MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483 chromosome

Total Repeats: 14042

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_011149	GCA	2	6	2814982	2814987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8002	NC_011149	TCT	2	6	2815012	2815017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8003	NC_011149	CAT	2	6	2815025	2815030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8004	NC_011149	CACG	2	8	2815199	2815206	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8005	NC_011149	AAT	2	6	2815347	2815352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8006	NC_011149	GCT	3	9	2815373	2815381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8007	NC_011149	GAA	2	6	2815455	2815460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8008	NC_011149	CTGCTC	2	12	2815503	2815514	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
8009	NC_011149	CCG	2	6	2815571	2815576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8010	NC_011149	T	7	7	2815599	2815605	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8011	NC_011149	CGG	2	6	2815628	2815633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8012	NC_011149	CCG	2	6	2815645	2815650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8013	NC_011149	TGGT	2	8	2815652	2815659	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8014	NC_011149	AAG	2	6	2817023	2817028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8015	NC_011149	CGG	2	6	2817031	2817036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8016	NC_011149	TGT	2	6	2817055	2817060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8017	NC_011149	CCT	2	6	2817410	2817415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8018	NC_011149	TCG	2	6	2817419	2817424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8019	NC_011149	T	6	6	2817456	2817461	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8020	NC_011149	CAA	2	6	2817502	2817507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8021	NC_011149	A	6	6	2817607	2817612	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8022	NC_011149	TGA	2	6	2817716	2817721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8023	NC_011149	ATT	2	6	2817733	2817738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8024	NC_011149	CTG	2	6	2817746	2817751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8025	NC_011149	GTT	2	6	2817793	2817798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8026	NC_011149	CAA	2	6	2817806	2817811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8027	NC_011149	TG	3	6	2817819	2817824	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8028	NC_011149	ATT	2	6	2817835	2817840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8029	NC_011149	AGC	2	6	2817993	2817998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8030	NC_011149	GGTC	2	8	2818009	2818016	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8031	NC_011149	GAC	2	6	2818018	2818023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8032	NC_011149	TGCC	2	8	2818069	2818076	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8033	NC_011149	CTG	2	6	2818130	2818135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8034	NC_011149	T	6	6	2818167	2818172	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8035	NC_011149	TAAA	2	8	2818181	2818188	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8036	NC_011149	TGGTT	2	10	2819101	2819110	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
8037	NC_011149	TA	3	6	2819150	2819155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8038	NC_011149	GTG	2	6	2819201	2819206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8039	NC_011149	GCGAT	2	10	2819210	2819219	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
8040	NC_011149	TTA	2	6	2819228	2819233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8041	NC_011149	CAG	2	6	2819257	2819262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8042	NC_011149	CTG	2	6	2819327	2819332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8043	NC_011149	TGGC	2	8	2819377	2819384	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8044	NC_011149	TATG	2	8	2819400	2819407	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8045	NC_011149	GAA	2	6	2819419	2819424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8046	NC_011149	TTG	2	6	2819474	2819479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8047	NC_011149	GAA	2	6	2819505	2819510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8048	NC_011149	TGA	2	6	2819529	2819534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8049	NC_011149	TTC	2	6	2819537	2819542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8050	NC_011149	TGT	2	6	2819610	2819615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8051	NC_011149	TCGC	2	8	2819690	2819697	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8052	NC_011149	CAA	2	6	2819706	2819711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8053	NC_011149	CAT	2	6	2819735	2819740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8054	NC_011149	CGA	2	6	2819754	2819759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8055	NC_011149	GGC	2	6	2820840	2820845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8056	NC_011149	GGC	2	6	2820851	2820856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8057	NC_011149	AAT	2	6	2820892	2820897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8058	NC_011149	TACTA	2	10	2820934	2820943	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8059	NC_011149	CCA	2	6	2820991	2820996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8060	NC_011149	CATT	2	8	2820999	2821006	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8061	NC_011149	AT	3	6	2821011	2821016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8062	NC_011149	A	6	6	2821027	2821032	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8063	NC_011149	T	6	6	2821059	2821064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8064	NC_011149	TG	3	6	2821071	2821076	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8065	NC_011149	A	8	8	2821142	2821149	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8066	NC_011149	AGG	2	6	2821830	2821835	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8067	NC_011149	GA	3	6	2821871	2821876	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8068	NC_011149	AT	3	6	2821886	2821891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8069	NC_011149	TGTA	2	8	2821952	2821959	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8070	NC_011149	ACT	2	6	2821970	2821975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8071	NC_011149	ATAG	2	8	2822002	2822009	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8072	NC_011149	CAC	2	6	2822032	2822037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8073	NC_011149	ATT	2	6	2822076	2822081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8074	NC_011149	ATTT	2	8	2824050	2824057	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8075	NC_011149	ATCA	2	8	2824120	2824127	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8076	NC_011149	A	6	6	2824169	2824174	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8077	NC_011149	A	6	6	2824230	2824235	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8078	NC_011149	CAA	2	6	2824246	2824251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8079	NC_011149	CCA	2	6	2824267	2824272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8080	NC_011149	TGT	2	6	2824329	2824334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8081	NC_011149	CCA	2	6	2824352	2824357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8082	NC_011149	ACT	2	6	2824410	2824415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8083	NC_011149	CGTC	2	8	2824427	2824434	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8084	NC_011149	GCC	2	6	2824472	2824477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8085	NC_011149	TAC	2	6	2824513	2824518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8086	NC_011149	TAA	2	6	2824593	2824598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8087	NC_011149	CTTTGC	2	12	2824643	2824654	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8088	NC_011149	CG	3	6	2824662	2824667	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8089	NC_011149	CTC	2	6	2824705	2824710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8090	NC_011149	A	7	7	2824727	2824733	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8091	NC_011149	TCA	2	6	2824734	2824739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8092	NC_011149	ATT	2	6	2824789	2824794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8093	NC_011149	GA	4	8	2824832	2824839	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8094	NC_011149	GGC	2	6	2825988	2825993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8095	NC_011149	GT	3	6	2826004	2826009	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8096	NC_011149	AGG	2	6	2826035	2826040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8097	NC_011149	AAAG	2	8	2829725	2829732	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8098	NC_011149	CGC	2	6	2832025	2832030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8099	NC_011149	GCG	2	6	2832047	2832052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8100	NC_011149	AAT	2	6	2834251	2834256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8101	NC_011149	TA	3	6	2834308	2834313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8102	NC_011149	ATT	2	6	2834317	2834322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8103	NC_011149	ATA	2	6	2834337	2834342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8104	NC_011149	TAA	2	6	2834392	2834397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8105	NC_011149	A	6	6	2834396	2834401	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8106	NC_011149	CT	3	6	2834426	2834431	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8107	NC_011149	ATA	2	6	2834546	2834551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8108	NC_011149	AT	3	6	2834675	2834680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8109	NC_011149	TGT	2	6	2834846	2834851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8110	NC_011149	T	6	6	2834907	2834912	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8111	NC_011149	TCC	2	6	2834945	2834950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8112	NC_011149	CTTAGG	2	12	2834992	2835003	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8113	NC_011149	G	7	7	2835002	2835008	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8114	NC_011149	AAATAG	2	12	2835120	2835131	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8115	NC_011149	TAA	3	9	2835165	2835173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8116	NC_011149	AAT	2	6	2835185	2835190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8117	NC_011149	CTA	2	6	2835201	2835206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8118	NC_011149	AG	3	6	2836331	2836336	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8119	NC_011149	ATA	2	6	2836415	2836420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8120	NC_011149	ACG	2	6	2836428	2836433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8121	NC_011149	TAAA	2	8	2836463	2836470	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8122	NC_011149	TGC	2	6	2836508	2836513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8123	NC_011149	TCCC	2	8	2836522	2836529	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
8124	NC_011149	C	6	6	2836527	2836532	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8125	NC_011149	ACTT	2	8	2836537	2836544	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8126	NC_011149	GCC	2	6	2836573	2836578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8127	NC_011149	ATT	2	6	2836593	2836598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8128	NC_011149	ATT	2	6	2836611	2836616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8129	NC_011149	ATA	2	6	2836621	2836626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8130	NC_011149	TAC	2	6	2836646	2836651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8131	NC_011149	TGC	2	6	2836714	2836719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8132	NC_011149	AAC	2	6	2836736	2836741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8133	NC_011149	GTC	2	6	2836742	2836747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8134	NC_011149	CTT	2	6	2836757	2836762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8135	NC_011149	AGT	2	6	2836817	2836822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8136	NC_011149	ATCTTA	2	12	2837912	2837923	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8137	NC_011149	A	7	7	2838007	2838013	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8138	NC_011149	T	6	6	2838977	2838982	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8139	NC_011149	A	6	6	2839018	2839023	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8140	NC_011149	A	6	6	2839044	2839049	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8145	NC_011149	TCT	2	6	2839243	2839248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8147	NC_011149	ACA	2	6	2839414	2839419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8148	NC_011149	ATG	2	6	2839630	2839635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8150	NC_011149	TCT	2	6	2843003	2843008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8151	NC_011149	CTG	2	6	2846004	2846009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8152	NC_011149	C	6	6	2846099	2846104	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8153	NC_011149	TGA	2	6	2846300	2846305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8161	NC_011149	CGA	2	6	2846514	2846519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8163	NC_011149	GC	3	6	2846579	2846584	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8164	NC_011149	GAT	2	6	2846608	2846613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8166	NC_011149	CGG	2	6	2846648	2846653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8167	NC_011149	CGATG	2	10	2846682	2846691	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
8168	NC_011149	CG	3	6	2846706	2846711	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8169	NC_011149	GAG	2	6	2846800	2846805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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8172	NC_011149	GCT	3	9	2846865	2846873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8173	NC_011149	TGA	2	6	2846880	2846885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8175	NC_011149	GCGTC	2	10	2846925	2846934	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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8246	NC_011149	T	6	6	2875464	2875469	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8254	NC_011149	TATCT	2	10	2878414	2878423	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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8262	NC_011149	ACTT	2	8	2878936	2878943	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8263	NC_011149	GGA	2	6	2879000	2879005	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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8271	NC_011149	CGAG	3	12	2879411	2879422	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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8382	NC_011149	CAA	2	6	2926349	2926354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8383	NC_011149	T	6	6	2927296	2927301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8384	NC_011149	TTA	2	6	2927327	2927332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8388	NC_011149	ATG	2	6	2927496	2927501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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