MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853 chromosome

Total Repeats: 16792

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_011205	TCC	2	6	2345823	2345828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8002	NC_011205	TCCCT	2	10	2345836	2345845	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
8003	NC_011205	ATT	2	6	2356885	2356890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8004	NC_011205	ATAACA	2	12	2356894	2356905	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8005	NC_011205	AC	3	6	2356952	2356957	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8006	NC_011205	ACG	2	6	2356996	2357001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8007	NC_011205	ATT	2	6	2357022	2357027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8008	NC_011205	AGT	2	6	2357061	2357066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8009	NC_011205	T	6	6	2357066	2357071	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8010	NC_011205	ACATAA	2	12	2357112	2357123	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8011	NC_011205	GGT	2	6	2361192	2361197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8012	NC_011205	GCCC	2	8	2361226	2361233	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8013	NC_011205	CTC	2	6	2361248	2361253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8014	NC_011205	GCC	2	6	2361256	2361261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8015	NC_011205	TCA	2	6	2361262	2361267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8016	NC_011205	TCA	2	6	2361288	2361293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8017	NC_011205	T	6	6	2362682	2362687	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8018	NC_011205	TAT	2	6	2362741	2362746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8019	NC_011205	ACC	2	6	2362793	2362798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8020	NC_011205	T	6	6	2362834	2362839	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8021	NC_011205	A	6	6	2362853	2362858	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8022	NC_011205	GCCA	2	8	2362945	2362952	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8023	NC_011205	TCC	2	6	2362964	2362969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8024	NC_011205	ATT	2	6	2363074	2363079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8025	NC_011205	AAT	2	6	2363155	2363160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8026	NC_011205	TCA	2	6	2363233	2363238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8027	NC_011205	GATT	2	8	2363259	2363266	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8028	NC_011205	CCA	2	6	2363278	2363283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8029	NC_011205	TA	3	6	2363578	2363583	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8030	NC_011205	TAA	2	6	2363628	2363633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8031	NC_011205	TAA	2	6	2363698	2363703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8032	NC_011205	TA	3	6	2363754	2363759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8033	NC_011205	TCG	2	6	2363801	2363806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8034	NC_011205	CAT	2	6	2363909	2363914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8035	NC_011205	C	6	6	2363921	2363926	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8036	NC_011205	GTA	2	6	2363961	2363966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8037	NC_011205	ACT	2	6	2363978	2363983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8038	NC_011205	AGG	2	6	2364134	2364139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8039	NC_011205	TGTTTA	2	12	2364205	2364216	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8040	NC_011205	CAT	2	6	2364270	2364275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8041	NC_011205	AT	3	6	2364294	2364299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8042	NC_011205	TAA	2	6	2364386	2364391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8043	NC_011205	TTC	2	6	2364464	2364469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8044	NC_011205	TC	3	6	2364565	2364570	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8045	NC_011205	GCTTA	2	10	2364595	2364604	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8046	NC_011205	CAG	2	6	2364615	2364620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8047	NC_011205	GAA	2	6	2364621	2364626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8048	NC_011205	TTG	2	6	2364714	2364719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8049	NC_011205	TTC	2	6	2365682	2365687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8050	NC_011205	TTG	2	6	2365819	2365824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8051	NC_011205	CCG	2	6	2365864	2365869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8052	NC_011205	CGC	2	6	2365874	2365879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8053	NC_011205	AATC	2	8	2365937	2365944	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8054	NC_011205	TCG	2	6	2365978	2365983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8055	NC_011205	ATT	2	6	2366016	2366021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8056	NC_011205	GTCAG	2	10	2366086	2366095	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
8057	NC_011205	T	6	6	2366121	2366126	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8058	NC_011205	GAA	2	6	2366131	2366136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8059	NC_011205	GCG	2	6	2366194	2366199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8060	NC_011205	CCGAA	2	10	2366231	2366240	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
8061	NC_011205	TCG	2	6	2366246	2366251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8062	NC_011205	GTAG	2	8	2366409	2366416	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8063	NC_011205	CAA	2	6	2366453	2366458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8064	NC_011205	T	6	6	2366461	2366466	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8065	NC_011205	AAG	2	6	2366495	2366500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8066	NC_011205	CGG	2	6	2366504	2366509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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8068	NC_011205	TGG	2	6	2366607	2366612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8069	NC_011205	ATT	2	6	2366616	2366621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8070	NC_011205	ATC	2	6	2366626	2366631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8071	NC_011205	GGAA	2	8	2366673	2366680	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8072	NC_011205	GACC	2	8	2366833	2366840	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8073	NC_011205	T	6	6	2366862	2366867	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8074	NC_011205	CTG	2	6	2366877	2366882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8075	NC_011205	TAT	2	6	2366947	2366952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8076	NC_011205	TACCT	2	10	2366973	2366982	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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8079	NC_011205	GGT	2	6	2372650	2372655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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8082	NC_011205	TATC	2	8	2376868	2376875	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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8093	NC_011205	A	6	6	2378396	2378401	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8095	NC_011205	TGA	2	6	2378781	2378786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8099	NC_011205	CTGT	2	8	2378892	2378899	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8100	NC_011205	TAT	2	6	2378927	2378932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8101	NC_011205	TTA	2	6	2378934	2378939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8102	NC_011205	AT	4	8	2378957	2378964	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8108	NC_011205	CAA	2	6	2382318	2382323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8110	NC_011205	TAA	2	6	2382403	2382408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8112	NC_011205	AATT	2	8	2382500	2382507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8113	NC_011205	ATT	2	6	2382515	2382520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8114	NC_011205	TA	3	6	2382537	2382542	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8115	NC_011205	GGCA	2	8	2383018	2383025	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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8117	NC_011205	TCTTT	2	10	2383077	2383086	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
8118	NC_011205	A	6	6	2383097	2383102	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8119	NC_011205	CT	4	8	2383226	2383233	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8120	NC_011205	TAA	2	6	2383720	2383725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8122	NC_011205	CTTT	2	8	2386744	2386751	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8123	NC_011205	CGC	2	6	2386802	2386807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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8127	NC_011205	CTG	2	6	2387739	2387744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8128	NC_011205	CGG	2	6	2387762	2387767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8129	NC_011205	A	6	6	2391580	2391585	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8131	NC_011205	G	6	6	2391655	2391660	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8132	NC_011205	GCT	2	6	2391688	2391693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8133	NC_011205	TC	3	6	2394021	2394026	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8134	NC_011205	TTTATC	2	12	2394027	2394038	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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8139	NC_011205	ACC	2	6	2394185	2394190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8140	NC_011205	CAC	2	6	2394263	2394268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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8143	NC_011205	GCG	2	6	2396062	2396067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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8146	NC_011205	CAT	2	6	2397096	2397101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8156	NC_011205	A	7	7	2402223	2402229	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8235	NC_011205	CGG	2	6	2417851	2417856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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8248	NC_011205	AACT	2	8	2418524	2418531	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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8252	NC_011205	AATG	2	8	2419790	2419797	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8253	NC_011205	ATT	2	6	2421709	2421714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8256	NC_011205	ATG	2	6	2421850	2421855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8257	NC_011205	AAT	2	6	2421903	2421908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8258	NC_011205	TAT	2	6	2421912	2421917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8393	NC_011205	CGC	2	6	2465369	2465374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8394	NC_011205	CGG	2	6	2465399	2465404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8395	NC_011205	GCT	2	6	2465492	2465497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8396	NC_011205	GTG	2	6	2465521	2465526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8397	NC_011205	AACC	2	8	2465594	2465601	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8398	NC_011205	TGT	2	6	2465637	2465642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8401	NC_011205	GCC	2	6	2465764	2465769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8402	NC_011205	T	6	6	2465817	2465822	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8432	NC_011205	GGC	2	6	2480264	2480269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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8435	NC_011205	TA	3	6	2481024	2481029	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8436	NC_011205	TA	3	6	2481088	2481093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8452	NC_011205	T	6	6	2487922	2487927	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8472	NC_011205	T	9	9	2502287	2502295	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8479	NC_011205	TGA	2	6	2508579	2508584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8480	NC_011205	CTA	2	6	2508666	2508671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8481	NC_011205	TTTA	2	8	2511139	2511146	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8482	NC_011205	GTTC	2	8	2511162	2511169	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8483	NC_011205	AAC	2	6	2511171	2511176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8484	NC_011205	GCT	2	6	2511180	2511185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8492	NC_011205	AT	3	6	2515790	2515795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8493	NC_011205	AAT	2	6	2515807	2515812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8495	NC_011205	CAT	2	6	2515837	2515842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8500	NC_011205	A	6	6	2516174	2516179	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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