MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483 chromosome

Total Repeats: 14042

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_011149	A	6	6	3843758	3843763	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11002	NC_011149	GGC	2	6	3843766	3843771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11003	NC_011149	TGA	2	6	3843778	3843783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11004	NC_011149	TAA	2	6	3843789	3843794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11005	NC_011149	TGT	2	6	3843856	3843861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11006	NC_011149	AAT	2	6	3843881	3843886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11007	NC_011149	GAA	2	6	3843890	3843895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11008	NC_011149	ATG	2	6	3843945	3843950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11009	NC_011149	ATT	2	6	3844057	3844062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11010	NC_011149	CGA	2	6	3844066	3844071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11011	NC_011149	ATA	2	6	3844568	3844573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11012	NC_011149	TCA	2	6	3845990	3845995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11013	NC_011149	A	8	8	3846014	3846021	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11014	NC_011149	TC	3	6	3846862	3846867	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11015	NC_011149	TC	3	6	3848710	3848715	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11016	NC_011149	CGG	2	6	3849672	3849677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11017	NC_011149	TAA	2	6	3849776	3849781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11018	NC_011149	ATT	2	6	3849785	3849790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11019	NC_011149	TTA	2	6	3849820	3849825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11020	NC_011149	CCT	2	6	3852214	3852219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11021	NC_011149	CAT	2	6	3852278	3852283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11022	NC_011149	T	6	6	3852301	3852306	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11023	NC_011149	TGC	2	6	3852314	3852319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11024	NC_011149	ACG	2	6	3852321	3852326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11025	NC_011149	AAT	2	6	3852358	3852363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11026	NC_011149	TAA	2	6	3852413	3852418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11027	NC_011149	TTC	2	6	3853117	3853122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11028	NC_011149	T	6	6	3860417	3860422	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11029	NC_011149	TA	3	6	3860474	3860479	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11030	NC_011149	T	6	6	3860496	3860501	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11031	NC_011149	TCGC	2	8	3860517	3860524	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11032	NC_011149	CCA	2	6	3860569	3860574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11033	NC_011149	GCG	3	9	3861988	3861996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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11035	NC_011149	TGA	2	6	3867765	3867770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11036	NC_011149	A	6	6	3867836	3867841	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11037	NC_011149	GC	4	8	3867883	3867890	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11038	NC_011149	TCG	2	6	3867919	3867924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11039	NC_011149	GGC	2	6	3867935	3867940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11040	NC_011149	GCC	2	6	3867962	3867967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11041	NC_011149	TA	3	6	3868059	3868064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11042	NC_011149	CCA	2	6	3868167	3868172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11043	NC_011149	A	6	6	3868177	3868182	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11044	NC_011149	TAA	2	6	3868187	3868192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11045	NC_011149	ATA	3	9	3868197	3868205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11046	NC_011149	GTA	2	6	3868219	3868224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11047	NC_011149	GGA	2	6	3868293	3868298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11048	NC_011149	GT	3	6	3868381	3868386	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11049	NC_011149	TGATT	2	10	3868417	3868426	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
11050	NC_011149	GAA	2	6	3868465	3868470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11051	NC_011149	TTACT	2	10	3868533	3868542	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11052	NC_011149	GC	3	6	3868609	3868614	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11053	NC_011149	ACT	2	6	3868647	3868652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11055	NC_011149	AAC	2	6	3868748	3868753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11056	NC_011149	CTG	2	6	3868790	3868795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11057	NC_011149	TAT	2	6	3868853	3868858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11058	NC_011149	TA	3	6	3868867	3868872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11059	NC_011149	CTT	2	6	3868873	3868878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11060	NC_011149	ACGC	2	8	3868902	3868909	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11061	NC_011149	TA	3	6	3869082	3869087	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11062	NC_011149	TCAT	2	8	3869099	3869106	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11063	NC_011149	AGT	2	6	3869171	3869176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11064	NC_011149	ATC	2	6	3870432	3870437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11065	NC_011149	ATC	3	9	3871668	3871676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11066	NC_011149	CTT	2	6	3874890	3874895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11067	NC_011149	ATA	2	6	3875709	3875714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11068	NC_011149	AAT	2	6	3875762	3875767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11069	NC_011149	ACAT	2	8	3876418	3876425	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11070	NC_011149	ATA	2	6	3876489	3876494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11071	NC_011149	TAAAA	2	10	3876497	3876506	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11072	NC_011149	TAT	2	6	3876513	3876518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11073	NC_011149	AT	3	6	3876567	3876572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11074	NC_011149	AT	3	6	3876582	3876587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11075	NC_011149	TTCA	2	8	3876625	3876632	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11076	NC_011149	AAT	2	6	3876654	3876659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11077	NC_011149	T	7	7	3876659	3876665	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11078	NC_011149	A	7	7	3876688	3876694	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11079	NC_011149	ATTT	3	12	3876703	3876714	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11080	NC_011149	ATA	2	6	3876721	3876726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11082	NC_011149	A	6	6	3877216	3877221	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11084	NC_011149	CTC	2	6	3877380	3877385	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11085	NC_011149	TC	3	6	3877536	3877541	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11086	NC_011149	ATT	2	6	3877573	3877578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11088	NC_011149	CTG	2	6	3877677	3877682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11089	NC_011149	TCA	2	6	3877876	3877881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11090	NC_011149	A	6	6	3877894	3877899	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11091	NC_011149	GCATTA	2	12	3878030	3878041	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11092	NC_011149	CCT	2	6	3878044	3878049	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11093	NC_011149	TA	3	6	3878090	3878095	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11094	NC_011149	TGA	2	6	3878102	3878107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11095	NC_011149	A	6	6	3878155	3878160	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11096	NC_011149	TAA	3	9	3878176	3878184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11097	NC_011149	TCA	2	6	3878222	3878227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11098	NC_011149	CAG	2	6	3878251	3878256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11099	NC_011149	TTAT	2	8	3878277	3878284	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11100	NC_011149	T	6	6	3878321	3878326	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11101	NC_011149	ATG	2	6	3878380	3878385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11102	NC_011149	T	6	6	3878412	3878417	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11103	NC_011149	AT	3	6	3878492	3878497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11104	NC_011149	ATTT	2	8	3878513	3878520	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11105	NC_011149	TAT	2	6	3879197	3879202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11106	NC_011149	ATT	2	6	3879209	3879214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11107	NC_011149	AGG	2	6	3879246	3879251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11108	NC_011149	AAC	2	6	3882131	3882136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11109	NC_011149	A	6	6	3882209	3882214	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11110	NC_011149	AGA	2	6	3883579	3883584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11111	NC_011149	A	6	6	3883780	3883785	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11112	NC_011149	AGC	2	6	3883863	3883868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11113	NC_011149	TA	3	6	3883875	3883880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11114	NC_011149	TTA	2	6	3883896	3883901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11115	NC_011149	TAA	2	6	3883922	3883927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11116	NC_011149	TAAATA	2	12	3883972	3883983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11117	NC_011149	AAT	2	6	3884021	3884026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11118	NC_011149	CTAT	2	8	3884034	3884041	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11119	NC_011149	TCAA	2	8	3884075	3884082	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11120	NC_011149	CT	3	6	3884088	3884093	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11121	NC_011149	ATA	2	6	3884120	3884125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11122	NC_011149	TTG	2	6	3884132	3884137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11123	NC_011149	CAA	3	9	3884314	3884322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11124	NC_011149	GAAT	2	8	3884324	3884331	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11125	NC_011149	CGC	2	6	3885114	3885119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11126	NC_011149	GCG	2	6	3885122	3885127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11127	NC_011149	TAC	2	6	3885163	3885168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11128	NC_011149	GC	3	6	3885187	3885192	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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11130	NC_011149	AAC	2	6	3885797	3885802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11253	NC_011149	G	6	6	3925828	3925833	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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