	1072137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4028	NC_011274	GC	3	6	1072156	1072161	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4029	NC_011274	TGG	2	6	1072196	1072201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_011274	CGC	2	6	1072226	1072231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4031	NC_011274	CGG	2	6	1072254	1072259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4032	NC_011274	GGT	2	6	1072300	1072305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_011274	CCT	2	6	1072851	1072856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4034	NC_011274	TAA	2	6	1074460	1074465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_011274	TGT	2	6	1074479	1074484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_011274	CGG	2	6	1074533	1074538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4037	NC_011274	GAA	3	9	1074559	1074567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_011274	CGG	2	6	1074619	1074624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4039	NC_011274	ATT	2	6	1075104	1075109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_011274	AAT	2	6	1075118	1075123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_011274	TTTA	2	8	1075187	1075194	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_011274	TAA	3	9	1075216	1075224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_011274	ATCAC	2	10	1075244	1075253	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
4044	NC_011274	TACTT	2	10	1075257	1075266	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4045	NC_011274	AT	3	6	1075309	1075314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_011274	GAG	2	6	1075345	1075350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_011274	GCGCT	2	10	1079373	1079382	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4048	NC_011274	A	7	7	1079395	1079401	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_011274	CAG	2	6	1079464	1079469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4050	NC_011274	GAA	2	6	1080301	1080306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_011274	AGCGC	2	10	1081115	1081124	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4052	NC_011274	GTA	2	6	1081137	1081142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_011274	ATG	2	6	1083469	1083474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_011274	A	7	7	1083475	1083481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_011274	ATG	2	6	1084440	1084445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_011274	ATT	2	6	1084501	1084506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_011274	T	6	6	1084505	1084510	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_011274	ACT	2	6	1084517	1084522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4060	NC_011274	CTC	2	6	1084666	1084671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4061	NC_011274	A	6	6	1084704	1084709	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_011274	AGT	2	6	1084786	1084791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_011274	T	6	6	1085284	1085289	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_011274	T	6	6	1085313	1085318	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_011274	TTAT	2	8	1085325	1085332	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_011274	GTG	2	6	1085382	1085387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_011274	ATT	2	6	1085423	1085428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_011274	TGT	2	6	1085443	1085448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_011274	TTAT	2	8	1085454	1085461	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_011274	AG	3	6	1085532	1085537	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_011274	AT	3	6	1085555	1085560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_011274	A	6	6	1085610	1085615	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_011274	TTTA	2	8	1085635	1085642	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_011274	GAT	2	6	1085646	1085651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4076	NC_011274	TAT	2	6	1085760	1085765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_011274	CAT	2	6	1087059	1087064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4079	NC_011274	GTT	2	6	1087181	1087186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_011274	GC	3	6	1087208	1087213	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4081	NC_011274	A	6	6	1087696	1087701	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_011274	AAC	2	6	1090818	1090823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4086	NC_011274	CCT	2	6	1093020	1093025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4088	NC_011274	TTG	2	6	1093088	1093093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_011274	TTAT	2	8	1093144	1093151	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_011274	TTA	2	6	1093161	1093166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_011274	TGA	2	6	1093258	1093263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_011274	GAG	2	6	1093283	1093288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_011274	CTC	2	6	1093292	1093297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4094	NC_011274	ATG	2	6	1093312	1093317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_011274	GGCG	2	8	1093649	1093656	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4096	NC_011274	CGC	2	6	1093657	1093662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4097	NC_011274	GGA	2	6	1093670	1093675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_011274	AT	3	6	1093701	1093706	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_011274	GCC	2	6	1093791	1093796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4100	NC_011274	ATT	3	9	1093899	1093907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_011274	TTAA	2	8	1094363	1094370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_011274	A	7	7	1098470	1098476	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_011274	ATTT	2	8	1098510	1098517	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_011274	A	6	6	1098556	1098561	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_011274	GA	3	6	1098565	1098570	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_011274	GT	3	6	1098623	1098628	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_011274	ACC	2	6	1098646	1098651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4108	NC_011274	AATA	2	8	1098739	1098746	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_011274	GGC	2	6	1100316	1100321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4110	NC_011274	GCCT	2	8	1100329	1100336	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4111	NC_011274	CT	3	6	1100393	1100398	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4112	NC_011274	AT	3	6	1100468	1100473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_011274	ATAA	2	8	1100578	1100585	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_011274	GA	3	6	1100603	1100608	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_011274	G	6	6	1100665	1100670	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_011274	TAG	2	6	1100689	1100694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_011274	T	6	6	1100707	1100712	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_011274	AAT	2	6	1100729	1100734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_011274	AAT	2	6	1100770	1100775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_011274	AT	3	6	1100796	1100801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_011274	ATT	2	6	1100808	1100813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_011274	TGT	2	6	1100823	1100828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_011274	TAG	2	6	1100832	1100837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_011274	TCAC	2	8	1100867	1100874	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4125	NC_011274	AGT	2	6	1100922	1100927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4127	NC_011274	TC	4	8	1100949	1100956	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4128	NC_011274	GGT	3	9	1100958	1100966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_011274	TCA	2	6	1100986	1100991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4130	NC_011274	GTG	2	6	1101025	1101030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_011274	GT	3	6	1101040	1101045	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_011274	CGT	2	6	1101048	1101053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4133	NC_011274	AAGC	2	8	1101060	1101067	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4134	NC_011274	TG	4	8	1101097	1101104	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4135	NC_011274	TGT	2	6	1101990	1101995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4138	NC_011274	CAGAG	2	10	1102991	1103000	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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4143	NC_011274	CG	3	6	1103174	1103179	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4250	NC_011274	ATA	3	9	1112018	1112026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4251	NC_011274	CTC	2	6	1112060	1112065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4252	NC_011274	ATG	2	6	1112074	1112079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4253	NC_011274	CA	3	6	1112085	1112090	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4254	NC_011274	AAT	2	6	1112611	1112616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4255	NC_011274	TCC	2	6	1112655	1112660	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4256	NC_011274	TA	4	8	1113088	1113095	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4257	NC_011274	CTTTC	2	10	1113313	1113322	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
4258	NC_011274	T	6	6	1113350	1113355	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4259	NC_011274	TCT	2	6	1113367	1113372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4260	NC_011274	T	7	7	1113372	1113378	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4261	NC_011274	TGT	2	6	1113433	1113438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4262	NC_011274	ATT	2	6	1113444	1113449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4264	NC_011274	T	7	7	1113512	1113518	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4265	NC_011274	ATT	2	6	1113529	1113534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4266	NC_011274	TGT	2	6	1119863	1119868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4268	NC_011274	ATC	2	6	1121195	1121200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4274	NC_011274	CTG	2	6	1133511	1133516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4286	NC_011274	T	8	8	1134446	1134453	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4287	NC_011274	TTGA	2	8	1134456	1134463	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4302	NC_011274	ATGT	2	8	1134812	1134819	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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