MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum str. 287/91 chromosome

Total Repeats: 19633

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_011274	CAGTA	2	10	2515118	2515127	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10502	NC_011274	TTA	2	6	2515172	2515177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10503	NC_011274	GT	4	8	2515180	2515187	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10504	NC_011274	T	7	7	2516503	2516509	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10505	NC_011274	CGGGCG	2	12	2516529	2516540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10506	NC_011274	CAA	2	6	2516609	2516614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10507	NC_011274	ACG	2	6	2516623	2516628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10508	NC_011274	TTTCGC	2	12	2516637	2516648	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10509	NC_011274	ATC	2	6	2516671	2516676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10510	NC_011274	AAC	2	6	2516711	2516716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10511	NC_011274	ATG	2	6	2516728	2516733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10512	NC_011274	ATC	2	6	2516784	2516789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10513	NC_011274	GA	3	6	2516852	2516857	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10514	NC_011274	TTC	2	6	2516865	2516870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10515	NC_011274	GAT	2	6	2516880	2516885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10516	NC_011274	GCA	2	6	2516951	2516956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10517	NC_011274	CCG	2	6	2516999	2517004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10518	NC_011274	CAT	2	6	2517105	2517110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10519	NC_011274	CGT	2	6	2517116	2517121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10520	NC_011274	GC	3	6	2517197	2517202	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10521	NC_011274	GCA	2	6	2517236	2517241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10522	NC_011274	CGT	2	6	2517249	2517254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10523	NC_011274	GCCA	2	8	2517322	2517329	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10524	NC_011274	TTA	2	6	2517439	2517444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10525	NC_011274	AT	3	6	2517457	2517462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10526	NC_011274	CAG	3	9	2517543	2517551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10527	NC_011274	AC	3	6	2517648	2517653	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10528	NC_011274	ACA	2	6	2517788	2517793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10529	NC_011274	ATC	2	6	2518137	2518142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10530	NC_011274	ATA	2	6	2518151	2518156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10531	NC_011274	CAA	2	6	2518204	2518209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10532	NC_011274	CGGTGC	2	12	2518222	2518233	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
10533	NC_011274	AAG	2	6	2518236	2518241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10534	NC_011274	TTGG	2	8	2518349	2518356	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10535	NC_011274	GC	4	8	2518373	2518380	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10536	NC_011274	AGC	2	6	2518437	2518442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10537	NC_011274	CATT	2	8	2518476	2518483	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10538	NC_011274	CAT	2	6	2518490	2518495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10539	NC_011274	CGG	2	6	2518521	2518526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10540	NC_011274	GCCAG	2	10	2518567	2518576	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10541	NC_011274	T	6	6	2518677	2518682	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10542	NC_011274	CAT	2	6	2518720	2518725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10543	NC_011274	TA	3	6	2518726	2518731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10544	NC_011274	AAT	2	6	2518741	2518746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10545	NC_011274	AGC	2	6	2518799	2518804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10546	NC_011274	CAAA	2	8	2518807	2518814	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10547	NC_011274	AGC	2	6	2518826	2518831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10548	NC_011274	TGG	2	6	2518896	2518901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10549	NC_011274	CATGC	2	10	2518933	2518942	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10550	NC_011274	CAT	2	6	2519003	2519008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10551	NC_011274	AGT	2	6	2519108	2519113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10552	NC_011274	CTGCC	2	10	2519971	2519980	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
10553	NC_011274	CCG	2	6	2521315	2521320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10554	NC_011274	CG	3	6	2521357	2521362	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10555	NC_011274	CCG	2	6	2521363	2521368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10556	NC_011274	ACG	2	6	2521600	2521605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10557	NC_011274	AACA	2	8	2521606	2521613	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10558	NC_011274	CA	3	6	2521667	2521672	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10559	NC_011274	AGG	2	6	2521714	2521719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10560	NC_011274	CGG	2	6	2521724	2521729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10561	NC_011274	TCA	2	6	2521740	2521745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10562	NC_011274	ACT	2	6	2521753	2521758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10563	NC_011274	CCG	2	6	2521770	2521775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10564	NC_011274	AGG	2	6	2521835	2521840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10565	NC_011274	CGG	2	6	2521845	2521850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10566	NC_011274	TCA	2	6	2521861	2521866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10567	NC_011274	CAC	2	6	2521869	2521874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10568	NC_011274	CCA	2	6	2521948	2521953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10569	NC_011274	A	6	6	2521958	2521963	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10570	NC_011274	T	6	6	2521979	2521984	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10571	NC_011274	GCA	2	6	2522014	2522019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10572	NC_011274	GAC	2	6	2522062	2522067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10573	NC_011274	A	6	6	2523058	2523063	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10574	NC_011274	ATA	2	6	2523106	2523111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10575	NC_011274	A	6	6	2523158	2523163	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10576	NC_011274	GGA	2	6	2523188	2523193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10577	NC_011274	GA	3	6	2523192	2523197	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10578	NC_011274	TTTC	2	8	2523202	2523209	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10579	NC_011274	TTGC	2	8	2525572	2525579	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10580	NC_011274	TTAA	2	8	2525628	2525635	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10581	NC_011274	TAA	2	6	2525641	2525646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10582	NC_011274	CA	3	6	2526472	2526477	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10583	NC_011274	AGAT	2	8	2526483	2526490	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10584	NC_011274	AT	3	6	2527431	2527436	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10585	NC_011274	AATT	2	8	2527447	2527454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10586	NC_011274	A	6	6	2530757	2530762	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10587	NC_011274	TGT	2	6	2531807	2531812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10588	NC_011274	CCA	2	6	2531825	2531830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10589	NC_011274	CAAGTG	2	12	2531871	2531882	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10590	NC_011274	GCA	2	6	2531897	2531902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10591	NC_011274	T	6	6	2531933	2531938	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10592	NC_011274	ATT	2	6	2532849	2532854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10593	NC_011274	CTGG	2	8	2532898	2532905	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10594	NC_011274	A	6	6	2533948	2533953	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10595	NC_011274	T	6	6	2533970	2533975	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10596	NC_011274	TCACC	2	10	2533994	2534003	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
10597	NC_011274	ATT	2	6	2534047	2534052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10598	NC_011274	GCC	2	6	2534253	2534258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10599	NC_011274	T	7	7	2534568	2534574	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10600	NC_011274	GAA	2	6	2536906	2536911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10601	NC_011274	T	8	8	2536930	2536937	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10602	NC_011274	GCC	2	6	2536964	2536969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10603	NC_011274	CAG	2	6	2538179	2538184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10604	NC_011274	CCA	2	6	2540270	2540275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10605	NC_011274	TTA	2	6	2540286	2540291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10606	NC_011274	GCA	2	6	2540722	2540727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10607	NC_011274	AATT	2	8	2541420	2541427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10608	NC_011274	TCA	2	6	2541445	2541450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10609	NC_011274	TG	3	6	2541489	2541494	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10610	NC_011274	A	6	6	2542594	2542599	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10611	NC_011274	TCA	2	6	2546495	2546500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10612	NC_011274	TA	3	6	2546534	2546539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10613	NC_011274	TGA	2	6	2546545	2546550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10614	NC_011274	TCCC	2	8	2546579	2546586	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
10615	NC_011274	GAG	3	9	2546597	2546605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10616	NC_011274	TAA	2	6	2547472	2547477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10617	NC_011274	A	7	7	2547525	2547531	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10618	NC_011274	TGA	2	6	2547574	2547579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10619	NC_011274	CTC	2	6	2548554	2548559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10620	NC_011274	AAGCG	2	10	2548619	2548628	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
10621	NC_011274	ACG	2	6	2548649	2548654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10622	NC_011274	T	6	6	2548680	2548685	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10623	NC_011274	TCA	2	6	2548692	2548697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10624	NC_011274	C	6	6	2548863	2548868	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10625	NC_011274	GCG	2	6	2548869	2548874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10626	NC_011274	CAC	2	6	2548976	2548981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10627	NC_011274	GCG	2	6	2549059	2549064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10629	NC_011274	AACCA	2	10	2549113	2549122	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
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