MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum str. 287/91 chromosome

Total Repeats: 19633

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_011274	GCGCT	2	10	3372512	3372521	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
14002	NC_011274	TGTTAT	2	12	3373657	3373668	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14003	NC_011274	CGT	2	6	3373688	3373693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14004	NC_011274	A	7	7	3373706	3373712	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14005	NC_011274	CT	4	8	3374288	3374295	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14006	NC_011274	TAT	2	6	3374313	3374318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14007	NC_011274	TTCA	2	8	3374375	3374382	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14008	NC_011274	AGC	2	6	3374392	3374397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14009	NC_011274	GATGT	2	10	3375798	3375807	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
14010	NC_011274	TGC	3	9	3375825	3375833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14011	NC_011274	T	6	6	3375841	3375846	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14012	NC_011274	ACG	2	6	3375848	3375853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14013	NC_011274	ACG	2	6	3376934	3376939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14014	NC_011274	CGT	2	6	3376953	3376958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14015	NC_011274	CGA	2	6	3376960	3376965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14016	NC_011274	CAGG	2	8	3381073	3381080	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14017	NC_011274	ATA	2	6	3381114	3381119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14018	NC_011274	GCC	2	6	3381137	3381142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14019	NC_011274	TTA	3	9	3381161	3381169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14020	NC_011274	ACC	2	6	3381185	3381190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14021	NC_011274	CAAT	2	8	3384049	3384056	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14022	NC_011274	AT	3	6	3384058	3384063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14023	NC_011274	ATT	2	6	3384093	3384098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14024	NC_011274	GAA	2	6	3384201	3384206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14025	NC_011274	TAA	2	6	3385539	3385544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14026	NC_011274	GAG	2	6	3385557	3385562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14027	NC_011274	AAG	2	6	3385606	3385611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14028	NC_011274	AGC	2	6	3385641	3385646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14029	NC_011274	TTA	2	6	3386596	3386601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14030	NC_011274	CGG	2	6	3386630	3386635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14031	NC_011274	CTCA	2	8	3386669	3386676	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14032	NC_011274	AG	3	6	3386747	3386752	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14033	NC_011274	GGT	2	6	3386766	3386771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14034	NC_011274	CTA	2	6	3386783	3386788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14035	NC_011274	ACA	2	6	3386799	3386804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14036	NC_011274	AATT	2	8	3386818	3386825	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14037	NC_011274	ATT	2	6	3386907	3386912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14038	NC_011274	AAT	2	6	3386963	3386968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14039	NC_011274	GTT	2	6	3386969	3386974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14040	NC_011274	TCC	2	6	3387478	3387483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14041	NC_011274	GTC	2	6	3387484	3387489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14042	NC_011274	CGG	2	6	3387493	3387498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14043	NC_011274	CGC	2	6	3387523	3387528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14044	NC_011274	ATGA	2	8	3387579	3387586	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14045	NC_011274	A	7	7	3387593	3387599	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14046	NC_011274	T	7	7	3387615	3387621	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14047	NC_011274	T	6	6	3387642	3387647	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14048	NC_011274	CAG	2	6	3387651	3387656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14049	NC_011274	A	6	6	3387693	3387698	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14050	NC_011274	ATTA	2	8	3387743	3387750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14051	NC_011274	TGA	2	6	3387780	3387785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14052	NC_011274	CGA	2	6	3387819	3387824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14053	NC_011274	TCG	2	6	3388473	3388478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14054	NC_011274	CGA	2	6	3388486	3388491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14055	NC_011274	T	6	6	3388514	3388519	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14056	NC_011274	AGCC	2	8	3388801	3388808	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14057	NC_011274	GACA	2	8	3388818	3388825	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14058	NC_011274	TAC	2	6	3388837	3388842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14059	NC_011274	CAT	2	6	3388847	3388852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14060	NC_011274	A	7	7	3388936	3388942	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14061	NC_011274	GA	4	8	3392105	3392112	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14062	NC_011274	CGC	2	6	3392139	3392144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14063	NC_011274	AAT	2	6	3392192	3392197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14064	NC_011274	TAT	2	6	3392231	3392236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14065	NC_011274	GCGCT	2	10	3393266	3393275	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
14066	NC_011274	CA	3	6	3393292	3393297	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14067	NC_011274	GTT	2	6	3394825	3394830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14068	NC_011274	CAG	2	6	3398647	3398652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14069	NC_011274	TC	3	6	3398716	3398721	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14070	NC_011274	A	6	6	3398732	3398737	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14071	NC_011274	GGC	2	6	3398773	3398778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14072	NC_011274	CTA	2	6	3398812	3398817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14073	NC_011274	ACCA	2	8	3403587	3403594	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14074	NC_011274	GCA	2	6	3403598	3403603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14075	NC_011274	ATC	2	6	3403620	3403625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14076	NC_011274	A	6	6	3403694	3403699	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14077	NC_011274	CAG	2	6	3403701	3403706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14078	NC_011274	TGC	2	6	3403757	3403762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14079	NC_011274	GC	3	6	3403804	3403809	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14080	NC_011274	GC	3	6	3405850	3405855	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14081	NC_011274	TAC	2	6	3405869	3405874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14082	NC_011274	ATCT	2	8	3405883	3405890	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14083	NC_011274	A	7	7	3406972	3406978	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14084	NC_011274	TTAA	2	8	3406986	3406993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14085	NC_011274	TATT	2	8	3406995	3407002	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14086	NC_011274	AC	3	6	3407014	3407019	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14087	NC_011274	TGT	2	6	3407045	3407050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14088	NC_011274	CGA	2	6	3408785	3408790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14089	NC_011274	TTCG	2	8	3408832	3408839	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14090	NC_011274	T	6	6	3408878	3408883	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14091	NC_011274	AGA	2	6	3408897	3408902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14092	NC_011274	CA	3	6	3408907	3408912	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14093	NC_011274	T	6	6	3410938	3410943	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14094	NC_011274	CAT	2	6	3410966	3410971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14095	NC_011274	TTC	2	6	3410986	3410991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14096	NC_011274	CA	3	6	3413623	3413628	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14097	NC_011274	CAT	2	6	3413658	3413663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14098	NC_011274	TCA	2	6	3413669	3413674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14099	NC_011274	AATG	2	8	3413675	3413682	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14100	NC_011274	CTT	2	6	3413693	3413698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14101	NC_011274	GCT	2	6	3413723	3413728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14102	NC_011274	GTT	2	6	3413801	3413806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14103	NC_011274	GCA	2	6	3413809	3413814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14104	NC_011274	CT	3	6	3413825	3413830	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14105	NC_011274	CATT	2	8	3413965	3413972	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14106	NC_011274	A	7	7	3413990	3413996	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14107	NC_011274	ATT	2	6	3414001	3414006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14108	NC_011274	GAA	2	6	3414028	3414033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14109	NC_011274	AG	3	6	3414036	3414041	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14110	NC_011274	CCG	2	6	3414073	3414078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14111	NC_011274	AATA	2	8	3414081	3414088	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14112	NC_011274	ATTT	2	8	3414114	3414121	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14113	NC_011274	ACA	2	6	3414151	3414156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14114	NC_011274	A	6	6	3414192	3414197	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14115	NC_011274	CGC	2	6	3414209	3414214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14116	NC_011274	T	6	6	3415590	3415595	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14117	NC_011274	ATT	2	6	3416775	3416780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14118	NC_011274	AAG	2	6	3416841	3416846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14119	NC_011274	A	6	6	3419723	3419728	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14120	NC_011274	GA	3	6	3419758	3419763	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14121	NC_011274	AAT	2	6	3419798	3419803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14122	NC_011274	AAAT	2	8	3419810	3419817	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14123	NC_011274	TAA	2	6	3419818	3419823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14124	NC_011274	AT	4	8	3419840	3419847	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14125	NC_011274	CAT	2	6	3419867	3419872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14126	NC_011274	T	8	8	3419916	3419923	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14127	NC_011274	TAA	2	6	3419978	3419983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14128	NC_011274	CTATT	2	10	3420003	3420012	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
14129	NC_011274	CG	3	6	3420016	3420021	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14130	NC_011274	T	6	6	3420062	3420067	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14131	NC_011274	T	6	6	3421257	3421262	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14132	NC_011274	TGA	2	6	3421303	3421308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14133	NC_011274	TGGC	2	8	3421309	3421316	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14134	NC_011274	AAT	2	6	3421325	3421330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14138	NC_011274	AAG	2	6	3421606	3421611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14140	NC_011274	CAG	3	9	3421643	3421651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14141	NC_011274	GAC	2	6	3421701	3421706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14143	NC_011274	TAAA	2	8	3421825	3421832	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14144	NC_011274	TCA	2	6	3421855	3421860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14150	NC_011274	GC	3	6	3422082	3422087	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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14159	NC_011274	TGGT	2	8	3422572	3422579	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14160	NC_011274	T	6	6	3422619	3422624	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14161	NC_011274	GGC	2	6	3422625	3422630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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14165	NC_011274	CTT	2	6	3422776	3422781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14172	NC_011274	GAA	2	6	3423161	3423166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14173	NC_011274	TGAT	2	8	3423294	3423301	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14174	NC_011274	GGA	2	6	3423305	3423310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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14198	NC_011274	AAATA	2	10	3425155	3425164	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14199	NC_011274	TTA	2	6	3425210	3425215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14200	NC_011274	GTAA	2	8	3425221	3425228	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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14202	NC_011274	AG	3	6	3425378	3425383	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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14243	NC_011274	C	6	6	3427640	3427645	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14244	NC_011274	AACG	2	8	3427882	3427889	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14245	NC_011274	CGACT	2	10	3427901	3427910	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
14246	NC_011274	TCGCT	2	10	3427928	3427937	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
14247	NC_011274	CTTT	2	8	3428056	3428063	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14248	NC_011274	ATG	2	6	3428066	3428071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14251	NC_011274	ACG	2	6	3428177	3428182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14252	NC_011274	GT	3	6	3428199	3428204	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14253	NC_011274	TCGGT	2	10	3428408	3428417	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
14254	NC_011274	CA	3	6	3428592	3428597	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14255	NC_011274	GTAC	2	8	3428622	3428629	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14256	NC_011274	GTCA	2	8	3428705	3428712	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14257	NC_011274	GGA	2	6	3428728	3428733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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14259	NC_011274	CG	3	6	3428830	3428835	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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14387	NC_011274	GA	3	6	3455334	3455339	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14388	NC_011274	GC	3	6	3455392	3455397	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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