MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483 chromosome

Total Repeats: 14042

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_011149	CAA	2	6	2465956	2465961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7002	NC_011149	ATTTTT	2	12	2466007	2466018	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7003	NC_011149	TTA	2	6	2466062	2466067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7004	NC_011149	CAG	2	6	2466080	2466085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7005	NC_011149	ATC	2	6	2466088	2466093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7006	NC_011149	GGC	2	6	2467058	2467063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7007	NC_011149	A	6	6	2467085	2467090	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7008	NC_011149	CCT	2	6	2467141	2467146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7009	NC_011149	TCT	2	6	2467204	2467209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7010	NC_011149	TGC	2	6	2467210	2467215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7011	NC_011149	GTC	2	6	2467300	2467305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7012	NC_011149	TGA	2	6	2468318	2468323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7013	NC_011149	TTA	2	6	2468361	2468366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7014	NC_011149	AAT	2	6	2468433	2468438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7015	NC_011149	ATG	2	6	2468454	2468459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7016	NC_011149	GCT	2	6	2468508	2468513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7017	NC_011149	TGT	2	6	2468516	2468521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7018	NC_011149	AAT	2	6	2473144	2473149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7019	NC_011149	GCA	2	6	2473197	2473202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7020	NC_011149	AAT	2	6	2473247	2473252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7021	NC_011149	CAC	2	6	2473261	2473266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7022	NC_011149	TTC	2	6	2473329	2473334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7023	NC_011149	CCT	2	6	2473377	2473382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7024	NC_011149	CTAT	2	8	2474853	2474860	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7025	NC_011149	AAT	2	6	2474884	2474889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7026	NC_011149	GAGT	2	8	2474914	2474921	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7027	NC_011149	CCT	2	6	2475298	2475303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7028	NC_011149	ATTTT	2	10	2475400	2475409	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7029	NC_011149	GCCT	2	8	2475566	2475573	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7030	NC_011149	ATG	2	6	2475641	2475646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7031	NC_011149	AAGT	2	8	2475693	2475700	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7032	NC_011149	GAT	2	6	2475729	2475734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7033	NC_011149	ATT	2	6	2475782	2475787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7034	NC_011149	CG	3	6	2475835	2475840	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7035	NC_011149	TGGCGT	2	12	2475873	2475884	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
7036	NC_011149	GC	3	6	2475952	2475957	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7037	NC_011149	GAA	2	6	2476027	2476032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7038	NC_011149	CT	3	6	2476062	2476067	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7039	NC_011149	GCT	2	6	2476077	2476082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7040	NC_011149	GAT	2	6	2476254	2476259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7041	NC_011149	CAA	2	6	2476278	2476283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7042	NC_011149	CG	3	6	2476307	2476312	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7043	NC_011149	GAT	2	6	2476335	2476340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7044	NC_011149	GC	3	6	2476370	2476375	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7045	NC_011149	A	7	7	2476377	2476383	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7046	NC_011149	GTTTG	2	10	2476393	2476402	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
7047	NC_011149	TTC	2	6	2476447	2476452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7048	NC_011149	CCA	3	9	2476469	2476477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7049	NC_011149	GCC	2	6	2476510	2476515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7050	NC_011149	ATT	2	6	2476633	2476638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7051	NC_011149	GC	3	6	2476653	2476658	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7052	NC_011149	ATA	2	6	2476773	2476778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7053	NC_011149	T	6	6	2476837	2476842	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7054	NC_011149	AAT	2	6	2477037	2477042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7055	NC_011149	CT	3	6	2477070	2477075	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7056	NC_011149	GTAAGT	2	12	2477084	2477095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7057	NC_011149	GA	3	6	2477122	2477127	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7058	NC_011149	CATTT	2	10	2477154	2477163	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
7059	NC_011149	TGA	2	6	2477195	2477200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7060	NC_011149	TGG	2	6	2478547	2478552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7061	NC_011149	TTC	2	6	2478579	2478584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7062	NC_011149	T	6	6	2478608	2478613	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7063	NC_011149	CGA	2	6	2478616	2478621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7064	NC_011149	A	6	6	2478621	2478626	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7065	NC_011149	CAAA	2	8	2478675	2478682	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7066	NC_011149	ATT	2	6	2478687	2478692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7067	NC_011149	AAC	2	6	2478693	2478698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7068	NC_011149	CGA	2	6	2478733	2478738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7069	NC_011149	AAT	2	6	2478767	2478772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7070	NC_011149	AAAT	2	8	2478949	2478956	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7071	NC_011149	TGA	2	6	2478988	2478993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7072	NC_011149	AAT	2	6	2479040	2479045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7073	NC_011149	A	7	7	2479084	2479090	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7074	NC_011149	TGA	2	6	2479139	2479144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7075	NC_011149	AC	3	6	2479171	2479176	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7076	NC_011149	GCC	2	6	2479203	2479208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7077	NC_011149	AAC	3	9	2480244	2480252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7078	NC_011149	TCA	2	6	2480287	2480292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7079	NC_011149	GCA	2	6	2480323	2480328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7080	NC_011149	ACG	2	6	2483356	2483361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7081	NC_011149	TATT	2	8	2483443	2483450	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7082	NC_011149	A	6	6	2484472	2484477	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7083	NC_011149	GA	3	6	2484574	2484579	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7084	NC_011149	CCT	2	6	2484912	2484917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7085	NC_011149	GAC	2	6	2486337	2486342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7086	NC_011149	TTTTCA	2	12	2486395	2486406	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7087	NC_011149	CAGTA	2	10	2486411	2486420	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
7088	NC_011149	TTA	2	6	2486465	2486470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7089	NC_011149	GT	4	8	2486473	2486480	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7090	NC_011149	T	7	7	2487796	2487802	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7091	NC_011149	CAT	2	6	2490014	2490019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7092	NC_011149	TA	3	6	2490020	2490025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7093	NC_011149	AAT	2	6	2490035	2490040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7094	NC_011149	AGC	2	6	2490093	2490098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7095	NC_011149	CAAA	2	8	2490101	2490108	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7096	NC_011149	TGG	2	6	2490190	2490195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7097	NC_011149	CATGC	2	10	2490227	2490236	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
7098	NC_011149	TGG	2	6	2490308	2490313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7099	NC_011149	CATGC	2	10	2490345	2490354	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
7100	NC_011149	CAT	2	6	2490415	2490420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7101	NC_011149	AGT	2	6	2490520	2490525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7102	NC_011149	ATA	2	6	2491365	2491370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7103	NC_011149	CTGCC	2	10	2491383	2491392	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
7104	NC_011149	ACG	2	6	2493012	2493017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7105	NC_011149	AACA	2	8	2493018	2493025	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7106	NC_011149	CA	3	6	2493079	2493084	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7107	NC_011149	AGG	2	6	2493126	2493131	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7108	NC_011149	CGG	2	6	2493136	2493141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7109	NC_011149	TCA	2	6	2493152	2493157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7110	NC_011149	ACT	2	6	2493165	2493170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7111	NC_011149	CCG	2	6	2493182	2493187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7112	NC_011149	AGG	2	6	2493247	2493252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7113	NC_011149	CGG	2	6	2493257	2493262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7114	NC_011149	TCA	2	6	2493273	2493278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7115	NC_011149	CAC	2	6	2493281	2493286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7116	NC_011149	AGG	2	6	2493364	2493369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7117	NC_011149	CGG	2	6	2493374	2493379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7118	NC_011149	TCA	2	6	2493390	2493395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7119	NC_011149	CAC	2	6	2493398	2493403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7120	NC_011149	CCA	2	6	2493477	2493482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7121	NC_011149	A	6	6	2493487	2493492	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7122	NC_011149	T	6	6	2493508	2493513	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7123	NC_011149	GCA	2	6	2493543	2493548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7124	NC_011149	TGCGC	2	10	2493567	2493576	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
7125	NC_011149	GAC	2	6	2493591	2493596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7126	NC_011149	GAC	2	6	2493642	2493647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7127	NC_011149	GAC	2	6	2493693	2493698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7128	NC_011149	TCA	2	6	2497129	2497134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7129	NC_011149	TTGC	2	8	2497203	2497210	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7130	NC_011149	TTAA	2	8	2497259	2497266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7131	NC_011149	TAA	2	6	2497272	2497277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7132	NC_011149	CA	3	6	2498103	2498108	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7133	NC_011149	AGAT	2	8	2498114	2498121	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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7158	NC_011149	A	6	6	2513932	2513937	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7264	NC_011149	CTGA	2	8	2560470	2560477	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7265	NC_011149	CCAG	2	8	2560505	2560512	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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7379	NC_011149	AT	3	6	2601531	2601536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7391	NC_011149	GCC	2	6	2601844	2601849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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7398	NC_011149	AAC	2	6	2602201	2602206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7403	NC_011149	AT	3	6	2611314	2611319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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