MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum str. 287/91 chromosome

Total Repeats: 19633

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_011274	T	7	7	3089899	3089905	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13002	NC_011274	TGT	2	6	3089915	3089920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13003	NC_011274	GT	3	6	3089919	3089924	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13004	NC_011274	A	8	8	3089952	3089959	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13005	NC_011274	CGT	2	6	3089990	3089995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13006	NC_011274	T	6	6	3090117	3090122	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13007	NC_011274	A	7	7	3090935	3090941	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13008	NC_011274	ACA	2	6	3090957	3090962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13009	NC_011274	CT	3	6	3091858	3091863	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13010	NC_011274	GGC	2	6	3091877	3091882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13011	NC_011274	ATT	2	6	3091912	3091917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13012	NC_011274	CTT	2	6	3091927	3091932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13013	NC_011274	TCA	2	6	3091939	3091944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13014	NC_011274	GGC	2	6	3091962	3091967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13015	NC_011274	A	6	6	3091968	3091973	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13016	NC_011274	T	6	6	3091991	3091996	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13017	NC_011274	A	6	6	3092066	3092071	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13018	NC_011274	TC	3	6	3092871	3092876	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13019	NC_011274	TGT	2	6	3092942	3092947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13020	NC_011274	ATT	2	6	3093648	3093653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13021	NC_011274	TAA	2	6	3093679	3093684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13022	NC_011274	GGC	2	6	3093716	3093721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13023	NC_011274	GCA	2	6	3093768	3093773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13024	NC_011274	GGCA	2	8	3093776	3093783	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13025	NC_011274	GGA	2	6	3093789	3093794	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13026	NC_011274	CAT	2	6	3094759	3094764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13027	NC_011274	A	6	6	3094774	3094779	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13028	NC_011274	CTAA	2	8	3094814	3094821	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13029	NC_011274	CGC	2	6	3094822	3094827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13030	NC_011274	A	7	7	3094845	3094851	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13031	NC_011274	CAG	2	6	3094879	3094884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13032	NC_011274	TCG	2	6	3095987	3095992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13033	NC_011274	A	6	6	3096002	3096007	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13034	NC_011274	GCC	2	6	3096013	3096018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13035	NC_011274	ATG	2	6	3097250	3097255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13036	NC_011274	TCG	2	6	3098360	3098365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13037	NC_011274	TTAA	2	8	3098418	3098425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13038	NC_011274	GAA	2	6	3098484	3098489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13039	NC_011274	TCG	2	6	3098584	3098589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13040	NC_011274	TAT	2	6	3098637	3098642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13041	NC_011274	GAC	2	6	3099105	3099110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13042	NC_011274	GAC	2	6	3103810	3103815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13043	NC_011274	CAA	2	6	3103847	3103852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13044	NC_011274	CG	3	6	3103865	3103870	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13045	NC_011274	TGCC	2	8	3103946	3103953	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13046	NC_011274	ATA	2	6	3104012	3104017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13047	NC_011274	GGC	2	6	3104818	3104823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13048	NC_011274	ATCA	2	8	3104850	3104857	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13049	NC_011274	AGCGC	2	10	3104873	3104882	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
13050	NC_011274	AAC	2	6	3104893	3104898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13051	NC_011274	CTT	2	6	3105831	3105836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13052	NC_011274	A	7	7	3105846	3105852	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13053	NC_011274	CGT	2	6	3105861	3105866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13054	NC_011274	CGA	2	6	3105873	3105878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13055	NC_011274	ATT	2	6	3105928	3105933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13056	NC_011274	A	7	7	3105970	3105976	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13057	NC_011274	TA	3	6	3105977	3105982	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13058	NC_011274	ATTC	2	8	3107108	3107115	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13059	NC_011274	AAT	2	6	3107683	3107688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13060	NC_011274	TGTTT	2	10	3111235	3111244	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
13061	NC_011274	TTC	2	6	3111306	3111311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13062	NC_011274	ATTT	2	8	3111350	3111357	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13063	NC_011274	ACC	2	6	3111449	3111454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13064	NC_011274	CA	3	6	3111455	3111460	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13065	NC_011274	AAT	2	6	3111546	3111551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13066	NC_011274	TAT	2	6	3111611	3111616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13067	NC_011274	ATC	2	6	3111657	3111662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13068	NC_011274	GCT	2	6	3111669	3111674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13069	NC_011274	GAG	2	6	3111683	3111688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13070	NC_011274	GCC	2	6	3111692	3111697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13071	NC_011274	ATTG	2	8	3111724	3111731	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13072	NC_011274	A	6	6	3111740	3111745	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13073	NC_011274	TGA	2	6	3111747	3111752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13074	NC_011274	ATA	2	6	3111829	3111834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13075	NC_011274	ACG	2	6	3111855	3111860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13076	NC_011274	CGG	2	6	3111905	3111910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13077	NC_011274	AGGG	2	8	3111913	3111920	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
13078	NC_011274	GAT	2	6	3111935	3111940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13079	NC_011274	GCATC	2	10	3112041	3112050	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
13080	NC_011274	TGGC	2	8	3112116	3112123	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13081	NC_011274	GGC	2	6	3112128	3112133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13082	NC_011274	CGA	2	6	3112142	3112147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13083	NC_011274	GCTC	2	8	3112166	3112173	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13084	NC_011274	CGAT	2	8	3112244	3112251	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13085	NC_011274	TGG	2	6	3112271	3112276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13086	NC_011274	CT	3	6	3112367	3112372	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13087	NC_011274	GGC	2	6	3112387	3112392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13088	NC_011274	AG	3	6	3113275	3113280	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13089	NC_011274	TTTC	2	8	3113287	3113294	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13090	NC_011274	CA	3	6	3113318	3113323	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13091	NC_011274	CCA	2	6	3113332	3113337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13092	NC_011274	ATT	2	6	3114144	3114149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13093	NC_011274	AAT	2	6	3114235	3114240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13094	NC_011274	GTA	2	6	3116190	3116195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13095	NC_011274	CTG	2	6	3116208	3116213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13096	NC_011274	GTC	2	6	3116236	3116241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13097	NC_011274	GC	3	6	3116575	3116580	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13098	NC_011274	CAG	2	6	3116602	3116607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13099	NC_011274	GCC	2	6	3116643	3116648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13100	NC_011274	CTAA	2	8	3117006	3117013	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13101	NC_011274	CTG	2	6	3118256	3118261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13102	NC_011274	GCA	2	6	3118336	3118341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13103	NC_011274	TTC	2	6	3118363	3118368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13104	NC_011274	TTCAGT	2	12	3118386	3118397	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13105	NC_011274	CAT	2	6	3118398	3118403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13106	NC_011274	CATT	2	8	3118415	3118422	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13107	NC_011274	ATT	2	6	3118530	3118535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13108	NC_011274	TAT	2	6	3118541	3118546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13109	NC_011274	AAT	2	6	3118561	3118566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13110	NC_011274	TAG	2	6	3118579	3118584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13111	NC_011274	CCT	3	9	3120089	3120097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13112	NC_011274	AGG	2	6	3120103	3120108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13113	NC_011274	CGC	2	6	3123278	3123283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13114	NC_011274	GGC	2	6	3123297	3123302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13115	NC_011274	T	7	7	3123416	3123422	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13116	NC_011274	CAG	2	6	3124440	3124445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13117	NC_011274	C	6	6	3125270	3125275	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13118	NC_011274	CGC	2	6	3125278	3125283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13119	NC_011274	GCC	2	6	3129671	3129676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13120	NC_011274	ATT	2	6	3129686	3129691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13121	NC_011274	TAA	2	6	3129692	3129697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13122	NC_011274	ACG	2	6	3129705	3129710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13123	NC_011274	T	6	6	3129726	3129731	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13124	NC_011274	GCC	2	6	3129896	3129901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13125	NC_011274	CTG	2	6	3129930	3129935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13126	NC_011274	GCT	2	6	3130026	3130031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13127	NC_011274	ATC	2	6	3130050	3130055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13128	NC_011274	CTT	2	6	3130136	3130141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13129	NC_011274	T	6	6	3130140	3130145	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13252	NC_011274	A	6	6	3157139	3157144	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13254	NC_011274	A	7	7	3157188	3157194	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13255	NC_011274	AC	4	8	3157218	3157225	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13256	NC_011274	ATTTT	2	10	3157274	3157283	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13257	NC_011274	TTA	2	6	3157315	3157320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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