MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853 chromosome

Total Repeats: 16792

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_011205	CAG	2	6	2674686	2674691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9002	NC_011205	TTA	2	6	2676793	2676798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9003	NC_011205	A	6	6	2677215	2677220	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9004	NC_011205	AAC	2	6	2677767	2677772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9005	NC_011205	TAT	2	6	2677784	2677789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9006	NC_011205	GGC	2	6	2677794	2677799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9007	NC_011205	A	6	6	2678821	2678826	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9008	NC_011205	TCA	2	6	2682722	2682727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9009	NC_011205	TA	3	6	2682761	2682766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9010	NC_011205	TGA	2	6	2682772	2682777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9011	NC_011205	TCCC	2	8	2682806	2682813	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
9012	NC_011205	GAG	3	9	2682824	2682832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9013	NC_011205	TAA	2	6	2683693	2683698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9014	NC_011205	A	7	7	2683746	2683752	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9015	NC_011205	TGA	2	6	2683795	2683800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9016	NC_011205	TCC	2	6	2684776	2684781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9017	NC_011205	AAGCG	2	10	2684840	2684849	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
9018	NC_011205	CTTT	2	8	2685451	2685458	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9019	NC_011205	ATTA	2	8	2685460	2685467	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9020	NC_011205	A	6	6	2686390	2686395	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9021	NC_011205	A	6	6	2686449	2686454	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9022	NC_011205	TGAAA	2	10	2686481	2686490	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
9023	NC_011205	TCA	2	6	2686504	2686509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9024	NC_011205	CGT	2	6	2686515	2686520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9025	NC_011205	CGATA	2	10	2686532	2686541	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
9026	NC_011205	TTAT	2	8	2688351	2688358	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9027	NC_011205	CAAA	2	8	2688373	2688380	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
9028	NC_011205	AGT	2	6	2688390	2688395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9029	NC_011205	CTGC	2	8	2688444	2688451	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9030	NC_011205	AT	3	6	2688469	2688474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9031	NC_011205	GAA	2	6	2688478	2688483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9032	NC_011205	CCGC	2	8	2688756	2688763	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9033	NC_011205	ACAGT	2	10	2688783	2688792	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
9034	NC_011205	GC	3	6	2688927	2688932	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9035	NC_011205	GAA	2	6	2688948	2688953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9036	NC_011205	CCGA	2	8	2689080	2689087	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9037	NC_011205	GAT	2	6	2689110	2689115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9038	NC_011205	ATT	2	6	2689148	2689153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9039	NC_011205	AGG	2	6	2689168	2689173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9040	NC_011205	GGC	2	6	2689199	2689204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9041	NC_011205	TAA	2	6	2689243	2689248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9042	NC_011205	GAA	3	9	2689251	2689259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9043	NC_011205	CT	3	6	2689266	2689271	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9044	NC_011205	GCC	2	6	2689295	2689300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9045	NC_011205	ACGCG	2	10	2689307	2689316	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
9046	NC_011205	CCTGG	2	10	2689369	2689378	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
9047	NC_011205	ACC	2	6	2689426	2689431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9048	NC_011205	CTTCA	2	10	2689443	2689452	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
9049	NC_011205	TCC	2	6	2689455	2689460	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9050	NC_011205	CTTTA	2	10	2689520	2689529	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
9051	NC_011205	GCCG	2	8	2689567	2689574	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9052	NC_011205	AATC	2	8	2689630	2689637	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9053	NC_011205	A	7	7	2689779	2689785	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9054	NC_011205	GCT	2	6	2689880	2689885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9055	NC_011205	CAC	2	6	2689900	2689905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9056	NC_011205	CGG	2	6	2689918	2689923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9057	NC_011205	GC	3	6	2689971	2689976	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9058	NC_011205	TGA	2	6	2690123	2690128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9059	NC_011205	GC	4	8	2690150	2690157	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9060	NC_011205	GGC	2	6	2690167	2690172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9061	NC_011205	GC	3	6	2690177	2690182	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9062	NC_011205	ACCA	2	8	2690195	2690202	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9063	NC_011205	GCC	2	6	2690240	2690245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9064	NC_011205	CAT	2	6	2690296	2690301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9065	NC_011205	TCT	2	6	2691359	2691364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9066	NC_011205	CGCC	2	8	2691373	2691380	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9067	NC_011205	GCCA	2	8	2701080	2701087	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9068	NC_011205	CGA	2	6	2701097	2701102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9069	NC_011205	GC	3	6	2701152	2701157	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9070	NC_011205	CAG	2	6	2701173	2701178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9071	NC_011205	CCA	2	6	2701262	2701267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9072	NC_011205	GAC	2	6	2701326	2701331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9073	NC_011205	GC	3	6	2701406	2701411	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9074	NC_011205	CTT	2	6	2701494	2701499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9075	NC_011205	TGCGC	2	10	2701551	2701560	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
9076	NC_011205	GCG	2	6	2701565	2701570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9077	NC_011205	CGC	2	6	2701594	2701599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9078	NC_011205	CG	4	8	2701665	2701672	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9079	NC_011205	CATCG	2	10	2701681	2701690	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
9080	NC_011205	CCA	2	6	2704752	2704757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9081	NC_011205	T	6	6	2705134	2705139	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9082	NC_011205	AGAA	2	8	2705198	2705205	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9083	NC_011205	GTG	2	6	2705247	2705252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9084	NC_011205	AATA	2	8	2705296	2705303	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9085	NC_011205	TAT	2	6	2705328	2705333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9086	NC_011205	AAT	2	6	2705341	2705346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9087	NC_011205	GCG	2	6	2705455	2705460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9088	NC_011205	A	7	7	2705464	2705470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9089	NC_011205	AGA	2	6	2705490	2705495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9090	NC_011205	GA	3	6	2705494	2705499	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9091	NC_011205	TTG	2	6	2707792	2707797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9093	NC_011205	ACTTT	2	10	2708036	2708045	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
9094	NC_011205	CTG	2	6	2711334	2711339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9096	NC_011205	AAC	2	6	2712503	2712508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9097	NC_011205	AAC	2	6	2712520	2712525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9098	NC_011205	GC	3	6	2712549	2712554	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9099	NC_011205	T	6	6	2712589	2712594	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9100	NC_011205	AT	3	6	2712605	2712610	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9101	NC_011205	CTG	2	6	2713252	2713257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9102	NC_011205	ATC	2	6	2713394	2713399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9103	NC_011205	CCA	2	6	2714715	2714720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9104	NC_011205	GC	3	6	2714755	2714760	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9105	NC_011205	GTA	2	6	2714779	2714784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9106	NC_011205	GCC	2	6	2714818	2714823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9107	NC_011205	GCG	2	6	2714828	2714833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9108	NC_011205	AAG	2	6	2714913	2714918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9109	NC_011205	CTTC	2	8	2714936	2714943	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9110	NC_011205	T	6	6	2715091	2715096	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9111	NC_011205	TTA	2	6	2717159	2717164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9112	NC_011205	ATTT	2	8	2717240	2717247	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9113	NC_011205	A	6	6	2722327	2722332	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9114	NC_011205	ATTT	2	8	2722392	2722399	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9115	NC_011205	ATA	2	6	2722452	2722457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9116	NC_011205	CT	3	6	2722460	2722465	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9117	NC_011205	TAT	3	9	2722466	2722474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9118	NC_011205	AG	3	6	2722500	2722505	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9119	NC_011205	TTG	2	6	2722522	2722527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9120	NC_011205	CTA	2	6	2722626	2722631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9121	NC_011205	A	6	6	2722649	2722654	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9122	NC_011205	CAAT	2	8	2722655	2722662	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9123	NC_011205	ATT	2	6	2722731	2722736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9124	NC_011205	CAA	2	6	2722747	2722752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9125	NC_011205	ATTG	2	8	2722759	2722766	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9126	NC_011205	ATAA	2	8	2722781	2722788	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9127	NC_011205	TTA	2	6	2722805	2722810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9128	NC_011205	ATT	2	6	2722831	2722836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9129	NC_011205	TC	3	6	2727517	2727522	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9130	NC_011205	GAT	2	6	2727534	2727539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9131	NC_011205	GAT	2	6	2727595	2727600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9133	NC_011205	A	6	6	2728491	2728496	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9264	NC_011205	CCG	2	6	2759400	2759405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9265	NC_011205	GTT	2	6	2759411	2759416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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