MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483 chromosome

Total Repeats: 14042

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_011149	CAGAT	2	10	4480042	4480051	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
13002	NC_011149	ATTA	2	8	4480068	4480075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13003	NC_011149	AAT	2	6	4480131	4480136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13004	NC_011149	CTC	2	6	4480151	4480156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13005	NC_011149	A	6	6	4480175	4480180	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13006	NC_011149	T	6	6	4480343	4480348	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13007	NC_011149	TTA	2	6	4481251	4481256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13008	NC_011149	TTG	2	6	4481294	4481299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13009	NC_011149	TTAC	2	8	4481314	4481321	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13010	NC_011149	TCC	2	6	4481364	4481369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13011	NC_011149	T	8	8	4481398	4481405	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13012	NC_011149	TAA	2	6	4481424	4481429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13013	NC_011149	AATA	2	8	4481439	4481446	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13014	NC_011149	T	7	7	4481455	4481461	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13015	NC_011149	AGG	2	6	4481463	4481468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13016	NC_011149	ATA	2	6	4481510	4481515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13017	NC_011149	TTC	2	6	4481516	4481521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13018	NC_011149	CGG	2	6	4481650	4481655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13019	NC_011149	CAGC	2	8	4481770	4481777	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13020	NC_011149	GAA	2	6	4481789	4481794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13021	NC_011149	GAAC	2	8	4481814	4481821	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13022	NC_011149	CTG	2	6	4481845	4481850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13023	NC_011149	TTA	2	6	4483212	4483217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13024	NC_011149	ATT	2	6	4483238	4483243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13025	NC_011149	AT	3	6	4483270	4483275	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13026	NC_011149	TA	3	6	4483279	4483284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13027	NC_011149	ATT	2	6	4483285	4483290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13028	NC_011149	TAA	2	6	4483470	4483475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13029	NC_011149	AT	3	6	4483621	4483626	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13030	NC_011149	CGG	3	9	4483628	4483636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13031	NC_011149	GAGGG	2	10	4483666	4483675	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
13032	NC_011149	CAAG	2	8	4483784	4483791	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13033	NC_011149	A	6	6	4483806	4483811	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13034	NC_011149	ACC	2	6	4483821	4483826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13035	NC_011149	AGC	2	6	4483840	4483845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13036	NC_011149	CT	3	6	4483970	4483975	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13037	NC_011149	TCT	3	9	4483973	4483981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13038	NC_011149	GGC	2	6	4484328	4484333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13039	NC_011149	GGC	2	6	4484364	4484369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13040	NC_011149	ACAG	2	8	4484399	4484406	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13041	NC_011149	GGT	2	6	4484408	4484413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13042	NC_011149	TGT	2	6	4484737	4484742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13043	NC_011149	GAT	2	6	4484790	4484795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13044	NC_011149	A	6	6	4484798	4484803	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13045	NC_011149	CAGC	2	8	4484819	4484826	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13046	NC_011149	A	6	6	4484832	4484837	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13047	NC_011149	TTA	2	6	4484858	4484863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13048	NC_011149	TAT	3	9	4486031	4486039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13049	NC_011149	A	6	6	4486047	4486052	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13050	NC_011149	T	7	7	4486072	4486078	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13051	NC_011149	TA	3	6	4486096	4486101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13052	NC_011149	AT	3	6	4486109	4486114	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13053	NC_011149	ATA	2	6	4486148	4486153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13054	NC_011149	T	7	7	4486198	4486204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13055	NC_011149	ATAA	2	8	4486225	4486232	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13056	NC_011149	TGTAG	2	10	4486318	4486327	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
13057	NC_011149	CGG	2	6	4486352	4486357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13058	NC_011149	CA	3	6	4486469	4486474	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13059	NC_011149	TGA	2	6	4486640	4486645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13060	NC_011149	ACA	2	6	4486652	4486657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13061	NC_011149	CTT	2	6	4486875	4486880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13062	NC_011149	CAGC	2	8	4487027	4487034	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13063	NC_011149	TGT	2	6	4487173	4487178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13064	NC_011149	GTC	2	6	4487237	4487242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13065	NC_011149	ACTC	2	8	4488059	4488066	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13066	NC_011149	AAT	2	6	4488077	4488082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13067	NC_011149	T	6	6	4488257	4488262	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13068	NC_011149	CTGA	2	8	4488273	4488280	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13069	NC_011149	ATG	2	6	4488372	4488377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13070	NC_011149	TTATGA	2	12	4488392	4488403	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13071	NC_011149	A	6	6	4488448	4488453	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13072	NC_011149	ATT	2	6	4488473	4488478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13073	NC_011149	TTA	2	6	4488562	4488567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13074	NC_011149	ATA	2	6	4488571	4488576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13075	NC_011149	TAAG	2	8	4488590	4488597	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13076	NC_011149	GTCAT	2	10	4488680	4488689	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
13077	NC_011149	ATG	2	6	4488693	4488698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13078	NC_011149	TC	3	6	4488706	4488711	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13079	NC_011149	ATT	2	6	4488977	4488982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13080	NC_011149	ATAAAA	2	12	4489599	4489610	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13081	NC_011149	A	6	6	4489607	4489612	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13082	NC_011149	ATTG	2	8	4489762	4489769	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13083	NC_011149	GTG	2	6	4489868	4489873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13084	NC_011149	TTTG	2	8	4489900	4489907	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13085	NC_011149	TACT	2	8	4489945	4489952	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13086	NC_011149	A	6	6	4489966	4489971	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13087	NC_011149	TGA	2	6	4490148	4490153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13088	NC_011149	CTGG	2	8	4490180	4490187	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13089	NC_011149	ATT	4	12	4490212	4490223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13090	NC_011149	GAT	2	6	4490224	4490229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13091	NC_011149	ATG	2	6	4490240	4490245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13092	NC_011149	ATT	3	9	4490365	4490373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13093	NC_011149	ACT	2	6	4490403	4490408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13094	NC_011149	GAA	2	6	4490428	4490433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13095	NC_011149	TGG	2	6	4490442	4490447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13096	NC_011149	ATCA	2	8	4490527	4490534	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13097	NC_011149	CTTA	2	8	4490594	4490601	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13098	NC_011149	ATA	2	6	4490613	4490618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13099	NC_011149	ATA	2	6	4490647	4490652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13100	NC_011149	TAT	2	6	4490653	4490658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13101	NC_011149	TC	3	6	4490662	4490667	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13102	NC_011149	TGG	2	6	4490705	4490710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13103	NC_011149	TCGT	2	8	4490728	4490735	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13104	NC_011149	GCACTT	2	12	4490768	4490779	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13105	NC_011149	GTG	2	6	4490913	4490918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13106	NC_011149	CTG	2	6	4490960	4490965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13107	NC_011149	GAT	2	6	4491061	4491066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13108	NC_011149	T	6	6	4491083	4491088	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13109	NC_011149	GAA	2	6	4491151	4491156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13110	NC_011149	GAT	2	6	4491166	4491171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13111	NC_011149	CGG	2	6	4491205	4491210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13112	NC_011149	TAT	2	6	4491211	4491216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13113	NC_011149	A	6	6	4491257	4491262	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13114	NC_011149	TTC	2	6	4491275	4491280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13115	NC_011149	TTC	2	6	4491290	4491295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13116	NC_011149	TAC	2	6	4492298	4492303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13117	NC_011149	A	7	7	4492338	4492344	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13118	NC_011149	GGA	2	6	4493966	4493971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13119	NC_011149	T	6	6	4498482	4498487	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13120	NC_011149	TAT	2	6	4498494	4498499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13121	NC_011149	GC	4	8	4498505	4498512	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13122	NC_011149	TGT	2	6	4498518	4498523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13123	NC_011149	CAA	2	6	4498589	4498594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13124	NC_011149	ACCACA	2	12	4498638	4498649	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13125	NC_011149	TTG	2	6	4498740	4498745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13126	NC_011149	GGTA	2	8	4498748	4498755	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13127	NC_011149	CTT	2	6	4498791	4498796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13128	NC_011149	CTT	2	6	4498810	4498815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13129	NC_011149	A	7	7	4498836	4498842	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13130	NC_011149	TAA	2	6	4498848	4498853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13250	NC_011149	CCAT	2	8	4547017	4547024	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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13252	NC_011149	CTGG	2	8	4547048	4547055	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13253	NC_011149	TTTA	2	8	4547090	4547097	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13257	NC_011149	TCG	2	6	4548374	4548379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13499	NC_011149	TGTGG	2	10	4661895	4661904	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
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