MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum str. 287/91 chromosome

Total Repeats: 19633

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_011274	TGT	2	6	4089021	4089026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17002	NC_011274	GCC	2	6	4089692	4089697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17003	NC_011274	AAT	2	6	4089704	4089709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17004	NC_011274	CTTTT	2	10	4089738	4089747	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
17005	NC_011274	TC	3	6	4089771	4089776	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17006	NC_011274	T	8	8	4089792	4089799	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17007	NC_011274	TAA	2	6	4089801	4089806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17008	NC_011274	A	6	6	4089805	4089810	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17009	NC_011274	CATGT	2	10	4089832	4089841	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
17010	NC_011274	AG	3	6	4089890	4089895	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17011	NC_011274	GCGCT	2	10	4091238	4091247	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
17012	NC_011274	GTC	2	6	4095293	4095298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17013	NC_011274	TCC	2	6	4095299	4095304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17014	NC_011274	ATG	3	9	4095342	4095350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17015	NC_011274	T	6	6	4095352	4095357	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17016	NC_011274	AAC	2	6	4095410	4095415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17017	NC_011274	AGC	2	6	4097273	4097278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17018	NC_011274	CAT	2	6	4097355	4097360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17019	NC_011274	CTT	2	6	4097445	4097450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17020	NC_011274	GAC	2	6	4097524	4097529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17021	NC_011274	GA	3	6	4097574	4097579	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17022	NC_011274	TTC	2	6	4097587	4097592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17023	NC_011274	GTT	2	6	4097665	4097670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17024	NC_011274	TGAG	2	8	4097802	4097809	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
17025	NC_011274	GCC	2	6	4097971	4097976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17026	NC_011274	ATT	2	6	4097989	4097994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17027	NC_011274	CAT	2	6	4098009	4098014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17028	NC_011274	GCA	2	6	4098043	4098048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17029	NC_011274	CTTT	2	8	4098090	4098097	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
17030	NC_011274	CCA	2	6	4098099	4098104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17031	NC_011274	GAG	2	6	4101283	4101288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17032	NC_011274	TTG	2	6	4101293	4101298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17033	NC_011274	A	9	9	4101330	4101338	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17034	NC_011274	TAATAT	2	12	4101347	4101358	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17035	NC_011274	A	6	6	4101373	4101378	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17036	NC_011274	GGT	2	6	4101418	4101423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17037	NC_011274	TGT	2	6	4101465	4101470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17038	NC_011274	GAAA	2	8	4102047	4102054	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17039	NC_011274	T	7	7	4102070	4102076	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17040	NC_011274	AAG	2	6	4102082	4102087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17041	NC_011274	GAATGA	2	12	4102099	4102110	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17042	NC_011274	TTA	2	6	4102111	4102116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17043	NC_011274	TAT	2	6	4102184	4102189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17044	NC_011274	T	8	8	4102210	4102217	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17045	NC_011274	GTGCTC	2	12	4102263	4102274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17046	NC_011274	GC	3	6	4102305	4102310	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17047	NC_011274	CTGC	2	8	4102325	4102332	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17048	NC_011274	CGC	2	6	4102385	4102390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17049	NC_011274	ATC	2	6	4102447	4102452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17050	NC_011274	CTC	2	6	4103518	4103523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17051	NC_011274	T	6	6	4103538	4103543	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17052	NC_011274	CGGA	2	8	4103578	4103585	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17053	NC_011274	TTA	2	6	4104365	4104370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17054	NC_011274	CCAT	2	8	4104377	4104384	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
17055	NC_011274	AGC	2	6	4104412	4104417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17056	NC_011274	GTT	2	6	4104528	4104533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17057	NC_011274	CGC	2	6	4104566	4104571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17058	NC_011274	A	7	7	4104611	4104617	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17059	NC_011274	T	7	7	4104622	4104628	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17060	NC_011274	CACG	2	8	4104642	4104649	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17061	NC_011274	CGT	2	6	4105748	4105753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17062	NC_011274	TTG	2	6	4107705	4107710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17063	NC_011274	T	7	7	4107792	4107798	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17064	NC_011274	GCT	2	6	4108044	4108049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17065	NC_011274	GC	3	6	4108084	4108089	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17066	NC_011274	A	7	7	4108114	4108120	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17067	NC_011274	GCC	2	6	4109294	4109299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17068	NC_011274	CGG	2	6	4109303	4109308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17069	NC_011274	T	7	7	4109345	4109351	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17070	NC_011274	GAC	2	6	4109466	4109471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17071	NC_011274	TGC	2	6	4109491	4109496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17072	NC_011274	AAG	2	6	4109510	4109515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17073	NC_011274	T	6	6	4109778	4109783	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17074	NC_011274	GCG	2	6	4109786	4109791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17075	NC_011274	TTTC	2	8	4109811	4109818	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
17076	NC_011274	CAG	2	6	4109848	4109853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17077	NC_011274	CGA	2	6	4109862	4109867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17078	NC_011274	CACC	2	8	4109925	4109932	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
17079	NC_011274	GC	3	6	4109954	4109959	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17080	NC_011274	GATG	2	8	4109970	4109977	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
17081	NC_011274	TCG	2	6	4110018	4110023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17082	NC_011274	AG	3	6	4110087	4110092	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17083	NC_011274	GC	3	6	4110119	4110124	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17084	NC_011274	GCT	2	6	4110150	4110155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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17087	NC_011274	GCC	2	6	4110338	4110343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17088	NC_011274	ATGG	2	8	4110408	4110415	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
17089	NC_011274	CGC	2	6	4110505	4110510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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17091	NC_011274	TCA	2	6	4110539	4110544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17092	NC_011274	GCG	2	6	4110556	4110561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17093	NC_011274	CACC	2	8	4110636	4110643	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
17094	NC_011274	CG	3	6	4110662	4110667	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17095	NC_011274	TGGA	2	8	4110702	4110709	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
17096	NC_011274	CGG	2	6	4110806	4110811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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17098	NC_011274	GGC	2	6	4110942	4110947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17099	NC_011274	ATC	2	6	4111030	4111035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17100	NC_011274	TGT	2	6	4111057	4111062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17101	NC_011274	GGT	2	6	4111106	4111111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17102	NC_011274	GC	3	6	4111175	4111180	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17103	NC_011274	TAT	2	6	4111182	4111187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17104	NC_011274	CTG	2	6	4111218	4111223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17105	NC_011274	CTG	2	6	4111287	4111292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17106	NC_011274	G	6	6	4111295	4111300	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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17109	NC_011274	TGG	2	6	4111411	4111416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17110	NC_011274	ATC	2	6	4111476	4111481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17111	NC_011274	GGC	2	6	4111605	4111610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17112	NC_011274	GTG	2	6	4111611	4111616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17113	NC_011274	CT	3	6	4111652	4111657	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17114	NC_011274	CCG	2	6	4111671	4111676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17115	NC_011274	CGA	2	6	4111681	4111686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17116	NC_011274	AGA	2	6	4113713	4113718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17117	NC_011274	GC	3	6	4113736	4113741	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17118	NC_011274	CGG	2	6	4113777	4113782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17119	NC_011274	TGG	2	6	4113840	4113845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17120	NC_011274	CAT	2	6	4113855	4113860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17121	NC_011274	GCA	2	6	4113942	4113947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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17123	NC_011274	CGGCA	2	10	4114044	4114053	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
17124	NC_011274	ATT	2	6	4114078	4114083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17125	NC_011274	GTC	2	6	4114105	4114110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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17127	NC_011274	GC	3	6	4114167	4114172	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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17129	NC_011274	C	6	6	4114283	4114288	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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