MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483 chromosome

Total Repeats: 14042

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_011149	T	6	6	3139927	3139932	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9002	NC_011149	GAGG	2	8	3139957	3139964	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
9003	NC_011149	CCTC	2	8	3139969	3139976	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
9004	NC_011149	CT	3	6	3139984	3139989	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9005	NC_011149	GAT	2	6	3140009	3140014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9006	NC_011149	CAG	2	6	3140024	3140029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9007	NC_011149	ATG	2	6	3140031	3140036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9008	NC_011149	TCA	2	6	3140044	3140049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9009	NC_011149	CCTTT	2	10	3140055	3140064	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
9010	NC_011149	ACA	2	6	3140144	3140149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9011	NC_011149	AGA	2	6	3140237	3140242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9012	NC_011149	T	7	7	3141529	3141535	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9013	NC_011149	TGT	2	6	3141545	3141550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9014	NC_011149	A	8	8	3141582	3141589	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9015	NC_011149	CGT	2	6	3141620	3141625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9016	NC_011149	T	6	6	3141747	3141752	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9017	NC_011149	AAC	2	6	3141847	3141852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9018	NC_011149	ACG	2	6	3141862	3141867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9019	NC_011149	CCATA	2	10	3141917	3141926	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
9020	NC_011149	CGCC	2	8	3141982	3141989	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9021	NC_011149	GC	3	6	3142020	3142025	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9022	NC_011149	AAAT	2	8	3142097	3142104	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9023	NC_011149	AAT	2	6	3142122	3142127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9024	NC_011149	GCCGC	2	10	3142144	3142153	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
9025	NC_011149	ATC	2	6	3142162	3142167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9026	NC_011149	GCC	2	6	3142399	3142404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9027	NC_011149	T	6	6	3142416	3142421	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9028	NC_011149	A	7	7	3142565	3142571	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9029	NC_011149	ACA	2	6	3142587	3142592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9030	NC_011149	AATG	2	8	3143493	3143500	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9031	NC_011149	GGC	2	6	3143507	3143512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9032	NC_011149	ATT	2	6	3143542	3143547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9033	NC_011149	CTT	2	6	3143557	3143562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9034	NC_011149	TCA	2	6	3143569	3143574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9035	NC_011149	GGC	2	6	3143592	3143597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9036	NC_011149	A	6	6	3143598	3143603	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9037	NC_011149	TC	3	6	3144403	3144408	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9038	NC_011149	TGT	2	6	3144474	3144479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9039	NC_011149	ATT	2	6	3145180	3145185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9040	NC_011149	TAA	2	6	3145211	3145216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9041	NC_011149	GGC	2	6	3145248	3145253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9042	NC_011149	AGCGC	2	10	3145297	3145306	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
9043	NC_011149	CAT	2	6	3146278	3146283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9044	NC_011149	A	6	6	3146287	3146292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9045	NC_011149	CTAA	2	8	3146327	3146334	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9046	NC_011149	CGC	2	6	3146335	3146340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9047	NC_011149	A	7	7	3146358	3146364	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9048	NC_011149	CAG	2	6	3146392	3146397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9050	NC_011149	A	6	6	3147515	3147520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9051	NC_011149	GCC	2	6	3147526	3147531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9052	NC_011149	ATG	2	6	3148763	3148768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9053	NC_011149	TCG	2	6	3149873	3149878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9054	NC_011149	TTAA	2	8	3149931	3149938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9055	NC_011149	GAA	2	6	3149997	3150002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9056	NC_011149	TCG	2	6	3150097	3150102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9057	NC_011149	TAT	2	6	3150150	3150155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9058	NC_011149	GAC	2	6	3150618	3150623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9059	NC_011149	GAC	2	6	3155323	3155328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9060	NC_011149	CAA	2	6	3155360	3155365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9061	NC_011149	CG	3	6	3155378	3155383	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9062	NC_011149	TGCC	2	8	3155459	3155466	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9063	NC_011149	ATA	2	6	3155525	3155530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9064	NC_011149	GGC	2	6	3156331	3156336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9065	NC_011149	ATCA	2	8	3156363	3156370	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9066	NC_011149	AGCGC	2	10	3156386	3156395	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
9067	NC_011149	AAC	2	6	3156406	3156411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9068	NC_011149	CTT	2	6	3157344	3157349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9069	NC_011149	A	7	7	3157359	3157365	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9070	NC_011149	CGT	2	6	3157374	3157379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9071	NC_011149	CGA	2	6	3157386	3157391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9072	NC_011149	ATT	2	6	3157441	3157446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9073	NC_011149	A	7	7	3157483	3157489	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9074	NC_011149	TA	3	6	3157490	3157495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9075	NC_011149	ATT	2	6	3158464	3158469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9076	NC_011149	ATA	2	6	3158484	3158489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9081	NC_011149	ATTT	2	8	3162863	3162870	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9082	NC_011149	ACC	2	6	3162962	3162967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9083	NC_011149	AAT	2	6	3163060	3163065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9084	NC_011149	CAAAC	2	10	3163080	3163089	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
9085	NC_011149	TAT	2	6	3163125	3163130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9088	NC_011149	GAG	2	6	3163197	3163202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9089	NC_011149	GCC	2	6	3163206	3163211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9090	NC_011149	A	6	6	3163254	3163259	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9091	NC_011149	TGA	2	6	3163261	3163266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9092	NC_011149	ATA	2	6	3163343	3163348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9093	NC_011149	CGG	2	6	3163419	3163424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9094	NC_011149	AGGG	2	8	3163427	3163434	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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9097	NC_011149	TGG	2	6	3163794	3163799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9098	NC_011149	CT	3	6	3163890	3163895	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9099	NC_011149	GTTT	2	8	3163900	3163907	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
9100	NC_011149	GGC	2	6	3163910	3163915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9101	NC_011149	AG	3	6	3164798	3164803	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9102	NC_011149	TTTC	2	8	3164810	3164817	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9103	NC_011149	CA	3	6	3164841	3164846	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9104	NC_011149	CCA	2	6	3164855	3164860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9105	NC_011149	ATT	2	6	3165667	3165672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9106	NC_011149	AAT	2	6	3165758	3165763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9107	NC_011149	GC	3	6	3168098	3168103	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9108	NC_011149	CAG	2	6	3168125	3168130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9109	NC_011149	GCC	2	6	3168166	3168171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9110	NC_011149	GAA	2	6	3168230	3168235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9111	NC_011149	CGT	2	6	3168238	3168243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9112	NC_011149	ATCC	2	8	3168431	3168438	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9113	NC_011149	TCT	2	6	3168494	3168499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9114	NC_011149	CTAA	2	8	3168529	3168536	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9115	NC_011149	TTC	2	6	3169886	3169891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9116	NC_011149	TTCAGT	2	12	3169909	3169920	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9117	NC_011149	CAT	2	6	3169921	3169926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9118	NC_011149	CATT	2	8	3169938	3169945	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9119	NC_011149	ATT	2	6	3170053	3170058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9120	NC_011149	TAT	2	6	3170064	3170069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9121	NC_011149	AAT	2	6	3170084	3170089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9122	NC_011149	TAG	2	6	3170102	3170107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9123	NC_011149	TCC	2	6	3171614	3171619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9124	NC_011149	AGG	2	6	3171626	3171631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9125	NC_011149	CGC	2	6	3174800	3174805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9126	NC_011149	GGC	2	6	3174819	3174824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9127	NC_011149	GCC	2	6	3174864	3174869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9128	NC_011149	T	7	7	3174938	3174944	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9129	NC_011149	CAG	2	6	3175962	3175967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9131	NC_011149	C	6	6	3176791	3176796	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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