MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853 chromosome

Total Repeats: 16792

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_011205	CCCA	2	8	4034134	4034141	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
14002	NC_011205	TGC	2	6	4034161	4034166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14003	NC_011205	CGC	2	6	4034199	4034204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14004	NC_011205	CCG	3	9	4034210	4034218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14005	NC_011205	CCG	2	6	4034242	4034247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14006	NC_011205	TCC	2	6	4034332	4034337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14007	NC_011205	GGCGC	2	10	4034338	4034347	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
14008	NC_011205	G	6	6	4034354	4034359	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14009	NC_011205	ATC	2	6	4034368	4034373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14010	NC_011205	GC	3	6	4034511	4034516	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14011	NC_011205	CCA	2	6	4034526	4034531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14012	NC_011205	TGGC	2	8	4034551	4034558	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14013	NC_011205	AAT	2	6	4034595	4034600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14014	NC_011205	GC	3	6	4034655	4034660	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14015	NC_011205	GC	3	6	4034669	4034674	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14016	NC_011205	CGTTC	2	10	4034755	4034764	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
14017	NC_011205	CATC	2	8	4034777	4034784	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14018	NC_011205	GCT	2	6	4034795	4034800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14019	NC_011205	GC	3	6	4034808	4034813	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14020	NC_011205	GAC	2	6	4034841	4034846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14021	NC_011205	GA	3	6	4034862	4034867	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14022	NC_011205	ACG	2	6	4034887	4034892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14023	NC_011205	TAA	2	6	4034966	4034971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14024	NC_011205	A	7	7	4035935	4035941	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14025	NC_011205	A	6	6	4035949	4035954	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14026	NC_011205	CAT	2	6	4036037	4036042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14027	NC_011205	AGG	2	6	4036069	4036074	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14028	NC_011205	TTC	2	6	4042218	4042223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14029	NC_011205	AT	3	6	4042274	4042279	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14030	NC_011205	A	6	6	4042360	4042365	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14031	NC_011205	GCAAG	2	10	4042386	4042395	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
14032	NC_011205	AAG	2	6	4042848	4042853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14033	NC_011205	CAT	2	6	4043395	4043400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14034	NC_011205	T	8	8	4043503	4043510	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14035	NC_011205	TCA	2	6	4045253	4045258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14036	NC_011205	GCGCC	2	10	4045319	4045328	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
14037	NC_011205	A	6	6	4049543	4049548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14038	NC_011205	CCT	2	6	4050325	4050330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14039	NC_011205	ATTA	2	8	4053073	4053080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14040	NC_011205	ATTTT	2	10	4053082	4053091	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14041	NC_011205	T	7	7	4053088	4053094	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14042	NC_011205	CAT	2	6	4053128	4053133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14043	NC_011205	ATTG	2	8	4053138	4053145	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14044	NC_011205	AAT	2	6	4053151	4053156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14045	NC_011205	ATTT	2	8	4053204	4053211	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14046	NC_011205	CAA	2	6	4059433	4059438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14047	NC_011205	GT	3	6	4063616	4063621	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14048	NC_011205	TTG	2	6	4063658	4063663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14049	NC_011205	AG	3	6	4066992	4066997	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14050	NC_011205	CT	3	6	4067017	4067022	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14051	NC_011205	CGC	2	6	4067047	4067052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14052	NC_011205	GTA	2	6	4067059	4067064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14053	NC_011205	CGT	2	6	4067081	4067086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14054	NC_011205	GTA	2	6	4067102	4067107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14055	NC_011205	TGT	2	6	4067119	4067124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14056	NC_011205	A	7	7	4067192	4067198	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14057	NC_011205	GCA	2	6	4067202	4067207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14058	NC_011205	A	6	6	4068148	4068153	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14059	NC_011205	GA	3	6	4068167	4068172	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14060	NC_011205	CCT	2	6	4068223	4068228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14061	NC_011205	CAT	2	6	4068302	4068307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14062	NC_011205	CAA	2	6	4068349	4068354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14063	NC_011205	GAG	2	6	4069669	4069674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14064	NC_011205	CTGC	2	8	4070881	4070888	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14065	NC_011205	GCAG	2	8	4070892	4070899	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14066	NC_011205	CG	3	6	4071010	4071015	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14067	NC_011205	CCG	2	6	4071047	4071052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14068	NC_011205	CG	3	6	4071146	4071151	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14069	NC_011205	CGC	2	6	4071189	4071194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14070	NC_011205	GTT	2	6	4071202	4071207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14071	NC_011205	A	6	6	4071256	4071261	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14072	NC_011205	GTT	2	6	4071274	4071279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14073	NC_011205	GC	3	6	4071281	4071286	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14074	NC_011205	ATC	2	6	4071316	4071321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14075	NC_011205	GCA	2	6	4071336	4071341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14076	NC_011205	A	6	6	4071389	4071394	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14077	NC_011205	ACAA	2	8	4071458	4071465	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
14078	NC_011205	A	7	7	4071520	4071526	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14079	NC_011205	GAT	2	6	4071588	4071593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14080	NC_011205	GGC	2	6	4071663	4071668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14081	NC_011205	GTG	2	6	4071682	4071687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14082	NC_011205	GCG	2	6	4071759	4071764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14083	NC_011205	GC	3	6	4071792	4071797	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14084	NC_011205	CGCC	2	8	4071803	4071810	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14085	NC_011205	T	6	6	4071828	4071833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14086	NC_011205	CAT	2	6	4071853	4071858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14087	NC_011205	GT	4	8	4075442	4075449	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14088	NC_011205	GC	3	6	4075473	4075478	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14089	NC_011205	TTG	2	6	4078126	4078131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14090	NC_011205	TCT	2	6	4078307	4078312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14091	NC_011205	TTC	2	6	4078325	4078330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14092	NC_011205	CG	3	6	4078400	4078405	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14093	NC_011205	A	6	6	4078413	4078418	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14094	NC_011205	GCT	2	6	4078543	4078548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14095	NC_011205	ATT	2	6	4078619	4078624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14096	NC_011205	GCT	2	6	4079285	4079290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14097	NC_011205	GTTG	2	8	4079371	4079378	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14098	NC_011205	TGG	2	6	4079417	4079422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14099	NC_011205	TCCCG	2	10	4079429	4079438	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
14100	NC_011205	GCC	2	6	4081143	4081148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14101	NC_011205	GC	3	6	4081159	4081164	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14102	NC_011205	GCC	2	6	4082691	4082696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14103	NC_011205	GCA	2	6	4082702	4082707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14104	NC_011205	TGT	2	6	4082731	4082736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14105	NC_011205	C	6	6	4086434	4086439	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14106	NC_011205	AGG	2	6	4087649	4087654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14107	NC_011205	TG	3	6	4087701	4087706	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14108	NC_011205	T	7	7	4087711	4087717	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14109	NC_011205	AGCGC	2	10	4088529	4088538	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
14110	NC_011205	AAT	2	6	4090117	4090122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14111	NC_011205	ACG	2	6	4092038	4092043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14112	NC_011205	GTT	2	6	4093214	4093219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14113	NC_011205	TGA	2	6	4093252	4093257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14114	NC_011205	TGA	2	6	4093285	4093290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14115	NC_011205	A	6	6	4093301	4093306	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14116	NC_011205	ACCAG	2	10	4093323	4093332	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
14117	NC_011205	ACC	2	6	4093483	4093488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14118	NC_011205	GCC	2	6	4093682	4093687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14119	NC_011205	GCC	2	6	4093727	4093732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14120	NC_011205	GCC	2	6	4093739	4093744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14121	NC_011205	CCA	2	6	4093811	4093816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14122	NC_011205	CGT	2	6	4093891	4093896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14123	NC_011205	CCAC	2	8	4093925	4093932	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
14124	NC_011205	TCCC	2	8	4094075	4094082	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
14125	NC_011205	CCAG	2	8	4094173	4094180	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14126	NC_011205	GCC	2	6	4094203	4094208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14127	NC_011205	ACC	2	6	4094211	4094216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14128	NC_011205	GCC	2	6	4094233	4094238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14129	NC_011205	AG	3	6	4094280	4094285	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14130	NC_011205	TCC	2	6	4094298	4094303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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14132	NC_011205	GAA	2	6	4094383	4094388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14139	NC_011205	CAC	2	6	4094624	4094629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14140	NC_011205	GCC	2	6	4094659	4094664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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14142	NC_011205	T	7	7	4094711	4094717	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14163	NC_011205	A	9	9	4102179	4102187	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14249	NC_011205	GC	3	6	4130915	4130920	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14250	NC_011205	G	6	6	4131008	4131013	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14251	NC_011205	TCC	2	6	4131018	4131023	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14252	NC_011205	CTGA	2	8	4131038	4131045	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14253	NC_011205	GTAC	2	8	4131122	4131129	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14254	NC_011205	TG	3	6	4131154	4131159	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14255	NC_011205	GGA	2	6	4131329	4131334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14256	NC_011205	AC	3	6	4131547	4131552	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14257	NC_011205	CGTC	2	8	4131565	4131572	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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14259	NC_011205	AGC	2	6	4131674	4131679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14262	NC_011205	GTT	2	6	4131783	4131788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14264	NC_011205	G	6	6	4132025	4132030	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14265	NC_011205	GT	4	8	4132083	4132090	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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14270	NC_011205	GCTG	2	8	4132369	4132376	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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14286	NC_011205	GA	3	6	4133537	4133542	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14287	NC_011205	GCA	3	9	4133586	4133594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14291	NC_011205	GGC	2	6	4133710	4133715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14292	NC_011205	GGT	2	6	4133724	4133729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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14294	NC_011205	CCGT	2	8	4133939	4133946	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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14383	NC_011205	T	6	6	4174840	4174845	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14384	NC_011205	GGC	2	6	4177537	4177542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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