MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum str. 287/91 chromosome

Total Repeats: 19633

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_011274	ATG	2	6	3218357	3218362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13502	NC_011274	ATC	2	6	3218366	3218371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13503	NC_011274	TCAT	2	8	3219271	3219278	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13504	NC_011274	TTCG	2	8	3219313	3219320	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13505	NC_011274	CTA	2	6	3219389	3219394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13506	NC_011274	CCA	2	6	3219395	3219400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13507	NC_011274	AAAT	2	8	3219536	3219543	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13508	NC_011274	GTG	2	6	3219564	3219569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13509	NC_011274	AAT	2	6	3219576	3219581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13510	NC_011274	CTA	2	6	3219662	3219667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13511	NC_011274	ACTC	2	8	3219671	3219678	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13512	NC_011274	A	6	6	3219687	3219692	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13513	NC_011274	CAT	2	6	3219728	3219733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13514	NC_011274	TAT	2	6	3219768	3219773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13515	NC_011274	TAT	2	6	3219800	3219805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13516	NC_011274	TA	3	6	3219818	3219823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13517	NC_011274	AT	3	6	3219829	3219834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13518	NC_011274	GGAA	2	8	3221640	3221647	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13519	NC_011274	AAT	2	6	3223071	3223076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13520	NC_011274	TCG	2	6	3223094	3223099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13521	NC_011274	A	6	6	3223137	3223142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13522	NC_011274	T	6	6	3223163	3223168	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13523	NC_011274	A	7	7	3223844	3223850	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13524	NC_011274	A	7	7	3223909	3223915	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13525	NC_011274	CTG	2	6	3223999	3224004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13526	NC_011274	GC	3	6	3224067	3224072	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13527	NC_011274	TGA	2	6	3224075	3224080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13528	NC_011274	CCG	2	6	3224107	3224112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13529	NC_011274	CGCCC	2	10	3224124	3224133	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
13530	NC_011274	TCA	2	6	3224173	3224178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13531	NC_011274	CA	3	6	3224201	3224206	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13532	NC_011274	AAT	2	6	3224614	3224619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13533	NC_011274	CGG	2	6	3224925	3224930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13534	NC_011274	ACG	2	6	3224988	3224993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13535	NC_011274	GGC	2	6	3225093	3225098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13536	NC_011274	T	7	7	3227475	3227481	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13537	NC_011274	T	6	6	3227485	3227490	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13538	NC_011274	CAG	2	6	3227519	3227524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13539	NC_011274	CGG	2	6	3227559	3227564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13540	NC_011274	CAA	2	6	3227597	3227602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13541	NC_011274	TAA	2	6	3227657	3227662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13542	NC_011274	ATG	2	6	3227673	3227678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13543	NC_011274	TCA	2	6	3227686	3227691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13544	NC_011274	G	6	6	3227745	3227750	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13545	NC_011274	CTTTA	2	10	3227775	3227784	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
13546	NC_011274	A	8	8	3227790	3227797	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13547	NC_011274	TGA	2	6	3227879	3227884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13548	NC_011274	GA	3	6	3229337	3229342	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13549	NC_011274	GC	3	6	3229353	3229358	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13550	NC_011274	ATA	2	6	3229360	3229365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13551	NC_011274	AAT	2	6	3232234	3232239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13552	NC_011274	GGC	2	6	3232247	3232252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13553	NC_011274	TCA	2	6	3232308	3232313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13554	NC_011274	ATT	2	6	3233693	3233698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13555	NC_011274	GAT	2	6	3233789	3233794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13556	NC_011274	ACT	2	6	3233809	3233814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13557	NC_011274	GAT	2	6	3234527	3234532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13558	NC_011274	CGC	2	6	3235875	3235880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13559	NC_011274	AT	3	6	3236776	3236781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13560	NC_011274	A	6	6	3236795	3236800	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13561	NC_011274	ATT	2	6	3236807	3236812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13562	NC_011274	CCTG	2	8	3237183	3237190	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13563	NC_011274	TAT	2	6	3237232	3237237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13564	NC_011274	TAAA	2	8	3237250	3237257	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13565	NC_011274	CCG	2	6	3237991	3237996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13566	NC_011274	CG	3	6	3237995	3238000	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13567	NC_011274	CCA	2	6	3238009	3238014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13568	NC_011274	TGC	2	6	3238055	3238060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13569	NC_011274	TGT	2	6	3238076	3238081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13570	NC_011274	CGT	2	6	3238089	3238094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13571	NC_011274	ATG	2	6	3238120	3238125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13572	NC_011274	A	6	6	3239269	3239274	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13573	NC_011274	AGC	3	9	3239293	3239301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13574	NC_011274	GCT	2	6	3239616	3239621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13575	NC_011274	AGTTGT	2	12	3239636	3239647	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13576	NC_011274	TCAT	2	8	3239712	3239719	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13577	NC_011274	GGC	2	6	3239730	3239735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13578	NC_011274	AG	3	6	3239737	3239742	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13579	NC_011274	GAA	2	6	3239809	3239814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13580	NC_011274	ATCG	2	8	3241605	3241612	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13581	NC_011274	CGC	2	6	3243581	3243586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13582	NC_011274	CGC	3	9	3243598	3243606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13583	NC_011274	GGC	2	6	3243609	3243614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13584	NC_011274	T	7	7	3243616	3243622	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13585	NC_011274	CAG	2	6	3244395	3244400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13586	NC_011274	CCA	2	6	3244404	3244409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13587	NC_011274	T	6	6	3244456	3244461	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13588	NC_011274	AT	3	6	3245281	3245286	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13589	NC_011274	TAAAT	2	10	3245288	3245297	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13590	NC_011274	AATGAT	2	12	3245303	3245314	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13591	NC_011274	T	6	6	3245339	3245344	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13592	NC_011274	CAA	2	6	3245414	3245419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13593	NC_011274	CAT	2	6	3245443	3245448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13594	NC_011274	AT	3	6	3245464	3245469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13595	NC_011274	AGG	2	6	3245480	3245485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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13597	NC_011274	ATT	2	6	3247795	3247800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13598	NC_011274	AGTA	2	8	3247801	3247808	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13599	NC_011274	TAA	2	6	3247858	3247863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13600	NC_011274	GAAA	2	8	3247865	3247872	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13601	NC_011274	TTAT	2	8	3247896	3247903	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13602	NC_011274	TAGG	2	8	3247926	3247933	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13603	NC_011274	AATA	2	8	3247946	3247953	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13604	NC_011274	ATT	2	6	3247958	3247963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13605	NC_011274	CT	3	6	3247987	3247992	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13606	NC_011274	ATG	2	6	3247993	3247998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13607	NC_011274	CTAC	2	8	3248072	3248079	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13608	NC_011274	GTT	2	6	3249686	3249691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13609	NC_011274	CGC	2	6	3249835	3249840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13610	NC_011274	AC	3	6	3249851	3249856	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13611	NC_011274	TGT	2	6	3249917	3249922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13612	NC_011274	GC	3	6	3250078	3250083	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13613	NC_011274	T	6	6	3251475	3251480	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13614	NC_011274	CAC	2	6	3251496	3251501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13615	NC_011274	AGT	2	6	3251536	3251541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13616	NC_011274	AAT	2	6	3251562	3251567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13617	NC_011274	GCGCT	2	10	3253622	3253631	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
13618	NC_011274	CCT	2	6	3254828	3254833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13619	NC_011274	GCG	2	6	3254847	3254852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13620	NC_011274	TGCC	2	8	3255482	3255489	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13621	NC_011274	T	6	6	3255522	3255527	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13622	NC_011274	CAA	2	6	3255550	3255555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13624	NC_011274	CGC	2	6	3256422	3256427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13625	NC_011274	GCA	2	6	3256590	3256595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13626	NC_011274	A	6	6	3256597	3256602	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13627	NC_011274	CATGT	2	10	3256603	3256612	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
13628	NC_011274	GC	4	8	3256664	3256671	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13629	NC_011274	GCCT	2	8	3256708	3256715	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13630	NC_011274	CTG	3	9	3256726	3256734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13753	NC_011274	AT	3	6	3278956	3278961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13754	NC_011274	TCAA	2	8	3279020	3279027	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13755	NC_011274	T	7	7	3279134	3279140	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13756	NC_011274	TTTG	2	8	3279147	3279154	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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