MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853 chromosome

Total Repeats: 16792

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_011205	TCC	2	6	1647319	1647324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5502	NC_011205	TTA	2	6	1647330	1647335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_011205	TAAT	2	8	1647352	1647359	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_011205	CTT	2	6	1647413	1647418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5505	NC_011205	TCG	2	6	1647429	1647434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5506	NC_011205	ATAC	2	8	1647443	1647450	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5507	NC_011205	AT	3	6	1647478	1647483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_011205	CAA	2	6	1647487	1647492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5509	NC_011205	ATT	2	6	1647533	1647538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_011205	A	6	6	1647568	1647573	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_011205	ATC	2	6	1647647	1647652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5512	NC_011205	TAT	2	6	1647657	1647662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_011205	AATG	2	8	1647739	1647746	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_011205	ATT	2	6	1647755	1647760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5515	NC_011205	GGT	2	6	1647791	1647796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_011205	GTG	2	6	1647856	1647861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_011205	ACA	2	6	1647882	1647887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5518	NC_011205	ATA	2	6	1647932	1647937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_011205	TAT	2	6	1647957	1647962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_011205	T	6	6	1647962	1647967	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_011205	T	7	7	1648014	1648020	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_011205	TC	3	6	1648061	1648066	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5523	NC_011205	T	7	7	1648092	1648098	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5524	NC_011205	TGG	2	6	1648109	1648114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_011205	TAT	2	6	1648227	1648232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_011205	AT	3	6	1648231	1648236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_011205	T	7	7	1648236	1648242	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5528	NC_011205	T	7	7	1648251	1648257	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5529	NC_011205	AAAG	2	8	1648281	1648288	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5530	NC_011205	ATG	2	6	1648307	1648312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5531	NC_011205	TAC	2	6	1648321	1648326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5532	NC_011205	TAT	2	6	1648392	1648397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5533	NC_011205	AGA	2	6	1648407	1648412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5534	NC_011205	TTAT	2	8	1648747	1648754	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_011205	GATT	2	8	1648884	1648891	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_011205	TGA	3	9	1648899	1648907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_011205	AAC	2	6	1648944	1648949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5538	NC_011205	ATT	2	6	1648988	1648993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5539	NC_011205	GATT	2	8	1649000	1649007	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_011205	AAT	2	6	1649018	1649023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_011205	T	6	6	1649071	1649076	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5542	NC_011205	CGG	2	6	1649132	1649137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5543	NC_011205	TCATA	2	10	1649181	1649190	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5544	NC_011205	ACC	2	6	1649204	1649209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5545	NC_011205	TAAA	2	8	1649217	1649224	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5546	NC_011205	AGAA	2	8	1649314	1649321	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_011205	TG	3	6	1649437	1649442	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_011205	ACATAA	2	12	1649456	1649467	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5549	NC_011205	C	6	6	1649483	1649488	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5550	NC_011205	GAAT	2	8	1650980	1650987	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_011205	AG	3	6	1651087	1651092	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_011205	GTT	2	6	1653752	1653757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_011205	ATT	2	6	1653784	1653789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_011205	TTTTA	2	10	1653818	1653827	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_011205	TGA	2	6	1653829	1653834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_011205	TTC	2	6	1653939	1653944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5557	NC_011205	AAGG	2	8	1655384	1655391	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_011205	GAA	2	6	1656919	1656924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_011205	TGC	2	6	1656925	1656930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5560	NC_011205	CAA	2	6	1657005	1657010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5561	NC_011205	ATT	2	6	1657015	1657020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_011205	TGC	2	6	1657065	1657070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5563	NC_011205	A	6	6	1657073	1657078	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_011205	TTA	2	6	1657140	1657145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_011205	TCCT	2	8	1658902	1658909	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5566	NC_011205	AAT	2	6	1659555	1659560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_011205	AGA	2	6	1663152	1663157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_011205	CT	3	6	1663165	1663170	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5569	NC_011205	GTG	2	6	1666753	1666758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5570	NC_011205	A	6	6	1666851	1666856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5571	NC_011205	CAA	2	6	1666936	1666941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5572	NC_011205	GAA	2	6	1666943	1666948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5573	NC_011205	AAC	2	6	1668527	1668532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5574	NC_011205	T	7	7	1670215	1670221	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5575	NC_011205	TAT	2	6	1670290	1670295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5576	NC_011205	CAT	2	6	1670304	1670309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5578	NC_011205	CCA	2	6	1671050	1671055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5579	NC_011205	GTCA	2	8	1672259	1672266	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5580	NC_011205	GCC	2	6	1672905	1672910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5581	NC_011205	CGT	2	6	1675155	1675160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5582	NC_011205	ATG	2	6	1675167	1675172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5583	NC_011205	AAT	2	6	1675175	1675180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5584	NC_011205	TTA	2	6	1675190	1675195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5585	NC_011205	ATT	2	6	1675319	1675324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5586	NC_011205	TA	3	6	1675334	1675339	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5587	NC_011205	GGT	2	6	1676405	1676410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5588	NC_011205	ATT	2	6	1676492	1676497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5589	NC_011205	AGTC	2	8	1676520	1676527	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5590	NC_011205	CCT	2	6	1676532	1676537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5591	NC_011205	CAT	3	9	1676595	1676603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5592	NC_011205	TAT	2	6	1676634	1676639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5593	NC_011205	TTG	2	6	1676656	1676661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5594	NC_011205	AAG	2	6	1676687	1676692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5595	NC_011205	TAT	2	6	1676705	1676710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5596	NC_011205	AAC	2	6	1676717	1676722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5597	NC_011205	GGCAG	2	10	1676738	1676747	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5598	NC_011205	TGT	2	6	1676815	1676820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5599	NC_011205	GAG	2	6	1676876	1676881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5600	NC_011205	CCG	2	6	1677289	1677294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5601	NC_011205	AAT	2	6	1677316	1677321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_011205	CAG	2	6	1677331	1677336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5603	NC_011205	TA	3	6	1677452	1677457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_011205	ACA	2	6	1677504	1677509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5605	NC_011205	TAC	2	6	1677514	1677519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5606	NC_011205	GCC	2	6	1677604	1677609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5607	NC_011205	ATT	2	6	1677624	1677629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5608	NC_011205	GGC	2	6	1677644	1677649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5609	NC_011205	ATG	2	6	1677713	1677718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5610	NC_011205	TTG	2	6	1678589	1678594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5611	NC_011205	AGC	2	6	1678691	1678696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5612	NC_011205	GC	3	6	1680202	1680207	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5613	NC_011205	GCG	2	6	1680225	1680230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5614	NC_011205	A	6	6	1681728	1681733	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5615	NC_011205	CGG	2	6	1681745	1681750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5616	NC_011205	GCA	2	6	1681777	1681782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5617	NC_011205	GCA	3	9	1681850	1681858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5618	NC_011205	ACG	2	6	1681874	1681879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5619	NC_011205	CATT	2	8	1681893	1681900	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5620	NC_011205	TCA	2	6	1681912	1681917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5621	NC_011205	AAT	2	6	1681956	1681961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5622	NC_011205	TG	3	6	1682034	1682039	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5623	NC_011205	GC	3	6	1682060	1682065	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5624	NC_011205	T	6	6	1682067	1682072	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5625	NC_011205	GTT	2	6	1688772	1688777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5626	NC_011205	CTT	2	6	1688788	1688793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5627	NC_011205	GCAA	2	8	1688821	1688828	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5628	NC_011205	CGG	2	6	1688830	1688835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5629	NC_011205	AGG	2	6	1688905	1688910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5630	NC_011205	GCG	2	6	1688914	1688919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5632	NC_011205	GAAA	2	8	1690295	1690302	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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