MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum str. 287/91 chromosome

Total Repeats: 19633

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_011274	TGA	2	6	2351787	2351792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10002	NC_011274	ATC	2	6	2351852	2351857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10003	NC_011274	TTTA	2	8	2351864	2351871	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10004	NC_011274	T	8	8	2351934	2351941	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10005	NC_011274	T	6	6	2351945	2351950	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10006	NC_011274	AC	3	6	2351954	2351959	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10007	NC_011274	AAT	2	6	2352041	2352046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10008	NC_011274	AGT	2	6	2352076	2352081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10009	NC_011274	TCCCG	2	10	2352120	2352129	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
10010	NC_011274	ATTC	2	8	2352178	2352185	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10011	NC_011274	CCTTCA	2	12	2352203	2352214	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
10012	NC_011274	CGC	2	6	2355663	2355668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10013	NC_011274	TAACGC	2	12	2358460	2358471	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10014	NC_011274	TGC	2	6	2361389	2361394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10015	NC_011274	CT	3	6	2361398	2361403	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10016	NC_011274	GGC	2	6	2361544	2361549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10017	NC_011274	ATT	2	6	2361639	2361644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10018	NC_011274	ACA	2	6	2362922	2362927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10019	NC_011274	TTTG	2	8	2362928	2362935	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10020	NC_011274	T	6	6	2362941	2362946	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10021	NC_011274	T	6	6	2362948	2362953	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10022	NC_011274	AATA	2	8	2363014	2363021	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10023	NC_011274	TTA	2	6	2363063	2363068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10024	NC_011274	TAA	2	6	2363100	2363105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10025	NC_011274	AAT	2	6	2363138	2363143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10026	NC_011274	ATC	2	6	2363243	2363248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10027	NC_011274	GCA	2	6	2363282	2363287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10028	NC_011274	CCA	2	6	2363326	2363331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10029	NC_011274	AGT	2	6	2363433	2363438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10030	NC_011274	GCC	2	6	2363441	2363446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10031	NC_011274	AGC	2	6	2363449	2363454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10032	NC_011274	GAAA	2	8	2363476	2363483	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10033	NC_011274	GAAA	2	8	2363513	2363520	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10034	NC_011274	TTTA	2	8	2363536	2363543	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10035	NC_011274	TTA	2	6	2363576	2363581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10036	NC_011274	CTG	2	6	2363596	2363601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10037	NC_011274	TAAA	2	8	2363641	2363648	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10038	NC_011274	GCCAGC	2	12	2363697	2363708	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
10039	NC_011274	GAT	2	6	2363737	2363742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10040	NC_011274	GAA	2	6	2363794	2363799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10041	NC_011274	ATA	2	6	2363845	2363850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10042	NC_011274	A	7	7	2363887	2363893	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10043	NC_011274	A	8	8	2363928	2363935	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10044	NC_011274	ATA	2	6	2363962	2363967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10045	NC_011274	ATATG	2	10	2364036	2364045	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10046	NC_011274	AGA	2	6	2364054	2364059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10047	NC_011274	GA	3	6	2364090	2364095	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10048	NC_011274	TTCA	2	8	2364096	2364103	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10049	NC_011274	GCA	2	6	2364112	2364117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10050	NC_011274	A	6	6	2364147	2364152	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10051	NC_011274	ACT	2	6	2364225	2364230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10052	NC_011274	AATA	2	8	2364256	2364263	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10053	NC_011274	A	6	6	2364292	2364297	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10054	NC_011274	AT	3	6	2364331	2364336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10055	NC_011274	AGCA	2	8	2364338	2364345	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10056	NC_011274	AAC	2	6	2364366	2364371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10057	NC_011274	AT	3	6	2364401	2364406	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10058	NC_011274	ATTA	2	8	2364429	2364436	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10059	NC_011274	GGA	2	6	2364459	2364464	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10060	NC_011274	GAA	2	6	2364465	2364470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10061	NC_011274	ATC	2	6	2366012	2366017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10062	NC_011274	GAA	2	6	2366040	2366045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10063	NC_011274	T	8	8	2366069	2366076	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10064	NC_011274	TTG	2	6	2366082	2366087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10065	NC_011274	CTA	2	6	2366187	2366192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10066	NC_011274	TA	4	8	2366233	2366240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10067	NC_011274	G	6	6	2366286	2366291	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10068	NC_011274	TTTC	2	8	2366297	2366304	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10069	NC_011274	GCC	2	6	2368692	2368697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10070	NC_011274	GCTCA	2	10	2371344	2371353	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10071	NC_011274	ATTA	2	8	2371451	2371458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10072	NC_011274	AAC	2	6	2372348	2372353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10073	NC_011274	TTTA	2	8	2374920	2374927	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10074	NC_011274	GTTC	2	8	2374943	2374950	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10075	NC_011274	AAC	2	6	2374952	2374957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10076	NC_011274	GCT	2	6	2374961	2374966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10077	NC_011274	A	6	6	2375144	2375149	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10078	NC_011274	ATT	2	6	2379341	2379346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10079	NC_011274	ACG	2	6	2379432	2379437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10080	NC_011274	CGC	2	6	2379468	2379473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10081	NC_011274	CCT	2	6	2379482	2379487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10082	NC_011274	AAT	3	9	2379516	2379524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10083	NC_011274	AAT	3	9	2379538	2379546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10084	NC_011274	AT	3	6	2379571	2379576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10085	NC_011274	AAT	2	6	2379588	2379593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10086	NC_011274	AAT	2	6	2379603	2379608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10087	NC_011274	CAT	2	6	2379618	2379623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10088	NC_011274	AT	3	6	2379663	2379668	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10089	NC_011274	AGA	2	6	2379721	2379726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10091	NC_011274	TA	3	6	2380728	2380733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10092	NC_011274	AGGCC	2	10	2380743	2380752	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10093	NC_011274	A	6	6	2385175	2385180	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10094	NC_011274	A	6	6	2385289	2385294	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10095	NC_011274	GAT	2	6	2385298	2385303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10096	NC_011274	ATG	2	6	2386589	2386594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10097	NC_011274	AGA	2	6	2386631	2386636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10098	NC_011274	AGG	2	6	2386649	2386654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10099	NC_011274	CGA	2	6	2386664	2386669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10100	NC_011274	CG	3	6	2386814	2386819	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10101	NC_011274	CTT	2	6	2386830	2386835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10102	NC_011274	AAT	3	9	2386872	2386880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10103	NC_011274	CCG	2	6	2386928	2386933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10104	NC_011274	GCC	2	6	2386937	2386942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10105	NC_011274	CAG	2	6	2387002	2387007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10106	NC_011274	GCA	2	6	2387045	2387050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10107	NC_011274	CAT	3	9	2387055	2387063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10108	NC_011274	CGCC	2	8	2387142	2387149	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10109	NC_011274	GCT	2	6	2387152	2387157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10110	NC_011274	TAAT	2	8	2387209	2387216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10111	NC_011274	T	7	7	2387221	2387227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10112	NC_011274	AGCA	2	8	2387244	2387251	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10113	NC_011274	TAC	2	6	2387348	2387353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10114	NC_011274	CAT	2	6	2387367	2387372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10115	NC_011274	A	6	6	2387413	2387418	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10116	NC_011274	TGA	2	6	2387479	2387484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10117	NC_011274	TGG	2	6	2387487	2387492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10118	NC_011274	GAC	2	6	2387936	2387941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10119	NC_011274	GCAT	2	8	2388687	2388694	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10120	NC_011274	AAAGC	2	10	2388717	2388726	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
10121	NC_011274	TTAAT	2	10	2388775	2388784	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10122	NC_011274	A	6	6	2388816	2388821	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10123	NC_011274	GT	3	6	2399770	2399775	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10124	NC_011274	ATCA	2	8	2402222	2402229	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10125	NC_011274	ATT	2	6	2402262	2402267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10127	NC_011274	A	6	6	2403637	2403642	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10128	NC_011274	AGGG	2	8	2403657	2403664	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
10129	NC_011274	G	6	6	2403682	2403687	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10130	NC_011274	TGT	2	6	2404524	2404529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10131	NC_011274	T	6	6	2405497	2405502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10132	NC_011274	A	6	6	2405524	2405529	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10136	NC_011274	GGC	2	6	2408205	2408210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10145	NC_011274	A	6	6	2408516	2408521	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10146	NC_011274	ATA	2	6	2408544	2408549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10149	NC_011274	CCA	2	6	2408706	2408711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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10152	NC_011274	GTT	2	6	2408915	2408920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10174	NC_011274	T	6	6	2424987	2424992	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10175	NC_011274	T	6	6	2425008	2425013	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10248	NC_011274	GGCG	2	8	2455107	2455114	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10249	NC_011274	CAG	2	6	2455152	2455157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10250	NC_011274	CCAG	2	8	2455202	2455209	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10251	NC_011274	A	6	6	2455233	2455238	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10252	NC_011274	GCA	3	9	2455288	2455296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10253	NC_011274	CGG	2	6	2455337	2455342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10254	NC_011274	CGA	2	6	2455385	2455390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10255	NC_011274	CGG	3	9	2455394	2455402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10256	NC_011274	TCGC	2	8	2455412	2455419	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10257	NC_011274	ATC	2	6	2455456	2455461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10258	NC_011274	GCAAAC	2	12	2455480	2455491	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10260	NC_011274	TAC	2	6	2455596	2455601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10261	NC_011274	AATA	2	8	2455629	2455636	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10262	NC_011274	CGC	2	6	2455637	2455642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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10371	NC_011274	A	7	7	2486620	2486626	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10389	NC_011274	CCT	2	6	2490788	2490793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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10391	NC_011274	CTT	2	6	2491030	2491035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10393	NC_011274	CCAG	2	8	2491123	2491130	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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10432	NC_011274	AT	3	6	2495513	2495518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10433	NC_011274	CCAT	2	8	2495603	2495610	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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10488	NC_011274	A	7	7	2507785	2507791	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10489	NC_011274	TGA	2	6	2507840	2507845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10500	NC_011274	TTTTCA	2	12	2515102	2515113	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

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