MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483 chromosome

Total Repeats: 14042

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_011149	TC	3	6	1449472	1449477	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4002	NC_011149	AG	3	6	1449598	1449603	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_011149	GGA	2	6	1449713	1449718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_011149	CG	3	6	1450327	1450332	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4005	NC_011149	TAA	2	6	1450414	1450419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_011149	ATT	2	6	1450730	1450735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_011149	T	6	6	1451891	1451896	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_011149	GA	3	6	1451935	1451940	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_011149	A	6	6	1453013	1453018	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_011149	TC	4	8	1453071	1453078	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4011	NC_011149	T	6	6	1453134	1453139	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_011149	ACG	2	6	1453168	1453173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4013	NC_011149	T	8	8	1453193	1453200	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_011149	TTA	2	6	1453277	1453282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_011149	CGC	2	6	1453371	1453376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4016	NC_011149	GAA	2	6	1453382	1453387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_011149	CTG	2	6	1453435	1453440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4018	NC_011149	TCG	2	6	1455897	1455902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4019	NC_011149	TCA	2	6	1455909	1455914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4020	NC_011149	TGGC	2	8	1455966	1455973	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4021	NC_011149	CAGC	2	8	1456004	1456011	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4022	NC_011149	CGA	2	6	1456047	1456052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4023	NC_011149	CAT	2	6	1456105	1456110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4024	NC_011149	AAG	2	6	1456126	1456131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_011149	GCT	2	6	1456157	1456162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4026	NC_011149	TGA	2	6	1456169	1456174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_011149	TAT	2	6	1456284	1456289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_011149	TAA	2	6	1456291	1456296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_011149	ATT	2	6	1456425	1456430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_011149	CTGG	2	8	1456483	1456490	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4031	NC_011149	TTG	2	6	1459944	1459949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_011149	TC	3	6	1459953	1459958	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4033	NC_011149	AAT	2	6	1459987	1459992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_011149	GGC	2	6	1460007	1460012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4035	NC_011149	AGCG	2	8	1460014	1460021	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4036	NC_011149	AAGT	2	8	1460041	1460048	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_011149	CGCAGC	2	12	1460065	1460076	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4038	NC_011149	ATTA	2	8	1460146	1460153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_011149	CAC	2	6	1460160	1460165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4040	NC_011149	GAT	3	9	1460537	1460545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_011149	CT	3	6	1460564	1460569	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4042	NC_011149	CCT	2	6	1461026	1461031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4043	NC_011149	TGC	2	6	1461102	1461107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4044	NC_011149	GGA	2	6	1461139	1461144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_011149	AAT	2	6	1461173	1461178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_011149	TTAT	2	8	1461200	1461207	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_011149	AAT	2	6	1461252	1461257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_011149	AAT	2	6	1461264	1461269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_011149	TAT	2	6	1461312	1461317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_011149	CGAA	2	8	1461451	1461458	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4051	NC_011149	T	7	7	1461468	1461474	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_011149	A	6	6	1465048	1465053	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_011149	TTTTA	2	10	1465094	1465103	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_011149	GA	3	6	1465296	1465301	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_011149	GCG	2	6	1465572	1465577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4056	NC_011149	TAA	2	6	1466063	1466068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_011149	CA	3	6	1467150	1467155	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4058	NC_011149	A	6	6	1467178	1467183	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_011149	AAT	2	6	1467189	1467194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_011149	CATA	2	8	1467202	1467209	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4061	NC_011149	AAT	2	6	1467215	1467220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_011149	T	7	7	1470536	1470542	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_011149	TTG	2	6	1471758	1471763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_011149	AT	3	6	1471800	1471805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_011149	ATT	2	6	1471823	1471828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_011149	AAC	2	6	1471830	1471835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4067	NC_011149	A	7	7	1471838	1471844	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_011149	CGA	2	6	1475828	1475833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4069	NC_011149	AGG	2	6	1475872	1475877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_011149	ACC	2	6	1476719	1476724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4071	NC_011149	TGA	2	6	1476737	1476742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_011149	ATT	2	6	1476743	1476748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_011149	TGT	2	6	1476764	1476769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_011149	TTCA	2	8	1476782	1476789	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4075	NC_011149	TATC	2	8	1477384	1477391	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4076	NC_011149	AGG	2	6	1477456	1477461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_011149	TAT	2	6	1477484	1477489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_011149	AAATA	2	10	1477505	1477514	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_011149	GAA	2	6	1478128	1478133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_011149	AGT	2	6	1478138	1478143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_011149	TTTG	2	8	1478173	1478180	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_011149	CCA	2	6	1478194	1478199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4083	NC_011149	TAAGC	2	10	1478206	1478215	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4084	NC_011149	TTG	2	6	1478245	1478250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_011149	TC	3	6	1478266	1478271	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4086	NC_011149	AAT	2	6	1478276	1478281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_011149	AAC	2	6	1478298	1478303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4088	NC_011149	GTGA	2	8	1478333	1478340	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_011149	ATA	3	9	1478406	1478414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_011149	ATT	2	6	1478440	1478445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_011149	TAAT	2	8	1478455	1478462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_011149	AATATA	2	12	1478470	1478481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_011149	ATA	2	6	1478494	1478499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_011149	GCAAT	2	10	1478500	1478509	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4095	NC_011149	ATT	2	6	1478551	1478556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_011149	TTTA	2	8	1478600	1478607	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_011149	ACCT	2	8	1478613	1478620	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4098	NC_011149	TGGCAG	2	12	1478679	1478690	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4099	NC_011149	CACTG	2	10	1478701	1478710	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4100	NC_011149	AAT	2	6	1480324	1480329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_011149	TAAA	2	8	1480354	1480361	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_011149	AGTGC	2	10	1480400	1480409	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4103	NC_011149	CTAT	2	8	1483263	1483270	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4104	NC_011149	GTA	2	6	1483276	1483281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_011149	TAT	2	6	1483292	1483297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_011149	AGG	2	6	1483384	1483389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_011149	ATC	2	6	1483400	1483405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4108	NC_011149	CATA	2	8	1483532	1483539	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4109	NC_011149	ATC	2	6	1483595	1483600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4110	NC_011149	CTAT	2	8	1483680	1483687	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4111	NC_011149	ATT	2	6	1483704	1483709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_011149	ACA	2	6	1483727	1483732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4113	NC_011149	TGT	2	6	1483751	1483756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_011149	ATA	2	6	1483790	1483795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_011149	AT	3	6	1483818	1483823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_011149	TAA	2	6	1483870	1483875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_011149	TAA	2	6	1483889	1483894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_011149	AACA	2	8	1483922	1483929	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4119	NC_011149	TTC	2	6	1483943	1483948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4120	NC_011149	GGT	2	6	1483974	1483979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_011149	TGAA	2	8	1484082	1484089	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_011149	GCA	2	6	1484548	1484553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4123	NC_011149	TCC	2	6	1485867	1485872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4124	NC_011149	TTA	2	6	1485878	1485883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_011149	ATTA	2	8	1485902	1485909	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_011149	TA	3	6	1485947	1485952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_011149	CTT	2	6	1485961	1485966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4128	NC_011149	CGC	2	6	1485978	1485983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4129	NC_011149	AT	3	6	1486026	1486031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_011149	CAA	2	6	1486035	1486040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4131	NC_011149	ATT	2	6	1486081	1486086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_011149	A	7	7	1486116	1486122	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_011149	ATC	2	6	1486196	1486201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4134	NC_011149	TAT	2	6	1486206	1486211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4136	NC_011149	TA	3	6	1486224	1486229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4166	NC_011149	TTA	2	6	1495677	1495682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4259	NC_011149	GGC	2	6	1534768	1534773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4263	NC_011149	T	6	6	1535016	1535021	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4264	NC_011149	CTT	2	6	1535039	1535044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4265	NC_011149	TGT	2	6	1535061	1535066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4266	NC_011149	GAAG	2	8	1535080	1535087	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4267	NC_011149	TTAAG	2	10	1538033	1538042	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4268	NC_011149	ATAA	2	8	1538102	1538109	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4269	NC_011149	ATT	3	9	1538112	1538120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4270	NC_011149	TAA	2	6	1538130	1538135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4271	NC_011149	AGT	2	6	1538163	1538168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4286	NC_011149	GA	3	6	1541665	1541670	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4296	NC_011149	T	7	7	1552732	1552738	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4297	NC_011149	A	6	6	1552763	1552768	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4298	NC_011149	GCGCG	2	10	1552777	1552786	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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4305	NC_011149	ACA	2	6	1556659	1556664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4308	NC_011149	ATT	2	6	1558142	1558147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4310	NC_011149	TAA	2	6	1558211	1558216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4311	NC_011149	AT	3	6	1558218	1558223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4312	NC_011149	GTA	2	6	1558265	1558270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4335	NC_011149	CT	3	6	1560171	1560176	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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4348	NC_011149	CTG	2	6	1560783	1560788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4382	NC_011149	GGT	2	6	1562549	1562554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4385	NC_011149	CG	3	6	1562639	1562644	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4386	NC_011149	ATAA	2	8	1564307	1564314	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4387	NC_011149	CTG	2	6	1564345	1564350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4392	NC_011149	TAG	2	6	1565569	1565574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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