MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483 chromosome

Total Repeats: 14042

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_011149	TCCTC	2	10	3417675	3417684	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
10002	NC_011149	TC	3	6	3417689	3417694	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10003	NC_011149	ATGA	2	8	3418949	3418956	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10004	NC_011149	A	8	8	3418962	3418969	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10005	NC_011149	TAT	2	6	3419008	3419013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10006	NC_011149	GCG	2	6	3419014	3419019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10007	NC_011149	T	6	6	3419022	3419027	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10008	NC_011149	CAC	2	6	3421600	3421605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10009	NC_011149	CGA	2	6	3425226	3425231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10010	NC_011149	TGT	2	6	3425236	3425241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10011	NC_011149	GGC	2	6	3425255	3425260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10012	NC_011149	TGT	2	6	3425289	3425294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10013	NC_011149	GAT	2	6	3426238	3426243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10014	NC_011149	AT	3	6	3426246	3426251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10015	NC_011149	CTAC	2	8	3426255	3426262	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10016	NC_011149	AGC	2	6	3426291	3426296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10017	NC_011149	ATA	2	6	3426299	3426304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10018	NC_011149	ATA	2	6	3427171	3427176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10019	NC_011149	GAG	2	6	3427220	3427225	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10020	NC_011149	CAAA	2	8	3427228	3427235	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10021	NC_011149	CCAG	2	8	3428455	3428462	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10022	NC_011149	A	6	6	3428483	3428488	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10023	NC_011149	CAT	2	6	3428491	3428496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10024	NC_011149	AAAT	2	8	3429568	3429575	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10025	NC_011149	A	6	6	3429686	3429691	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10026	NC_011149	CT	3	6	3429692	3429697	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10027	NC_011149	GCGCT	2	10	3429838	3429847	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
10028	NC_011149	TGTTAT	2	12	3430983	3430994	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10029	NC_011149	CGT	2	6	3431014	3431019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10030	NC_011149	A	7	7	3431032	3431038	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10031	NC_011149	CT	4	8	3431614	3431621	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10032	NC_011149	TAT	2	6	3431639	3431644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10033	NC_011149	TTCA	2	8	3431701	3431708	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10034	NC_011149	AGC	2	6	3431718	3431723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10035	NC_011149	GATGT	2	10	3433124	3433133	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
10036	NC_011149	TGC	3	9	3433151	3433159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10037	NC_011149	T	6	6	3433167	3433172	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10038	NC_011149	ACG	2	6	3433174	3433179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10039	NC_011149	ACG	2	6	3434260	3434265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10040	NC_011149	CGT	2	6	3434279	3434284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10041	NC_011149	CTC	2	6	3436350	3436355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10042	NC_011149	CAGG	2	8	3438399	3438406	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10043	NC_011149	ATA	2	6	3438440	3438445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10044	NC_011149	GCC	2	6	3438463	3438468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10045	NC_011149	TTA	3	9	3438487	3438495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10046	NC_011149	ACC	2	6	3438511	3438516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10047	NC_011149	CAAT	2	8	3441375	3441382	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10048	NC_011149	AT	3	6	3441384	3441389	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10049	NC_011149	GAA	2	6	3441413	3441418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10050	NC_011149	ATT	2	6	3441419	3441424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10051	NC_011149	GAA	2	6	3441527	3441532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10052	NC_011149	TAA	2	6	3442865	3442870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10053	NC_011149	GAG	2	6	3442883	3442888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10054	NC_011149	AAG	2	6	3442932	3442937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10055	NC_011149	TTA	2	6	3443922	3443927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10056	NC_011149	CGG	2	6	3443956	3443961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10057	NC_011149	CTCA	2	8	3443995	3444002	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10058	NC_011149	AG	3	6	3444073	3444078	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10059	NC_011149	CTA	2	6	3444109	3444114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10060	NC_011149	ACA	2	6	3444125	3444130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10061	NC_011149	AATT	2	8	3444144	3444151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10062	NC_011149	ATT	2	6	3444233	3444238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10063	NC_011149	AAT	2	6	3444289	3444294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10064	NC_011149	GTT	2	6	3444295	3444300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10065	NC_011149	TCC	2	6	3444804	3444809	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10066	NC_011149	GTC	2	6	3444810	3444815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10067	NC_011149	CGG	2	6	3444819	3444824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10068	NC_011149	TCCCC	2	10	3444838	3444847	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
10069	NC_011149	CGC	2	6	3444849	3444854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10070	NC_011149	CAC	2	6	3444899	3444904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10071	NC_011149	ATGA	2	8	3444905	3444912	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10072	NC_011149	A	7	7	3444919	3444925	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10073	NC_011149	TTA	2	6	3444943	3444948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10074	NC_011149	ATTTT	3	15	3444957	3444971	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10075	NC_011149	T	6	6	3444968	3444973	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10076	NC_011149	GCG	2	6	3444982	3444987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10077	NC_011149	A	6	6	3445019	3445024	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10078	NC_011149	ATTA	2	8	3445069	3445076	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10079	NC_011149	TGA	2	6	3445106	3445111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10080	NC_011149	CGA	2	6	3445145	3445150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10081	NC_011149	TCG	2	6	3445799	3445804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10082	NC_011149	CGA	2	6	3445812	3445817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10083	NC_011149	T	6	6	3445840	3445845	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10084	NC_011149	AGCC	2	8	3446127	3446134	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10085	NC_011149	GACA	2	8	3446144	3446151	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10086	NC_011149	TAC	2	6	3446163	3446168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10087	NC_011149	CAT	2	6	3446173	3446178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10088	NC_011149	A	7	7	3446262	3446268	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10089	NC_011149	GA	4	8	3449431	3449438	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10090	NC_011149	CGC	2	6	3449465	3449470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10091	NC_011149	AAT	2	6	3449518	3449523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10092	NC_011149	TAT	2	6	3449557	3449562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10093	NC_011149	GCGCT	2	10	3450591	3450600	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
10094	NC_011149	CA	3	6	3450617	3450622	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10095	NC_011149	GTT	2	6	3452150	3452155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10096	NC_011149	TC	3	6	3456041	3456046	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10097	NC_011149	A	6	6	3456057	3456062	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10098	NC_011149	GGC	2	6	3456098	3456103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10099	NC_011149	CTA	2	6	3456137	3456142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10100	NC_011149	ACCA	2	8	3460912	3460919	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10101	NC_011149	GCA	2	6	3460923	3460928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10102	NC_011149	ATC	2	6	3460945	3460950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10103	NC_011149	A	6	6	3461019	3461024	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10104	NC_011149	CAG	2	6	3461026	3461031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10105	NC_011149	TGC	2	6	3461082	3461087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10106	NC_011149	GC	3	6	3461129	3461134	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10107	NC_011149	GC	3	6	3463175	3463180	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10108	NC_011149	TAC	2	6	3463194	3463199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10109	NC_011149	ATCT	2	8	3463208	3463215	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10110	NC_011149	A	7	7	3464297	3464303	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10111	NC_011149	TTAA	2	8	3464311	3464318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10112	NC_011149	TATT	2	8	3464320	3464327	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10113	NC_011149	AC	3	6	3464339	3464344	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10114	NC_011149	TGT	2	6	3464370	3464375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10115	NC_011149	TGG	2	6	3464380	3464385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10116	NC_011149	CGA	2	6	3466115	3466120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10117	NC_011149	TTCG	2	8	3466162	3466169	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10118	NC_011149	T	6	6	3466208	3466213	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10119	NC_011149	AGA	2	6	3466227	3466232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10120	NC_011149	CA	3	6	3466237	3466242	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10121	NC_011149	T	6	6	3468268	3468273	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10122	NC_011149	CAT	2	6	3468296	3468301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10123	NC_011149	TTC	2	6	3468316	3468321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10124	NC_011149	CA	3	6	3470953	3470958	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10125	NC_011149	CAT	2	6	3470988	3470993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10126	NC_011149	TCA	2	6	3470999	3471004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10127	NC_011149	AATG	2	8	3471005	3471012	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10128	NC_011149	CTT	2	6	3471023	3471028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10129	NC_011149	GCT	2	6	3471053	3471058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10130	NC_011149	GTT	2	6	3471132	3471137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10259	NC_011149	GA	3	6	3488964	3488969	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10260	NC_011149	GAC	2	6	3489012	3489017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10261	NC_011149	GCA	2	6	3491233	3491238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10386	NC_011149	T	7	7	3552781	3552787	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10387	NC_011149	GCAA	2	8	3552868	3552875	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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10393	NC_011149	AAC	2	6	3559588	3559593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10500	NC_011149	A	8	8	3626124	3626131	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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