MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum str. 287/91 chromosome

Total Repeats: 19633

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_011274	GGC	2	6	3597424	3597429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15002	NC_011274	T	7	7	3598521	3598527	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15003	NC_011274	G	6	6	3598551	3598556	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15004	NC_011274	TGT	2	6	3601834	3601839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15005	NC_011274	ATT	2	6	3601844	3601849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15006	NC_011274	AGC	2	6	3601865	3601870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15007	NC_011274	GGC	2	6	3602487	3602492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15008	NC_011274	TAAG	2	8	3602520	3602527	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15009	NC_011274	TGC	3	9	3602665	3602673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15010	NC_011274	GCG	2	6	3602682	3602687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15011	NC_011274	CGT	2	6	3602706	3602711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15012	NC_011274	T	6	6	3602732	3602737	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15013	NC_011274	CGAG	2	8	3608141	3608148	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15014	NC_011274	T	7	7	3608189	3608195	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15015	NC_011274	ATT	2	6	3608248	3608253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15016	NC_011274	TAAA	2	8	3608559	3608566	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15017	NC_011274	TAA	2	6	3608576	3608581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15018	NC_011274	AATTA	2	10	3608584	3608593	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15019	NC_011274	CTT	2	6	3608602	3608607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15020	NC_011274	GTA	2	6	3608677	3608682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15021	NC_011274	CAA	2	6	3608695	3608700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15022	NC_011274	ATT	2	6	3608758	3608763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15023	NC_011274	ACTG	2	8	3608809	3608816	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15024	NC_011274	AAT	2	6	3608887	3608892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15025	NC_011274	TACA	2	8	3608914	3608921	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15026	NC_011274	ATT	2	6	3608958	3608963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15027	NC_011274	GGT	2	6	3608986	3608991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15028	NC_011274	TAT	2	6	3609008	3609013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15029	NC_011274	AT	3	6	3609075	3609080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15030	NC_011274	TTG	2	6	3609092	3609097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15031	NC_011274	CCAT	2	8	3609180	3609187	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
15032	NC_011274	AGTA	2	8	3609199	3609206	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15033	NC_011274	TAAT	2	8	3609212	3609219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15034	NC_011274	T	6	6	3609252	3609257	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15035	NC_011274	T	6	6	3609284	3609289	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15036	NC_011274	T	6	6	3609342	3609347	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15037	NC_011274	TA	3	6	3609377	3609382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15038	NC_011274	A	7	7	3609441	3609447	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15039	NC_011274	TTG	2	6	3609488	3609493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15040	NC_011274	AGA	2	6	3609595	3609600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15041	NC_011274	T	6	6	3609694	3609699	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15042	NC_011274	TGG	2	6	3609726	3609731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15043	NC_011274	TACT	2	8	3609755	3609762	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15044	NC_011274	ATG	2	6	3609779	3609784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15045	NC_011274	ATT	2	6	3609785	3609790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15046	NC_011274	T	6	6	3609799	3609804	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15047	NC_011274	GGA	2	6	3609853	3609858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15048	NC_011274	TAAA	2	8	3609886	3609893	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15049	NC_011274	ACTTT	2	10	3609904	3609913	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
15050	NC_011274	CAT	2	6	3609928	3609933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15051	NC_011274	TAA	2	6	3609948	3609953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15052	NC_011274	CAAA	2	8	3609957	3609964	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15053	NC_011274	TTTA	2	8	3609986	3609993	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15054	NC_011274	CAAT	2	8	3610018	3610025	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15055	NC_011274	CAG	2	6	3610054	3610059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15056	NC_011274	TAA	2	6	3610089	3610094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15057	NC_011274	TGG	2	6	3610815	3610820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15058	NC_011274	CCA	2	6	3610837	3610842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15059	NC_011274	TTG	2	6	3619247	3619252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15060	NC_011274	GTC	2	6	3619351	3619356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15061	NC_011274	CAG	2	6	3619381	3619386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15062	NC_011274	TCACT	2	10	3620470	3620479	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
15063	NC_011274	AAT	2	6	3620537	3620542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15064	NC_011274	GGC	2	6	3620671	3620676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15065	NC_011274	CTTC	2	8	3620682	3620689	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15066	NC_011274	ACTC	2	8	3620727	3620734	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
15067	NC_011274	GCC	2	6	3620739	3620744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15068	NC_011274	GTA	2	6	3621998	3622003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15069	NC_011274	AAG	2	6	3622012	3622017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15070	NC_011274	GCT	2	6	3622115	3622120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15071	NC_011274	T	6	6	3622120	3622125	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15072	NC_011274	AACC	2	8	3623068	3623075	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15073	NC_011274	TGA	2	6	3623208	3623213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15074	NC_011274	ATG	2	6	3623253	3623258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15077	NC_011274	TAA	2	6	3624558	3624563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15078	NC_011274	AGA	2	6	3624566	3624571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15079	NC_011274	AGGA	2	8	3624579	3624586	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15080	NC_011274	GTG	2	6	3624595	3624600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15081	NC_011274	CAT	2	6	3624705	3624710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15083	NC_011274	CT	3	6	3624805	3624810	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15084	NC_011274	CG	3	6	3624855	3624860	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15085	NC_011274	TGG	3	9	3624869	3624877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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15087	NC_011274	GC	3	6	3625046	3625051	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15088	NC_011274	A	6	6	3625083	3625088	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15089	NC_011274	AG	3	6	3625155	3625160	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15090	NC_011274	ACG	2	6	3625200	3625205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15092	NC_011274	T	6	6	3625296	3625301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15093	NC_011274	TTA	2	6	3625303	3625308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15095	NC_011274	CCT	2	6	3625330	3625335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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15097	NC_011274	A	6	6	3626393	3626398	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15098	NC_011274	T	6	6	3626417	3626422	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15099	NC_011274	GCT	2	6	3628413	3628418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15100	NC_011274	GCC	2	6	3628522	3628527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15101	NC_011274	ACAAAA	2	12	3628543	3628554	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15102	NC_011274	ACC	2	6	3628686	3628691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15103	NC_011274	GCC	2	6	3628700	3628705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15104	NC_011274	GCG	2	6	3628749	3628754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15105	NC_011274	TCCT	2	8	3628795	3628802	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15106	NC_011274	GCC	2	6	3628814	3628819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15107	NC_011274	TGC	3	9	3628821	3628829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15108	NC_011274	CTG	2	6	3628860	3628865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15109	NC_011274	TCT	2	6	3628870	3628875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15110	NC_011274	AC	3	6	3628960	3628965	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15111	NC_011274	CGT	3	9	3628978	3628986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15113	NC_011274	C	6	6	3629164	3629169	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15114	NC_011274	ACG	2	6	3629213	3629218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15115	NC_011274	TGA	2	6	3629293	3629298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15117	NC_011274	ACC	2	6	3629408	3629413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15118	NC_011274	CCT	2	6	3629490	3629495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15119	NC_011274	CTC	2	6	3629527	3629532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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15122	NC_011274	GGT	2	6	3629631	3629636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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15126	NC_011274	CAGC	2	8	3630039	3630046	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15127	NC_011274	GACT	2	8	3630057	3630064	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15128	NC_011274	TC	3	6	3630155	3630160	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15129	NC_011274	ACC	2	6	3630185	3630190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15130	NC_011274	TTG	2	6	3630257	3630262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15131	NC_011274	TCG	2	6	3630281	3630286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15132	NC_011274	AC	4	8	3630325	3630332	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15133	NC_011274	C	6	6	3630385	3630390	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15134	NC_011274	AACG	2	8	3630627	3630634	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15135	NC_011274	CGACT	2	10	3630646	3630655	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
15136	NC_011274	TCGCT	2	10	3630673	3630682	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
15137	NC_011274	CTTT	2	8	3630801	3630808	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15138	NC_011274	ATG	2	6	3630811	3630816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15140	NC_011274	GTT	2	6	3630907	3630912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15141	NC_011274	ACG	2	6	3630922	3630927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15142	NC_011274	GT	3	6	3630944	3630949	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15143	NC_011274	TCGGT	2	10	3631153	3631162	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
15144	NC_011274	CA	3	6	3631337	3631342	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15145	NC_011274	GTAC	2	8	3631367	3631374	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15146	NC_011274	GTCA	2	8	3631450	3631457	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15147	NC_011274	GGA	2	6	3631473	3631478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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15149	NC_011274	CG	3	6	3631575	3631580	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15150	NC_011274	AC	3	6	3631602	3631607	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15151	NC_011274	CTC	2	6	3631628	3631633	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15152	NC_011274	TCGC	2	8	3631639	3631646	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15153	NC_011274	TCA	2	6	3631921	3631926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15155	NC_011274	AAC	2	6	3631956	3631961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15156	NC_011274	GTT	2	6	3631966	3631971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15158	NC_011274	CCG	2	6	3632119	3632124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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15161	NC_011274	CTT	2	6	3632237	3632242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15162	NC_011274	TAAGG	2	10	3632243	3632252	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
15163	NC_011274	CTAC	2	8	3632348	3632355	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
15164	NC_011274	GT	3	6	3632391	3632396	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15165	NC_011274	ACG	2	6	3632492	3632497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15166	NC_011274	GT	3	6	3632560	3632565	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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15171	NC_011274	GCA	2	6	3632736	3632741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15172	NC_011274	TTC	2	6	3632782	3632787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15173	NC_011274	TTC	2	6	3632812	3632817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15192	NC_011274	CGCTT	2	10	3633938	3633947	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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15197	NC_011274	GTT	2	6	3634066	3634071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15209	NC_011274	T	6	6	3641870	3641875	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15230	NC_011274	AAAAG	2	10	3654162	3654171	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
15231	NC_011274	AG	3	6	3654196	3654201	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15232	NC_011274	CTC	2	6	3654975	3654980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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15235	NC_011274	AATA	2	8	3655109	3655116	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15236	NC_011274	AC	3	6	3655174	3655179	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15237	NC_011274	T	6	6	3655203	3655208	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15238	NC_011274	TGTT	2	8	3656056	3656063	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15239	NC_011274	CAA	2	6	3656094	3656099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15242	NC_011274	GCT	2	6	3657579	3657584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15243	NC_011274	TCAT	2	8	3657610	3657617	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15244	NC_011274	TAT	2	6	3657632	3657637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15245	NC_011274	A	6	6	3657702	3657707	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15246	NC_011274	GAG	2	6	3657708	3657713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15247	NC_011274	TCAGG	2	10	3657730	3657739	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
15248	NC_011274	TGC	2	6	3657774	3657779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15249	NC_011274	CT	3	6	3660079	3660084	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15250	NC_011274	GGC	2	6	3660135	3660140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15251	NC_011274	AAGT	2	8	3660169	3660176	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15252	NC_011274	AACA	2	8	3662126	3662133	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15253	NC_011274	T	6	6	3664006	3664011	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15254	NC_011274	CGT	2	6	3664013	3664018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15255	NC_011274	ACACA	2	10	3664024	3664033	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
15256	NC_011274	T	6	6	3665365	3665370	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15257	NC_011274	GA	3	6	3667261	3667266	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15258	NC_011274	GAT	2	6	3668047	3668052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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